HMM Seed Alignment: TIGR00064

Download Alignment

>SP|P10121|FTSY_ECOLI/222-493
KIDDDLFEELEEQLLIADVGVETTRKIITNLTEGASRKQLRDAEALYGLLKEEMGEILAK..........VDEPLNVEGK
APFVILMVGVNGVGKTTTIGKLARQFEQQGKSVMLAAGDTFRAAAVEQLQVWGQ.RNN..IPVIAQHTG.ADSASVIFDA
IQAAKARNIDVLIADTAGRLQNKSHLMEELKKIVRVM.KKLDV.EAPHEVMLTIDASTGQNAVSQAKLFHEAVGLTGITL
TKLDGTAKGGVIFSVADQFGIPIRYIGVGERIEDLRPFKADDFIEALF
>SP|P44870|FTSY_HAEIN/137-409
KIDDELFEELEEQLLIADIGVPTTSKIIKNLTEHASRKELQDAELLYQQLKVEMADILEP.........VAQPLEIDSTK
KPYVILMVGVNGVGKTTTIGKLARKFQAEGKSVMLAAGDTFRAAAVEQLQVWGE.RNH..IPVVAQSTG.SDSASVIFDA
MQSAAARNIDILIADTAGRLQNKNNLMDELKKIVRVM.KKYDE.TAPHEIMLTLDAGTGQNAISQAKLFNEAVGLTGISL
TKLDGTAKGGVIFAIADQFKLPIRYIGVGEKIEDLREFNAKEFIEALF
>SP|P73930|FTSY_SYNY3/226-502
PLNEAAVEEIEAILLQADVGVEATDYIITTLQDKLREEALPPEQAI.EFLKEILRSILDR.....PLLSLPSAEFAPEAE
GLNVWLLTGVNGAGKTTTIGKLAFMAKQSGYDCVIAAADTFRAAAVEQVKVWGE.RSG..VPVIANPGQNTDPAAVVYDG
ISAAQSRNVNLLLVDTAGRLQNKKNLMDELAKIRRII.DKKAP.NATVESLLVLDATLGQNGLRQAEVFAEAAKLSGVVL
TKLDGSAKGGVALAVAQQLNLPIRFIGAGEGIEDLRPFSSYEFVEALL
>SP|Q57739|Y291_METJA/121-396
EDIEDVLEELEIALLEADVALEVVEKLIENIKNELVGRKISPDDNVEEITINAVKNAIKNILSQEKIDIEEIIKKNKAEG
KPTVIVFVGINGTGKTTTIAKLAYKLKQKGYSVVLAAGDTFRAGAIEQLEQHAK.NVG..VKVIKHKPG.ADSAAVIYDA
IQHAKARGIDVVLADTAGRQATNVNLMEEIKKVVRVT.K.......PDLVIFVGDALTGNDAVYQAEEFNRAVNIDGIIL
TKVDADAKGGAALSIGYAIGKPILYLGVGQRYQDLIEFDADWMVRKLF
>SP|P47539|FTSY_MYCGE/62-336
NVDEQFKENLFEGLVLLDVGYHAANKICDAIIEQIKLNRITDFQLIKELIIDQIIVYYIQDKLFDTDLIV.......KPN
FTNVYLFVGVNGVGKTTTLAKIADFFIKQNKRVLLVAGDTFRAGAIEQLNQWAK.LLN..CDIVLPNPK.EQTPAVIFRG
VKKGIDDKYDFVLCDTSGRLQNKLNLMNELQKIYQII.QKVSG.SEPSETLLVLDGTVGQTGLSQAKVFNEFSKLTGIVL
TKMDGSAKGGIILAIKDMFNLPVKLIGFGEKTSDLAIFDLEKYVLGLL
>OMNI|NTL01BS1595/46-320
KVDEDFFEELEEVLISADVGFTTVMELIDELKKEVKRRNIQDPKEVQSVISEKLVEIYNSGDEQISELNI.......QDG
RLNVILLVGVNGVGKTTTIGKLAHKMKQEGKSVVLAAGDTFRAGAIEQLEVWGE.RTG..VPVIKQTAG.SDPAAVIYDA
VHAAKARNADVLICDTAGRLQNKVNLMKELEKVKRVI.EREVP.EAPHEVLLALDATTGQNAMAQAKEFSKATNVTGIAL
TKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKLVGLGEKVDDLQEFDPESYVYGLF
>SP|P75362|FTSY_MYCPN/62-336
TVNEQFQESLFEELVLLDIGYHAATKICDAIVQELKLQRVSDPQLIQEIIVDKLIVYYIQDKLFETDLTV.......EAN
KTNVYLFVGVNGVGKTTSLAKLADQLTKQNKRVLMVAGDTFRAGAVAQLAEWAQ.RIG..CDIVLPNPK.EETPAVIFRG
VQQGIQNEYDFVLCDTSGRLQNKTNLMNELKKIYQIV.QKVSS.AKPQETLLVLDGTTGQSGLAQAKVFNEFTELTGIIL
