HMM Seed Alignment: TIGR01327

Download Alignment

>SP|P35136|SERA_BACSU/3-524
RVLVSDKMSNDGLQPLIESDFIEI.VQKNVADAEDE..LHTFDALLVRSATKVTEDLFNKM.TSLKIVGRAGVGVDNIDI
DEATKHGVIVINAPNGNTISTAEHTFAMISSLMRHIPQANISVKSRE.WNRTAYVGSELYGKTLGIVGLGRIGSEIAQRR
GAFGMTVHVFDPFLTEERAKKIGVN.SRTFEEVLESADIITVHTPLTKETKGLLNKETIAKTKKGVRLINCARGGIIDEA
ALLEALENGHVAGAALDVFEVEPPV......DNKLVDHPL.VIATPHLGASTKEAQLNVAAQVSEEVLQFAKGLPVMSAI
NLPAMTKDEFAK.IKPYHQIAGKIG.SLVSQCMKEPVQDVAIQYEGTIAKLE.TSFITKALLSGFLKPRVDSTVNEVNAG
GVAKERGISFSEKISSSESGYDNCISVKVTGDRS....TFTVTATYIPH.FGERIVEINGFNIDFYPTGHLVYIQHQDTT
GVIGRVGRILGDNDINIATMQVGRK..EKGGEAIMMLSFDRHLEDKIVKELTNVPDIVSVKLIDL
>SP|Q58424|SERA_METJA/3-524
KILVTDPLHEDAIK.ILEEVG.EVEVATGLTKEELLEKIKDADVLVVRSGTKVTRDVIEKA.EKLKVIGRAGVGVDNIDV
EAATEKGIIVVNAPDASSISVAELTMGLMLAAARNIPQATASLKRGE.WDRKRFKGIELYGKTLGVIGLGRIGQQVVKRA
KAFGMNIIGYDPYIPKEVAESMGVELVDDINELCKRADFITLHVPLTPKTRHIIGREQIALMKKNAIIVNCARGGLIDEK
ALYEALKEGKIRAAALDVFEEEPPK......DNPLLTLDN.VIGTPHQGASTEEAQKAAGTIVAEQIKKVLRGELAENVV
NMPNIPQEKLGK.LKPYMLLAEMLG.NIVMQVLDGSVNRVELIYSGELAKEK.TDLIKRAFLKGLLSPILLAGINLVNAP
IIAKNRNINVVESSTSE.EKYGNAIKITAESDKK....KFSIVGAIINN..KPVILEVDGYEVSFIPEGVLAIIKHIDRP
GTIGRVCITLGDYGINIASMQVGRK..EPGGESVMLLNLDHTVPEEVIEKIKEIPNIKDVAVINL
>SP|O29445|SERA_ARCFU/2-527
KVLVAEPISEEAID.YMRKNGLEVEVKTGMSREELIREVPKYEAIVVRSQTKVDAEVIQAA.KNLKIIGRAGVGVDNIDI
NAATQRGIVVVNAPGGNTISTAEHAIALMLAAARKIPQADRSVKEGK.WERKKFMGIELRGKTAGVIGLGRVGFEVAKRC
KALEMNVLAYDPFVSKERAEQIGVK.LVDFDTLLASSDVITVHVPRTKETIGLIGKGQFEKMKDGVIVVNAARGGIVDEA
ALYEAIKAGKVAAAALDVYEKEPPSP.....DNPLLKLDN.VVTTPHIAASTREAQLNVGMIIAEDIVNMAKGLPVRNAV
NLPSIEPSDFEF.MMPFLTLAEKMG.KIASVRLGGAIRKVKVTCSGKLATKN.TEFVTRALLKGLFEPILSNEINLVSAK
PVAVERGITIEESKVESVEHYESLLEVWVESNGK....EMYLAGTCFGN..EYRILKIDVYNVNFVPKGHYIISLHEDKP
GVIGRVGTLFGRNNINIAGMIVGRSGDKPGGIQLMLLLVDDPPTPEVLEEMTKLDGIIDATYVEL
>OMNI|NTL01SS01300/31-554
KVLVSDSIDQVGID.ILKQVA.QVDVKTGLSEAEIIDIVPEYDAIMLRSATKVTEKIIQAG.SQLKIIGRAGVGVDNIDV
