HMM Seed Alignment: TIGR00034

Download Alignment

>GP|40980|emb|CAA23510.1|V00261/5-36
DELRTARI..ESLV.TPAELALRYPVTPGVATHVTDSRRRIEKILNGEDKRLLVIIGPCSIHDLTAAMEYATRLQSLRNQ
YQSRLEIVMRTYFEKPRTVVGWKGLISDPDLNGSYRVNHGLELARKLLLQVNELGVPTATEFLDMVTGQFIADLISWGAI
GARTTESQIHR.EMASALSCPVGFKNGTDGNTRIAVDAIRAARASHMFLSPDKNGQMTIYQTSGNPYGHIIMRGGKK.PN
YHADDIAAACDTLHEFDLPEH....LVVDFSHGNCQKQHRRQLEVCEDICQQIRNGSTAIAGIMAESFLREGTQKI.SQP
LTYGQSITDPCLGWEDSERLVEKLASAVDTRF
>SP|P00886|AROG_ECOLI/1-352
DDLRIKEI..KELL.PPVALLEKFPATENAANTVAHARKAIHKILKGNDDRLLVVIGPCSIHDPVAAKEYATRLLALREE
LKDELEIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHMDNSFQINDGLRIARKLLLDINDSGLPAAGEFLDMITPQYLADLMSWGAI
GARTTESQVHR.ELASGLSCPVGFKNGTDGTIKVAIDAINAAGAPHCFLSVTKWGHSAIVNTSGNGDCHIILRGGKE.PN
YSAKHVAEVKEGLNKAGLPAQ....VMIDFSHANSSKQFKKQMDVCADVCQQIAGGEKAIIGVMVESHLVEGNQSL.GEP
LAYGKSITDACIGWEDTDALLRQLANAVKARR
>GP|145366|gb|AAA23491.1|M60890/1-64
DALNNVHITDEQVLMTPEQLKAAFPLSLQQEAQIADSRKSISDIIAGRDPRLLVVCGPCSIHDPETALEYARRFKALAAE
VSDSLYLVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHMDGSFDVEAGLQIARKLLLELVNMGLPLATEALDPNSPQYLGDLFSWSAI
GARTTESQTHR.EMASGLSMPVGFKNGTDGSLATAINAMRAAAQPHRFVGINQAGQVALLQTQGNPDGHVILRGGKA.PN
YSPADVAQCEKEMEQAGLRPS....LMVDCSHGNSNKDYRRQPAVAESVVAQIKDGNRSIIGLMIESNIHEGNQSSPRSE
MKYGVSVTDACISWEMTDALLREIHQDLNGQL
>GP|153880|gb|AAA27030.1/1-352
DALNNVRITDEQVLMTPEQLKAAFPLSLAQEAQIAQSRGIISDIIAGRDPRLLVVCGPCSIHDPETALEYARRFKALAAE
VSDSLYLVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHMDGSFDVEAGLKIARQLLVELVNMGLPLATEALDPNSPQYLGDLFSWSAI
GARTTESQTHR.EMASGLSMPVAFKNGTDGSLATAINAMRAAAQPHRFVGINQAGQVALLQTQGNPHGHVILRGGKA.PN
YSPADVAQCEKEMEQAGLRPS....LMVDCSHGNSNKDYRRQPAVAESVVAQIKDGNRSIIGLMIESNIHEGNQSSPRSE
MKYGVSVTDACISWEMTDALLREIHKDLSGQL
>GP|144965|gb|AAA23292.1/1-352
SNKRVVAF..HELP.SPTDLIAANPLTPKQASKVEQDRQDIADIFAGDDDRLVVVVGPCSVHDPEAAIDYANRLAPLAKR
LDQDLKIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHLNETYDIPEGLRIARKVLIDVVNLDLPVGCEFLEPNSPQYYADTVAWGAI
GARTTESQVHRRQLASGMSMPIGFKNGTDGNIQVAVDAVQAAQNPHFFFGTSDDGALSVVETAGNSNSHIILRGGTSGPN
HDAASVEAV...VEKLGENAR....LMIDASHANSGKDHIRQVEVVREIAEQISGGSEAVAGIMIESFLVGGAQNL.GEG
LVYGQSVTDKCIDIDTTIDLLAELATAVRERR
>SP|P44303|AROG_HAEIN/1-352
DDTRIEKV..DQVL.PPIALLEKYPASEQAAALVKQTRHEAHNIIHGKDDRLLVVIGPCSIHDPKAAIEYATRLKPLREK
YKDSLEIIMRVYFEKPRTTVGWKGLINEPYLNDTYRLNDGLRIARKLLSDINDLGVPAAGEFLDMITPQYLADFMSWGAI
GARTTESQVHR.ELASGLSCAVGFKNATNGGVKVALDAIGAAEAPHYFLSVTKFGHSAIVSTKGNEDCHIILRGGDKGPN
YSAEDVEKVCADIEKTGRIPH....VMVDFSHANSSKQYKKQMDVCQDVCNQIAFGSKQIFGVMVESHLVEGRQDL.GKA
QTYGQSITDACIGWEDSERLLQQLSDAVIARR
>GP|868026|gb|AAC43604.1/1-352
DELRTIRI..DPLI.TPSELAKKYAITSEIMDNVIITRQNIARIMTGEDLRLLVVIGPCSVHDPIAAVEYAHRLYELRKK
YQDRLEIIMRTYFEKPRTVVGWKGLISDPDLNGSFRVNHGLAVARKLLLDINELGCLQQQSFLDMVIGQFIADLISWGAI
GARTTESQIHR.EMASALSCPVGFKNGTDGNIRIAIDAIRAAQARHLFFAPNKDGQMTINHTSGNPYGHIIMRGGRT.PN
YHAHDINSAIEHLREFNLLEH....LMIDFSHGNCLKEHIRQKDVAKSVSKQISQGSKTIFGVMIESFLEEGFQTV.NQP
LIYGKSITDACLNWKDSVLIIKQLADAVDTRF
>SP|P32449|AROG_YEAST/1-352
EDVRILGY..DPLA.SPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDE
LKGDLSIIMRAYLEKPRTTVGWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAI
GARTTESQLHR.ELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMGVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTN
YDAKSVAEAKAQLPAGSNG......LMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGI.KAG
LKYGVSITDACIGWETTEDVLRKLAAAVRQRR
>SP|P14843|AROF_YEAST/1-352
EDWRIKGY..DPLT.PPDLLQHEFPISAKGEENIIKARDSVCDILNGKDDRLVIVIGPCSLHDPKAAYDYADRLAKISEK
LSKDLLIIMRAYLEKPRTTVGWKGLINDPDMNNSFQINKGLRISREMFIKLVEK.LPIAGEMLDTISPQFLSDCFSLGAI
GARTTESQLHR.ELASGLSFPIGFKNGTDGGLQVAIDAMRAAAHEHYFLSVTKPGVTAIVGTEGNKDTFLILRGGKNGTN
FDKESVQNTKKQLEKAGLTDDSQKRIMIDCSHGNSNKDFKNQPKVAKCIYDQLTEGENSLCGVMIESNINEGRQDIGREG
LKYGCSVTDACIGWESTEQVLELLAEGVRNRR