HMM Seed Alignment: TIGR00254

Download Alignment

>OMNI|NTL01SS01182/797-964
LENQSIRDPLTGLFNRRYLEQFFLQEIGRAKRYNHSIGVIMGDIDHFKQFNDQLGHDAGDHVLKTIGRILQSNI.RGSDI
ACRYGGEEMTIVLPQTSLEDTLVKAESLRQAIASMEVEYK.GKELGTLTVSLGVACYPN.HGETMVNIIQAADRALYQAK
AAGRNRVVMAD
>GP|1119215|gb|AAA87378.1/286-453
LE.LAVTDQLTGLHNRRYMTGQLDSLVKRATLGGDPVSALLIDIDFFKKINDTFGHDIGDEVLREFALRLASNV.RAIDL
PCRYGGEEFVVIMPDTALADALRIAERIRMHVSGSPFTVAHGREMLNVTISIGVSATAG.EGDTPEALLKRADEGVYQAK
ASGRNAVVGKA
>OMNI|NTL01AA00024/260-426
YERMALTDPLTGLYNRRVFTEMAEKELAKAKRYGYNFSILMIDIDNFKKINDTYGHDVGDLVLKKISEILKRNV.RGADL
VARFGGEEFIVMLSNTNLNGAVKKAEQLRRMIEQTPIELP.NGEKLRVTVSIGVSTYRG.H.ESLEELIKEADQALYEAK
RKGKNRVEVFR
>OMNI|NTL01SS02753/702-872
LERLTQIDGLTGVYNRRFFDQALEREWQIAFRETESLTLVMLDIDYFKLYNDTLGHQAGDHCLRIVAAILQESVHRTSDL
VARYGGEEFALILPRTDLSGAVIVAQRIKTLMDAKAISHPTSEIANYVTVSIGIHCAVPRPGLSLASWVKCADDALYQAK
KRGRNGYFVLE
>OMNI|NTL01AA00262/433-600
IEFYAMRDPLTFLYNQRTFWELLNYELERANRFERSLSLLLLDLDNFKVINDTYGHAVGDRVLREVARIISEKK.RKADV
AARYGGDEFAVIVIGANSNQALNLARRLKDAIESLSIPVS.ESETVSPRVSIGIASYPE.HALTSRDLFIIADSMLRKAK
EEGRSKIRVPT
>SP|P21830|YAIC_ECOLI/206-371
LQVMSTRDGMTGVYNRRHWETMLRNEFDNCRRHNRDATLLIIDIDHFKSINDTWGHDVGDEAIVALTRQLQITL.RGSDV
IGRFGGDEFAVIMSGTPAESAITAMLRVHEGLNTLRLPNT...PQVTLRISVGVAPLNP.QMSHYREWLKSADLALYKAK
KAGRNRTEVAA
>OMNI|NTL01EC01920/399-567
LQWQAWHDTLTRLYNRGALFEKARPLAKLCQTHQHPFSVIQVDLDHFKAINDRFGHQAGDRVLSHAAGLISSSL.RAQDV
AGRVGGEEFCVILPGASLTEAAEVAERIRLKLNEKEMLIA.KSTTIRISASLGVSSSEETGDYDFEQLQSLADRRLYLAK
QAGRNRVFASD
>OMNI|NTL01AA00314/85-245
LEKRTYIDSLTGVYNRKFLEEIFKLEKEKYRTFRKEFCIIFIDLDNFKEVNDRYGHMEGDKVLKRVAELIKKSV.RKEDY
VIRYGGDEFVIIT.EAPRGDVLSIMSRLQDVIKIKYKEVE.......VTASIGSACFPN.DGKELEELIKKADERMYRIK
KMKNELLKLNK
>OMNI|NTL01ML1424/389-556
LAHQAAHDTLTGLPNRTSILARIDEQRYCGAPDQLLTAVLFIDLDNFKGINDSLGHDVGDVVLQTAAQRLRAGL.RSRDV
VGRFGGDEFVALILGKITHTELSKVVDRMHAALSEPTYVA..DAVLHLRASIGVVAIKGDDPRNIGQILRDADTAMYRAK
LSGEGTSYYTD