PAATRQGIVVVNSPEGNTIAAAEHALAMMMALARHIPDANKSVKESK.WERKQFIGTEVYKKTLGVVGLGKIGSHVAGVA
KAMGMKLLAYDPFISQERADQIGCT.LVDLDLLFSEADFITLHIPKTPETANLINAETLAKMKPTARIINCSRGGIIDEE
ALVTAIETAQIGGAALDVFAQEPLG......ESRLREFSN.VILTPHLGASTEEAQVNVAVDVAEQIRDVLLGLPARSAV
NIPGLTPDVMEK.LRPYLKLAETLG.TLVGQLAGGRIDRLTVCLQGDLAEYTNSQPLVVAAIKGLLSQALRERVNYVNAA
IEAKERGIRVIETKDASVRDYSGSLHLKATGTMG....EHSATGALLSN.GEIRITDVDEFPINVPPNNYMLFTLHRDMP
GIIGKIGSLLGSFNVNIASMQVGRK..IVRGDAIMALSLDDPLPDGLLSEITKVAGIRDAYTVKL
>OMNI|CC3215/5-526
RVLIADKLSPAAVE.IFKNRGLAFDIKTGLSKDELIAVIGDYDGIAIRSGAKLDKDVIAAA.NKLRVIARAGIGVDNVDI
PAATAKGIVVMNTPFGNSITTAEHAIAMMFALARQIPAADVSTQGGK.WEKNRFMGVELYAKTLGLIGAGNIGGIVADRA
LGLKMKVVAYDPFLSPERAVEMGVEKVE.LDELLARADVITLHTPLTDKTRNILSAENLAKTKKGVMIVNCARGGLVDEA
ALRKLLDEGHVGGAAFDVFTVEPAK......ENPLFGSDK.VVATPHLGASTNEAQENVALQVAEQVSDYLLTGAVTNAL
NSPSITAEEAPK.LKPFVALAEKIG.AFAGQMVDFGVKAIDIAYEGEVSNLN.VKPMTSAALAGVLKPMLA.EINMVSAP
AIAKERGITVSESRQEVSPTYDSLMRVTITTEKG....KRAFAGTVIA..GAPRIVEVKGMELDAAFSPAMLYVNNLDKP
GFIGALGMLLGEAGVNIATFNLGRV..SADEDAIALVGVDQAPDAGLLAKIQALPHVKEARALTF
>OMNI|NTL01SA1602/5-530
NVLVADPISKDGIKALLDHEQFNVDIQTGLSEEALIKIIPSYHALIVRSQTTVTENIINAA.DSLKVIARAGVGVDNINI
NAATLKGILVINAPDGNTISATEHSLAMLLSMARNIPQAHQSLTNKE.WNRNAFKGTELYHKTLGVIGAGRIGLGVAKRA
QSFGMKILAFDPYLTDEKAKSLSIT.KATVDEIAQHSDFVTLHTPLTPKTKGLINADFFAKAKPSLQIINVARGGIIDEK
ALIKALDEGQISRAAIDVFEHEPAT......DSPLVAHDK.IIVTPHLGASTVEAQEKVAISVSNEIIEILIDGTVTHAV
NAPKMDLSNIDDTVKSFINLSQTVG.ELAIQLMYNAPSSIKITYGGDLASID.SSLLTRTIITHILKDDLGPEVNIINAL
MLLNQQQVTLNIENNKAETGFSNYLEVELSNDSD....SVKVGASVFTG.FGPRIVRINNFSVDLKPNQYQIVSYHNDTP
GMVGKTGALLGKYNINIASMTLGRT..EAGGDALMILSVDQPVSNNIIDELKQVGEYNQIFTTEL
>OMNI|DR1291/21-544
RVLICDEMNPGNLD.HEG...FQIDYQGNLEREETLRRLPDYDALITRSRTKVDRELLDAAGPRLKVIGRGGVGVDNIDL
EYASRRGLLVLNAPESNNVSAAELAVMHLMAAARGLTRSDRKTRAGE.WDR.KFLGLELTDKTLGIVGLGRIGSIVADRA
QGLHMNVVAYDPYVPENKFERLGVQRAASLDELLGQVDALTVHTPLTDETRGMIGERELALLKRDAIVVNAARGGIIEEQ
ALVNALHAGHLFAAGVDVFVDEPPT......AEHIFLGAPNLGITAHLGANTREAQERVGAEIVSRVLDALHGDVSKGAV
