HMM Seed Alignment: TIGR01057

Download Alignment

>SP|Q59046|TOP1_METJA/10-626
ICEKPSVAKKIANALGKAK---KKSIDGVPYYELERDGKKIIVASAVGHLFTLVEKENKEFGFYPVFDIKWVPASVD-KG
KEYVNKYIKALKKLSKDADEFYIATDWDIEGELIGYHALKYCCGREK---AKRMRFSSLTKKEIVRAFENPD-EIDYGLV
DAGESRHILDWYFGINLSRALMNAIRAVN-RWKTMSVGRVQGPALAFLTERELEIKKFIPKPYWVIEALLKDN---LKAI
HEKEKFWNEKEAKNVYEKIKDEKSAKVVEIKKTKRKLKPLPPFDLGTLQREAYSYFKISPKETQEIAQKLYENALISYPR
TSSQKLPKDRKYLEDILNIIKNHPVYGKWAERIL-K-ENLKPVEGKKEDPAHPAIHIV-DIPKE-ELSEKEKEIYDLIAR
RTLAAFWDNAEREYLNVKIDIKG-EKFKLSGSRTVKEGWHEIY-YFPKFDEIELPPLKKNDIIKVEKITITRKETQPPKR
YTVASIIKELEKRGLGTKATRAEIIDKLIKRGYVIDDGSLKVTDLGISVIETLKRFCPEIIDEKMTRDLEEKLEKIQFRK
IKKDDVLDEAEKRLRKILEEFKKKEEDIGIYLIKNLDATN-KKAKIVGKCPKCGGDLILIRHKKG--RFVGCSNYPEC
>SP|O58356|TOP1_PYRHO/5-634
IAEKPNVARKIAGALSERR-PIKKSLFGVPYYEIFREGKKLIVASAVGHLYGLAPKRD-VFG-YPIFDIEWVPVYIAEKG
KEYAREYIKALSVLAKRVREFIVACDYDTEGEVIGYTALKYACGVDPR-VAKRMKFSALTKRDLLNAWRNLEPTINFGMA
NAGIARHILDWYWGVNLSRALTHAIKKASGKWVVLSTGRVQGPTLKFLVEREREIQSFVPRPYWVIKLIFEKNGQKFTAN
YEKDKIWEEEEGKRIVLEVKKS-IPRVSNVEIKRQKRTPPHPFDLGTLQREAYSAFGFSPKKTLDIAQSLYEKGFSSYPR
TESQKLPRNINFRMIIQNLAK-MPQYRPYAHILLGL-PELKPVEGKKEDPAHPAIYPTGEIPRPGDLTKDEEKLYDMIVR
RFLAVFMEPAIRESVKVTIRAGP-HKFFLSGGRTVKKGWLSVYGKYVKFEEVTLPEFFIGERIKVIQVKREKKKTKPPAR
YSPAAVIKKMEDLGLGTKATRAQILETLYQRGYIEGKKSIKVTPLGMKVIETLEKYVPEIISVELTREFEKKMELIMEGR
LTKEEVIEEAKERLTKILEEFKKRELEIGIELAKIVVGEDEVKPLVVGKCPKCGGDLIVKYNKKTGKRFVGCSNWPKC
>SP|O27661|TOP1_METTH/13-626
ICEKPKSSEKIAGALFPDA--MKKKHGKVSYWEHVEGDKRVTIVSAVGHLYSLRPRQS---NEEHFFDLEWAPIHEIDKK
KGYVKDYLNVIRKFAAGADRYIHACDYDIEGTLIGFNALKYGCGEEALRKTSRMKFSTLTREEIQRAYKNP-IEVDYGQV
DSGAARHILDFIFGVNISRSLMKSVKAATNRFIKLSAGRVQTPTLAILVEREKEIRDFKPVPYWIIRAELGEG---IIAE
SKRGKIFKRELVDSILEKCQGS-DAEVKDVRVRDTIRKPPVPFDLGTLQSEAYRVFGFSPKKTQTIAQNLYTEGYTSYPR
TSSQKLPESIGYEKILKNLAK-NPRFGVHIERLR---GPLKPHEGKKEDDAHPAIHPTGLLPS--ELSKDEKKVYDLIVH
RFISVFGEDAILQTMKVELEIGE-EEFSFSRKRVSKAGWMESY-PYTKMEDEEFPEISGGDSLAVRSVSADERETKPPAR
YNEASLIRELERRGLGTKSTRADIIAKLYDRKYIEGKK-IRVSPLGENIIDTLTRYCEKIISEELTRQFERELEDIMRGK
ISKDRVIDEAITEVRSILSDIEENLRDIGKELYRAYQDSR-----VVGECPACGGKLVIKYSPRNRSTFVGCSSYPDC
>SP|Q9YB01|TOP1_AERPE/2-618
VAEKPKAAAKIAYALSDGRGVLRCSEYGVPYWIVRRDGAAIVVAPSAGHLFGPHTDSR----GFPVFDFEWRPIFEFDRG
AGYLSKFYRMLSRILPGASLYVNACDYDIEGSVIGFKIIEAFGDVNR---ARRMKFSTLAPQDIRRAYARME-RLDVEMI
EAGMARSEMDWLWGINVSRALMEAARRAAGRRVILSAGRVQSPTLVEAYRRWREINLHVPKASVAVKITAEKGGGVFDAR
PHGWKPQSLETARSIKSELRKNPWLAVEEVRSERSILRPPPAFNLGDLQKEANRILGLPPLRTQSIAEELYLEALISYPR
TNSQKLPPSINYRAILDKLAH-GPLGREARELLKETGGVLRPVQGSKDDPAHPAIHPTGEKPSQ-RLSKEHMAVYELIVR
RFLAAFSREAIVSKSSVLLRDFQGRVWRAEGLRVEDLGWLKYY-HYSTPGEKPMPPLDRGDKARVVRVDVRVEWSQTPVR
LDKASLLRWMESVNIGTEGTRARIIETLYKRGYLEGSRKSEVTPLGEAVAVIIQTLFPELSKPDLTRRFESMIEDIRSGR
RTRQEVIDMSKKTISKLLESFLDRLDTAVREIGVSLGSVE-----VEAACHLCGRKAVS--AVSG---YRLCSHHMEA