TKMDSSSKGGIILAIKDLFNLPVKLIGFGETTADLAAFDLEQYVLGLT
>GP:2580590/149-420
QIDEDLYEELETVLITSDMDMEATEYLMKDVRDRVSLKGLKDGNELRGALKEALYDLIKP.........LEKPLVLPETK
EPFVIMLAGINGAGKTTSIGKLAKYFQAQGKSVLLAAGDTFRAAAREQLQAWGE.RNN..VTVISQTTG..DSAAVCFDA
VQAAKARGIDIVLADTAGRLPTQLHLMEEIKKVKRVL.QKAMP.DAPHEIIVVLDANIGQNAVNQVKAFDDALGLTGLIV
TKLDGTAKGGILAALASDRPVPVRYIGVGEGIDDLRPFDARAFVDALL
>SP|O67066|FTSY_AQUAE/189-460
KVDEEFFEELEEMLVKADVGVKTAVELTEKLRKEAIRKNIKEGEKIKELLKKELKELLKN..........CQGELKIPEK
VGAVLLFVGVNGSGKTTTIGKLAHQLKQKGKKVLLVAGDTFRAAAIEQLEVWAK.RAG..VDIVKKEEG.SDPGAVVYEG
MKKAKEEGYEVVLVDTAGRLHTKEPLINELRKIKKVI.QKFDK.EEPSETLLVIDATTGQNAIQQAKVFKEAVDITGIVV
TKLDGSAKGGAVVAICRELKIPIKLVGVGEGIDDLQPFDADAYVEALL
>GP|2130562|gb|AAB58327.1/52-326
KDVDEAIGELELELLEADVALEVVDELREKIKGKLVGKKVRIGSDKGKIIEEAVKEAVLEVLTPPRRIDLIEEMR.KKEE
KPFVIAFVGFNGGGKTTTIAKLAHWLKKQGFSVVVAASDTFRAGAIEQLEEHAK.RVG..VKVIKHSYG.ADPAAVAYDA
IQHAKARGIDVVLIDTAGRNELNRNLMDEMKKIVRVT.K.......PDLVIFVGDSLAGNSIIEQARQFNEAVRIDGVIL
TKLDADARGGAALSISHAIGAPILFVGVGQGYDDLKPFDERWFVDLIF
>SP|O32861|FTSY_MYCHO/71-346
KIDEEFFEDLEEMLIMSDISIKLVQIIINECKKEVRNENITDPKLINEIIADKLFTIYTSNSVVDTTLNI.......KDN
RLNVILVVGVNGSGKTTSISKIAKKLIDEGKKVLIAAGDTFRAAAVEQLEIWAK.RVG..ADIVTPNENEVDPAAVVYRA
IDIAKSKKYDILIVDTAGRLQNKVNLMNELAKINRVL.ASKIP.DAPHESLLVLDATTGQNGVIQARVFKESTPLTGIIL
TKMDGTSKGGIVLTIKDEIGLFVKYIGLGEKVDDLAEFDLDSYIYGLT
>OMNI|NTL01MT01572/86-357
KDVDDVLWDLEMALLESDVALEVAEKITTELKEELVGRKVKRSTEISEYTMEALKKAVKDVLSVDGVD....LPQLVEKK
KPLVIMFVGINGTGKTTTIAKVARYFMKKGLEPVIAAADTFRAGAIEQIGQHAD.KLG..VKLISHRKG.ADPAAVAFDA
VSHAKAQGKDVVLIDTAGRMQTNVNLMDEMAKIKRVV.R.......PDLIVFVGDALTGNDAIEQAARFDEAVGIDAVIL
TKADADARGGAALSIGYMIKRPIIFMGIGQGYDDIMEFKPEWMVEQLF
>OMNI|AF2062/64-339
KKVEGILEELEEILLESDVAFEVVDAISEALKSRLVGRRKKLTEKLSDIVMEELRSIIFEILDENRFDFDEFIKEKLKEK
KPVVIAFVGVNGTGKTTTIAKVANRLIKQGYSVVLAAGDTFRAGAIEQLEEHAK.RLG..VKLIKHKHG.SDPAAVIYDA
IKHAESKGIDVVLADTAGRMHTKKNLLDQLEKIKRVT.K.......PDLIIFVDESIAGNDAVERARMFAETVGIDGSIL
TKLDADPKGGSAISISYVTKKPVLFFGVGQEYDDLVKFDSKWLVERIF
>GP|1217621|emb|CAA65233.1/99-373
DDIDDIIEELRTELLESDVSLEVTDKILEDLKSSLIGKKVNRSEDLDELVKKSLKNSIMEILEKNRFERN.LIEEIKRSP
KPYVIMFFGVNGVGKTTTIAKVAYMLKKAGLKVIVSASDTFRAAAQEQLAIHCQ.KLE..IPLVKGKYG.GDPASVAFDA
IQAAKSRGIDVVLIDTAGRMHVDKDLTEELKRIVRIS.K.......PNLKLLVIDALAGNDALEQAKYFENVVDYDGVIL