NAPALDAKTMEQ.LGGYLDLGEKLGRILAQLLPGAHEV..EVTFRGEFPTDP.SPVV.TAVLMGYLSGSTDEHPNMINAR
ALARERGVTLSVREEEDSPDYQTEVIVRVLNRSGEKERTRKVGGTVFG..KSPRLTRLRDYRVELEPEGFILIASNLDKP
GAVAKLSNLLGTWGINIAGMALGRS..EKGGQALFTLTLDDSLTPEQLQAIRDLDVIESAFLVRV
>SP|O53243|SERA_MYCTU/5-527
VVLIADKLAPSTVA.ALGDQ.VEVRWVDGPDRDKLLAAVPEADALLVRSATTVDAEVLAAA.PKLKIVARAGVGLDNVDV
DAATARGVLVVNAPTSNIHSAAEHALALLLAASRQIPAADASLREHT.WKRSSFSGTEIFGKTVGVVGLGRIGQLVAQRI
AAFGAYVVAYDPYVSPARAAQLGIELLS.LDDLLARADFISVHLPKTPETAGLIDKEALAKTKPGVIIVNAARGGLVDEA
ALADAITGGHVRAAGLDVFATEPCT......DSPLFELAQ.VVVTPHLGASTAEAQDRAGTDVAESVRLALAGEFVPDAV
NVGG..GVVNEE.VAPWLDLVRKLG.VLAGVLSDELPVSLSVQVRGELAAEE.VEVLRLSALRGLFSAVIEDAVTFVNAP
ALAAERGVTAEICKASESPNHRSVVDVRAVGADG...SVVTVSGTLYGPQLSQKIVQINGRHFDLRAQGINLIIHYVDRP
GALGKIGTLLGTAGVNIQAAQLSED..AEGPGATILLRLDQDVPDDVRTAIAAAVDAYKLEVVDL
>OMNI|NTL01AA01312/3-533
KVLITDPIAPEGIELLQKDPEVEVYNEPDISYEELLEIIKDFDAIITRSRTPVTKELLERA.EKLKVVGRAGVGVDNVDI
EEATKRGILVVNTPGANTIGATELTMMHMLTIMRNGHKAHESMLNYK.WDRKKFMGEELYGRILGIIGLGNIGSQVAIRA
KAFGMKVMAYDPYIPREKAEKLGVKLVDNLHDMLREIDVLTIHAPLTHETKNMIDEKEFEIMKDGVYIVNCARGGIINEK
ALIKYMESGKIKGVALDVYSKEPPPPEFIDELKRLADKVN.ISLSPHIGANTYESQRNVAVIVAQQVLKALKGQTVEYAV
NAPFPDLSVLTL.IKPYLDLAEKLG.KFLVQWTEEGIREVHIEVRGDIAEYF..QPISSAVLKGILEEVVDFPVNIINAF
YVAKDRGIKVEELSSEETPDFKHYIKVVVKADGK....EKVVAGTVLEG.QIPRITEIDRYKVDIEPEGILLVFENKDVP
GVIGKIGSILGEANINIAGFRLGRE..KKGGIAIGILNLDEPASEEVLSRIKEIPEILFVKHIVL
>OMNI|HP0397/3-524
QVAICDPIHAKGIQILEAQKDIVLHDYSKCPKKELLEKLTPMDALITRSMTPITSDFLKPL.THLKSIVRAGVGVDNIDL
ESCSQKGIVVMNIPTANTIAAVELTMAHLINAVRSFPCANDQIKHQRLWKREDWYGTELKNKKLGIIGFGNIGSRVGIRA
KAFEMEVLAYDPYIPSSKATDLGVIYTKNFEDIL.QCDMITIHTPKNKETINMIGAKEIERMKKGVILLNCARGGLYNED
ALYEALETKKVRWLGIDVFSKEP......GIHNKLLDLPN.VYATPHIGANTLESQEEISKQAAQGVMESLRGSSHPHAL
NLPMQAFDAS...AKAYLNLAQKLG.YFSSQIHKGVCQKIELSLCGEINQFK..DALVAFMLVGVLKPVVGDKINYINAP
FVAKERGIEIKVSLKESASPYKNMLSLTLNAANG....TISVSGTVFEE.DILKLTEIDGFHIDIEPKGKMLLFRNTDIP
GVIGSVGNAFARHGINIADFRLGRN..TQK.EALALIIVDEEVSLEVLEELKNIPACLSVHYVVI