HMM Seed Alignment: TIGR00057

Download Alignment

>SP|P45103|YCIO_HAEIN/7-207
IHPENPQAR..LINQAVEILQKGGVIVYPTDSGYALGCMMGDKHAMDRIVAIRKLPEGHNFTLVCSDLSELSTYAR.VNN
TAYRLIKNNTPGRYTFILTATK..ELPRRLMT.SKRKTIGLRVPDNKIALDLLSALGEPILSCSLMLPNEEHTTQSDPEE
IRDRLEHQVDLIIHGG....YLGQEPTTVVDLTEES.PVILREGSG...STAPFI.
>OMNI|NTL01EC01238/19-218
IHPDNPQQR..LINQAVEIVRKGGVIVYPTDSGYALGCKIEDKNAMERICRIRQLPDGHNFTLMCRDLSELSTYSF.VDN
VAFRLMKNNTPGNYTFILKGTK..EVPRRLLQ.EKRKTIGMRVPSNPIAQALLEALGEPMLSTSLMLPGSEFTE.SDPEE
IKDRLEKQVDLIIHGG....YLGQKPTTVIDLTDDT.PVVVREGVG...DVKPFL.
>OMNI|NTL01SS00154/7-210
LHPETPQQR..TVEMICKSLRQGAIMLYPTDTVYAIGCDLNDKNAVQRVRQLKQLSNNKPLTFLCSSLSNIAEYAV.VAD
DAYRLMRKLIPGPYTFLLPATK..QVPKLVVE.PKRKTTGIRVPDRPICQEILQSLGNPIISTSAHLPDQDEFVMAEKAK
LFDLFDKLVDIIIDDDR...EPGYQTSSIIDFTDKE.PKVVREGLGW.ETLRDLF.
>OMNI|NTL01MT01655/6-202
ITRKNPSPD..VLEEAISVMEGGGIVIYPTDTIYGLGVNALDEDAVRRLFRVKGRSPHKPVSICVSCVDEIPRFSR.PSG
DAMELMERILPGPYTVVLERNE..LIPDVITGGSSR..VGIRVPDDEICRRIAARF..PVTATSANISGKPPSP..RLEE
IVRDLD.AVDLVLDAGD...CLDMEPSTVIDLTVNP.PRVLRRGKG...PLDPVLL
>SP|Q60369|Y062_METJA/10-206
IYELNEEERKKVLEFLKKEILNGKIVICGTDTLYGISANALNEKAVRKVYNIKRREFNKPLSICVRDKNEIEKYAY.VND
LAKKIIDKFLPGPLTIILKKKP..GIPDIVAK....DYIGIRIPDEPIIRELSIVP...LTTTSANISGKESPT..TVDE
IDKEVLKKVDYVIDIGK...CKYSKPSTIIKIEDDK.IISIREGVI...PIQKLAR
>OMNI|AF0781/2-201
AEVLEPSRE..GIRKAVAVLRAGGIVAFPTETVYGMGCDATNEEALRRLYEIKGRSLNKPFIVGVWSRDYVGKIAE.VDE
RAEKLMEAFFPGPLTLVLKSKG..VMPSLLSP...KGKIAVRMPAHEVPLQLMEMLRKPIVVPSANLSGRPSLM..RWEH
VVEELGSRIDAVVKGE....CKVGVESTIVDLTETP.AKVLRVGAVS.VESIKKHV
>OMNI|NTL01AA00460/1-195
.MILKASKE..ALKEAVEILKKGGIIVAPTDTLYGILADATNEEAVKRLYKIR.RPSGKPFLVLLPDESWLEKLCLDVKE
EHKKLLK..VEG.LTLVFRKTC..DKLDYVSK....GTLAVRLPQKGFIRDLLSELKKPVVAPSVNPEGKKPAE..SVEE
AYNYFGNKVDLYIDAG....VIKGEPSTILDLTEG..VKILREGKVKKEEIEKILN
>SP|P45831|YD01_MYCLE/8-212
FDCADPDQRARGIASAVAALKGGRLVVMPTDTVYGIGADAFDRAAVAALLSAKGRGRDMPVGVLVGSWHTIEGLVYTMPD
GARELIRAFWPGALSLVVVHAP..SLNWDLGD..AHGTVMLRMPLHSVAIELLCEVG.PMAVSSANVSGQPAAV..DVDG
ARGQLGELVGVYLDAGP...SAQQAASTIVDLTEAT.PRILRAGPVSVARIAEVLG
>SP|P39153|YWLC_BACSU/10-215
VTDELSTNDP.QIAQAAALLRENEVVAFPTETVYGLGANAKNTDAVKKIYEAKGRPSDNPLIVHIADISQLEDLTGPAPE
KAKTLMKRFWPGALTLILPCKPDALSPRVTAG...LETVAIRMPDHPLALALIRESGLPIAAPSANLSGKPSPT..KAEH
VAHDLDGRIAGIVDGGP...TGIGVESTVLSCADDI.PVLLRPGGITKEQIEAVIG
>OMNI|BB0734/2-209
ISTEIISSS..QIQKAAKLIKMGELVVFPTETVYGIGANAYNEDAVKMIFLVKKRPINNPLIVHVDTVKKIKELSEYIPK
SALMLIKKFSPGPLTYVLKKSI..KISRFVSG..NLDTVAIRIPANKTALSLIKASKVPIVAPSANISKRPSST..NFEM
ALKELNGLVRGIIKPEENKDFNIGIESTVVGFDLKDNVLILRPGAITKKMIENELQ