TKVDADAKGGVVLSLAYELKKPVIFLGTGQNYDDLIPFSVDWFIERIF
>SP|P27414|DOCK_SULAC/93-367
DDLNDVIEELRFQLLDSDVSYEVTEKILEDLKNNLIGKKVSRREEVEEIVINTLKKSITEILTKNQKTD.LIEKIRSSGK
KPFVIIFFGVNGVGKTTTIAKVVNMLKKNNLSTIIAASDTFRAAAQEQLAYHAS.KLE..VQLIRGKYG.ADPASVAFDA
ISFAKSRNIDVVLIDTAGRMHIDSDLVEELKRVLRIA.K.......PDFRILILDSLAGSDALEQARHFENNVGYDAVIL
TKVDADAKGGIALSLAYELKKPVVYMGVGQNYDDLIPFSPDWFVERIF
>SP|Q10969|FTSY_MYCTU/149-421
DLDEDSWQDVEDTLLVADLGPAATASVVSQLRSRLASGNVRTEADARAVLRDVLINELQPGMDRSI.......RALPHAG
HPSVLLVVGVNGTGKTTTVGKLARVLVADGRRVVLGAADTFRAAAADQLQTWAA.RVG..AAVVRGPEG.ADPASVAFDA
VDKGIAAGADVVLIDTAGRLHTKVGLMDELDKVKRVV.TRRASV...DEVLLVLDATIGQNGLAQARVFAEVVDISGAVL
TKLDGTAKGGIVFRVQQELGVPVKLVGLGEGPDDLAPFEPAAFVDALL
>GP|1929401|emb|CAA71224.1/123-401
QADDEFFEELEDVLIQTDMGMKMVLKVSNLVRKKTKRDTSFENIKDALVESLYQAYTDNDWTNKKYRIDF.......KEN
RLNIFMLVGVNGTGKTTSLAKMANYYAELGYKVLIAAADTFSAGATQQLEEWIKTRLNNKVDLVKANKLNADPASVVFDA
IKKAKEQNYDLLLIDTAGRLQNKTNLMAELEKMNKII.QQVEK.SAPHEVLLVIDATTGQNGVIQAEEFSKVADVSGIIL
TKMDSTSKGGIGLAIKELLNIPIKMIGVGEKVDDLLAFDIDQYIVHLS
>SP|O33010|FTSY_MYCLE/157-429
DLDEDSWQELEDTLLVADLGPVATESVMSALRSRLLNSNVHTESDARTMLRDVLISELQPDMDRSI.......RALPHAD
HPAVLLIVGVNGTGKTTTVGKLARVLVADGRRVVLGAADTFRAAAADQLQTWAS.RVG..AELVRGVEG.ADPASVAFDA
VDKGIGAGADVVVIDTAGRLHTKVGLMDELDKIKRVV.TRRAAV...DEVLLVLDATIGQNGLTQVRVFAEVVDITGAVL
TKLDGTAKGGIVFRIQRELGVPVKLVGLGEGPDDLAPFEPAVFVDALL
>SP|O05948|FTSY_RICPR/31-301
KLDKETLNELEELLISSDISISVVTHIIEEFKNVKFDKTIDSDTVK.EAIAKLIEQQLSKSEIPFTL..........SEN
KLNIILVCGVNGVGKTTTIGKLSALYSAEGKKVAVAACDTFRAAAINQLSSWVH.RAN..ALLITGKAS.ADPASVAYRA
IEESIKQNIDILFIDTAGRLHNNKNLMDELSKIVKVI.KKLDE.NAPTHSILIIDAITGQNTYNQIEYFNDVTNLTGLIV
TKLDGSAKAGVLVGAVQKFNLPVYFIGIGEKIEDLKIFNRHDFSRSLV
>SP|O25458|FTSY_HELPY/21-286
KRQSVPKEELEEILIGFDIQYDLIESLLKHLGDLITPKQLEVALLRFVRGDSYYDKTRLKTI................TT
KPLVHLIVGVNGAGKTTTIAKLAKLSLKQHKKALLGAGDTFRAAAVKQLQLWGE.KLN..IQVISAKEG.SDPSSLAYNT
IESAIAKNIDEVFIDTAGRLHNQTNLKNELSKIARTC.SKVLK.DAPFYKFLILDGTQGSSGLTQAKIFHETLALDGVIM
TKLDGTSKGGAILSVLYELKLPILYLGMGEKEDDLIAFDEERFIEDLV
>OMNI|BB0076/14-281
KQQENVIENLEDILLESDINNEIVIEIINKLTKEKNENEKTIIGKLKELLSSYINTKKFTL................ENN
KLNILLIVGINGIGKTSSIAKLANKLKNEGKNILISAADTFRAAAIEQMKIYGE.QIG..VRIISQNQG.SDPSAVIFDS
ISSAKLKNYDALIIDTAGRLQNKENLIKELQKINNVILKQIKNTDINYQKILVIDSTIGKNANSQAEIFNKAIEIDGIII
TKLDSSSKAGTILNISKILEKPIYFTTFGEKLEDIKEFDINEYFNKLL