HMM Seed Alignment: TIGR00521

Download Alignment

>OMNI|AF1645/17-400
LERKKIVLGVTGSIAAVETVKLARELVRRGADVTAVMSRAARKIIHPYALEFATGKRV...VTEITGSIEHVNL....LG
EYGDADLFLIAPCTANTISKIAQGIDDTPVTTFATTALGSGKPIIIVPAMHEAMMRNKAVLENIQRLIDM.GIEFVQP..
..R..IEEGKAKFPSTETICLHVERELYP...KEMKGKRVVVTSGPTYEQIDPIRFISNKSSGRMGLEIALEFWRRGADV
VHVTSKPSGMSLP.NYKEIRVWSVEDMMKAVLYEIGKGCD......LFVSSAAAADF.IVDAEAKKIKT....APELVLK
LKESPKIIKEVRKIY..SGHIIGFKAETGMSDDELLKVASEKMA..DDN...LNMVVANDVLE..RGMGTEDTRVLILTP
K..RQEWVEGLKQHVAERIVEAYL
>OMNI|NTL01MT01196/1-375
...MEIILCVTGSVAAIEAVKLARELGRQGAEVKCFMSEDACRIIHPYAMEFATGSKP...VLELTGEIEHV........
KYAGADLILVAPATANIIGKLAYRLADNPISSLLLTASGMGTPIVMVPSMHEAMY..AAAAENIMRLKEE.GVIFIEP..
..R..MDEGKAKFPDIDTIVLEAMRQTSS...QRLQGKRVLVSLGGTYEPIDPVRGITNRSSGKMGLAIARRAYIEGADV
TVVAGTVSVEIPP.QLRSFRAETAEEMAERVR.ELVADHD......VFISAAAVADF.KPVYTERKISS....SEEFSVE
LRPNPKVIGIAREINP.EAFIVGFKAEYDVDNEALVESARKQIR..ESG...VDMVVANDVSV..EGFGSDRNRAIIVSD
M..VTELPLMEKEELASIIIDEVI
>OMNI|NTL01BS1570/2-396
LNNRNVLLCVSGGIAVYKACALTSKLVQAGANVKVIMTESACRFVSPLTFQALSRHEV...YTDTFKEQNPSVISH..ID
AADWADLIIVAPATANVIGKLANGIADDMLTTTLLAAT...APVWIAPAMNVHMYDHPAVKRNISVLYQD.GYCFIEPSE
GYLACGYVGKGRLEEPENIVKLAEKHFAEETSAPLEGKHVVITAGPTREAIDPVRFFTNKSTGKMGYALAEAAVQLGARV
ILISGPVSLDQPKGLAEFIPVQSAADMREAVL.SVYDASD......IVIKTAAVADFTPKTVFDHKMKK...QDGGMTLE
LKRTVDILKELGEKKK.EQILVGFAAETQD....IEHYARKKLA..AKN...LDLIVANDVKANGAGFGADTNIVTIFFK
DGHKRELPIMSKLDVSFEILQEIA
>SP|O51752|DFP_BORBU/2-390
DKNKHILIGICGGIASYKSVYIVSSLVKLGYKVKVIMTQNATKFITPLTLETISKNKI...ITNLWD.LDHNEVEH..IK
IAKWAHLILVIPATYNTISKIASGIADDALTTIISAST...APTYFAIAMNNIMYSNPILKENIKKLKTY.NYKFIEPDK
GFLACSSNALGRLKNEDKIIKIILNEFNQK..DYLKNKKILITASRTEELIDPIRYFSNTSTGKMGFCLAQEAVKLGAQV
TIITGPTNENDPE.GVNIIKIKTAMEMYKEAL.KIYNKFE......IIIGAAAVADFKPKHIFNSKIKKN..KINRLYIK
LVKNPDIIQHIGHNKLKNQIVIGFCAENSKN...LIQKAKEKLK..KKN...LDFIIANELKY....FGSKLNKVYIINK
QS.IKELPEMEKSEVAKEILKILY
>OMNI|NTL01EC03561/27-421
LAGKKIVLGVSGGIAAYKTPELVRRLRDRGADVRVAMTEAAKAFITPLSLQAVSGYPV...SDSLLDPAAEAAMGH..IE
LGKWADLVILAPATADLIARVAAGMANDLVSTICLATP...APVAVLPAMNQQMYRAAATQHNLEVLASR.GLLIWGPDS
