HMM Seed Alignment: TIGR00247

Download Alignment

>SP|P28306|YCEG_ECOLI/1-340
......MKKVL....LIILLLLVVLGIAAGVGVWKVRHLADSKLLIKEETIFTLKPGTGRLALGEQLYADKIINRPRVFQ
WLLRIEPDLSHFKAGTYRFTPQMTVREMLKLLESGKE.AQFPLRLVEGMRLSDYLKQLREAP.....YIKHTLSDD....
.....KYATVAQALELENPEW.IEGWFWPDTWMYTANTTDVALLKRAHKKMVKAVDSAWEGRADGLPYKDKNQLVTMASI
IEKETAVASERDKVASVFINRLRIGMRLQTDPTVIYGMGERYNGKLSRA....DLETPTAYNTYTITGLPPGAIATPGAD
SLKAAAHPAKTPYLYFVADGK..GGHTFNTNLASHNKSVQDYLKVLK.EKNAQ
>SP|P44720|YCEG_HAEIN/1-347
......MKKFL....IAILLLILILAGVASFSYYKMTEFVKTPVNVQADELLTIERGTTSSKLATLFEQEKLIADGKLLP
YLLKLKPELNKIKAGTYSLENVKTVQDLLDLLNSGKE.VQFNVKWIEGKTFKDWRKDLENAP.....HLVQTLKDKSNEE
IFALLDLPDIGQNLELKN....VEGWLYPDTYNYTPKSTDLELLKRSAERMKKALNKAWNERDEDLPLANPYEMLILASI
VEKETGIANERAKVASVFINRLKAKMKLQTDPTVIYGMGENYNGNIRKK....DLETKTPYNTYVIDGLPPTPIAMPSES
SLQAVANPEKTDFYYFVADGS..GGHKFTRNLNEHNKAVQEYLRWYRSQKNAK
>OMNI|NTL01BS2730/1-360
MYINQQKKSFFNKKRIILSSIVVLFLIIGGAFLYGKSLLEPVEKDSKTTVNINIPSGSSVSAIASILKKNDVIKSEKAFQ
YYVKYKGASG.FQAGFYHLNKGMDLDAIIQKLTSGATGYAFQITVTEGAQLTQIAAAIADETKYSKKQVIAKLDDETFIN
QLKKEFPDTVTNDVFNKNIKHPLEGYLFPATYPFNDPDTSLEDIIKAMIKQTNSYVETYKSEMKKNKVS.VHKLLTMASL
IEEEATEKADRHKIASVFYNRLKKKMPLQTDPTVLYAAGKHKDRVLYK.....DLEIDSPYNTYKNTGLTPGPIANAGMS
SWEAALHPDKTDYLYFLAKSN..GEVVFTKTLKEHNKAKEKYISSKN.EK...
>OMNI|BB0709/1-343
.........VL....IKIGKVFILFFFLGSILSIFIYFLNLSSLANGLVYEFNIEKGWGVKKIAKELKKQKLIKSELLLV
FISYILGSDKQFKEGKYLINGDLSTFEIYKEFLKGSSNVNIDVTIPEGYTSRRIALKLKEFS......VIDDVQDFLFLI
N....KKSFIYELGLDYDS...LEGFLFPDTYKFYKG.IEIKNVVRMFVDNFLNKLKSIGVVLSDYSSKELYNRVIIASI
VEREYRVKSEAPIMSSVFYNRIKSGMALQSCATIEYVITEELGRSHPKRIYFSDLEIDSPYNTYINKGYPPTPISNAGII
SLQAAFFPKNTQYLFFVVKDSKLGTHQFSSEYSSHLLGAKDYIKNFITKD...