HMM Seed Alignment: TIGR00390

Download Alignment

>SP|P39778|HSLU_BACSU/6-467
LTPRQIVDRLDQYIVGQQNAKKAVAVALRNRYRRSLLDEKLKDEVVPKNILMMGPTGVGKTEIARRIAKLSGAPFIKIEA
TKFTEVGYVGRDVESMVRDLVETSVRLIKEEKMNEVKEQAEENANKRIVRLLVPGKKKQSGVKNPFEMFFGGSQPNGEDE
AESQEEANIEEKRKRMAHQLALGELEDYYVTVEVEEQQP.SMFDMLQGSGMEQMGMNMQDALSGLMPKKKKRRKMTVREA
RKVLTNEEASKLIDMDEVGQEAVQRAEESGIIFIDEIDKIAKNGGASSSADVSREGVQRDILPIVEGSTVVTKYGSVKTD
HVLFIAAGAFHMAKPSDLIPELQGRFPIRVELNKLTVDDFVRILVEPDNALLKQYQALLQTEGISLEFSDEAIHKIAEVA
YHVNQDTDNIGARRLHTILERLLEDLSFEAPDVTMEKITITPQYVEEKLGTIAKNKDLSQFIL
>SP|P32168|HSLU_ECOLI/4-443
MTPREIVSELDKHIIGQDNAKRSVAIALRNRWRRMQLNEELRHEVTPKNILMIGPTGVGKTEIARRLAKLANAPFIKVEA
TKFTEVGYVGKEVDSIIRDLTDAAVKMVRVQAIEKNRYRAEELAEERILDVLIPPAKNN..........WGQTE..QQQE
PSAARQAFRKKLRE........GQLDDKEIEIDLAAAP..MGVEIMAPPGMEEMTSQLQSMFQNLGGQKQKARKLKIKDA
MKLLIEEEAAKLVNPEELKQDAIDAVEQHGIVFIDEIDKICKRG.ESSGPDVSREGVQRDLLPLVEGCTVSTKHGMVKTD
HILFIASGAFQIAKPSDLIPELQGRLPIRVELQALTTSDFERILTEPNASITVQYKALMATEGVNIEFTDSGIKRIAEAA
WQVNESTENIGARRLHTVLERLMEEISYDASDLSGQNITIDADYVSKHLDALVADEDLSRFIL
>SP|P43773|HSLU_HAEIN/4-444
MTPREIVSELDQHIIGQADAKRAVAIALRNRWRRMQLQEPLRHEVTPKNILMIGPTGVGKTEIARRLAKLANAPFIKVEA
TKFTEVGYVGKEVDSIIRDLTDSAMKLVRQQEIAKNRARAEDVAEERILDALLPPAKNQ..........WGEVE..NHDS
HSSTRQAFRKKLRE........GQLDDKEIEIDVSAGVS.MGVEIMAPPGMEEMTNQLQSLFQNLGSDKTKKRKMKIKDA
LKALIDDEAAKLINPEELKQKAIDAVEQNGIVFIDEIDKICKKG.EYSGADVSREGVQRDLLPLVEGSTVSTKHGMVKTD
HILFIASGAFQVARPSDLIPELQGRLPIRVELTALSAADFERILTEPHASLTEQYKALMATEGVNIAFTTDAVKKIAEAA
FRVNEKTENIGARRLHTVMERLMDKISFSASDMNGQTVNIDAAYVADALGEVVENEDLSRFIL
>SP|O25254|HSLU_HELPY/6-443
MTPREIVAYLDEYIIGQKEAKKSIAIAFRNRYRRLQLEKSLQEEITPKNILMIGSTGVGKTEIARRIAKIMELPFVKVEA
SKYTEVGFVGRDVESMVRDLVNNSVLLVENEHKEKLKDKIEEAVIEKIAKKLLPPLPNG...........VSEE..KKQE
YANSLLKMQQRIAQ........GELDSREIEIEVRKKS..IEIDSNVPPEILRVQENLIKVFHKE..QDKVKKTLSVKEA
KEALKAEISDTLLDSEAIKMEGLKRAESSGVIFIDEIDKIAVSSKEGSRQDPSKEGVQRDLLPIVEGSVVNTKYGSIKTE
HILFIAAGAFHLSKPSDLIPELQGRFPLRVELENLTEEIMYMILTQTKTSIIKQYQALLKVEGVEIAFEDDAIKELAKLS
YNANQKSEDIGARRLHTTIEKVLEDISFEAEDYSGQNVTITKELVQSKLEDLVADENLVKYIL
>OMNI|BB0295/16-455
IVPKDVVAELDKYIIGQDEAKKLVSIALVNRYIRSRLPKEIKDEVMPKNIIMIGSTGIGKTEIARRLSKLIKAPFIKVEA
TKYTEVGYVGRDVESMVRDLMSIAVNMVKEEMYSTVRDDALVRTEERIVDSLFKGSSNS...........ENMDPNEIKA
EEKVKEKLRKKLRA........GELDDTTIEIQISSKMPFSTIEIFTGGNFEEIDMGIGGLLGNIF.DRKKKRELKIKKA
KEIILAEELEKLVDHENISDIAKSKVENMGIIFIDEIDKIAAKN..RSGNDVSREGVQRDILPIIEGSKVNTKYGIVDTS
HILFIAAGAFNLAKPSDLIPELQGRFPIKVELKSLSIDDLKKILKQTKNSLIKQYVAMFKVYDLDLKFSEEAIDRIAELT
FNMNLESENLGARRLHGVMEIVLADLFFEVPGSKLKKFEINLDYVNKKIQINEQ.KDLNYYII