GSQACGDIGPGRMLDPLTIVDMAVAHFSPV..NDLKHLNIMITAGPTREPLDPVRYISNHSSGKMGFAIAAAAARRGANV
TLVSGPVSLPTPP.FVKRVDVMTALEM.EAAVNASVQQQN......IFIGCAAVADYRAATVAPEKIKKQATQGDELTIK
MVKNPDIVAGVAALKDHRPYVVGFAAETNN....VEEYARQKRI..RKN...LDLICANDVSQPTQGFNSDNNALHLFWQ
DG.DKVLPLERKELLGQLLLDEIV
>SP|P44953|DFP_HAEIN/3-393
LNGKHIVVGITGGIAAYKTIELIRLLRKAEAEVRVVLTPAAAEFVTPLTLQAISGNAV...SQSLLDPQAELAMGH..IE
LAKWADAIIIAPASADFIARLTIGMANDLLSTICLATN...APIFLAPAMNQQMYHQSITQQNLTTLQTR.GIELIGPNS
GFQACGDMGKGRMSEPEEIFTALSDFFSQK..QDLQGLNVSITAGPTREAIDPVRYISNHSSGKMGFAIAEAFAKRGANV
TLIAGPVNLTTPK.NVNRINVISAQEMWQASLESAVKNQ.......IFIGCAAVADYRVTEVAEQKIKK...SGDEISIK
LIKNPDIISDVGHLKTHRPFTVGFAAETQN....VDDYAKDKLE..RKN...LDMICANDVSG.GQVFNADENALQLFWK
NG.HKKLSLKSKVELAADLVNEII
>SP|Q58323|DFP_METJA/20-398
LENKKILVAVTSSIAAIETPKLMRELIRHGAEVYCIITEETKKIIGKEALKFGCGNEV...YEEITGDIEHIL.......
LYNECDCLLIYPATANIISKINLGIADNIVNTTALMFFG.NKPIFIVPAMHENMFN..AIKRHIDKLKEKDKIYIISP..
....KFEEGKAKVANIEDVVKAVIEKIGNN..LKKEGNRVLILNGGTVEFIDKVRVISNLSSGKMGVALAEAFCKEGFYV
EVIT..AMGLEPPYYIKNHKVLTAKEMLNKAI.ELAKDFD......IIISSAAISDF.TVESFEGKLSS....EEELILK
LKRNPKVLEELRRIYK.DKVIIGFKAEYNLDEKELINRAKERLN..KYN...LNMIIANDLSK..HYFGDDYIEVYIITK
Y..EVEKISGSKKEISERIVEKVK
>SP|P73881|DFP_SYNY3/2-399
VKGKRILIGVGGGIAAYKICEVVSQLFQQGAEVRVILTAEAEKFVTPLTFTTLARHPAYG.DADFWQPIHHRPL.H..ID
LGEWADIFLIAPLTAHTLAKLGHGFADDLLSNTVLASS...CPILLAPAMNTDMWEQEAVQRNLQQLLGDRRYHLLAPNG
GLLACDRRGVGRLAEPAQIMHRLQALLFTGGQEDLRGKRILITAGGTQEYLDAVRFIGNPSTGKMGLALAQSAGDRGARV
TLIHGPIGDLPIPMGVISMAVVNAEQM.EQALAQQAPLAD......WIVMAAAVADVKPAQTWTGKIAK...QDLPDSLP
LAPVPDLIAQVSKQKRPHQLLVGFAAQAGD....IVTPAKEKLQ..RKN...LDVIVANPIDQPQSGFGTDSNQAVIIDR
HGSQTAIAPCSKLAMAHRIWQYLL
>OMNI|HP0841/14-421
LENKRVLLLVSGSIAAYKSLELVRLLFKSGASIQVVMSKGAKKFIKPLSFEALSHHKVLHDRNEKWYYNHQNALHHNHIA
CAANADLLIFAPLSTNSLSKIAHALADNIVSATFLACA...SPKILAPSMNTNMLNSPITQSNLKRLKDS.NHIILDTKN
ALLACDTKGDGAMAEPLEILFKAAQTLLKD..AYFENREVIVMGGASIEKIDSVRTISNLSSGIQASALALALYFKGAKV
TLIASNFPTPLPK.EITSVLVSDTASY.ENALNSAANNLQKHALKPLLFNLAAISDYVPKTSFNYKLKKSE.IGETLNIE
CVQNKDLLVSINPNQ...FVKIGFKAEDNQQN..AIKNAQNLLKPFKDNGKDCSVVALNLIKD.SRPFGSLENELWLFSH
HK.TQKIPSMNKLEASFKILDFIK