HMM Seed Alignment: TIGR01415
Download Alignment>SP|O67409|TRB2_AQUAE/11-431
IPKKWLNILPLLPEPLEPPLDPETM.EPVKPEKLLAIFPEPLVEQEVSDKEWIDIPEEVLDIYSLW.RPTPLHRAKNLEE
FLGTP..AKIFYKNESVSPPGSHKPNTAVAQAYYNKISGVKRLTTETGAGQWGSALSFATQFFDLQCRVYMVRVSYNQKP
YRRILMETWKGEVIPSPSPYTNAGRKYYEEN.PEHPGSLGIAISEAIEEAASREDTKYSLGSVLNHVLLHQTVIGLEAKK
QMEEAGYYPDVIIGAVGGGSNFAGLSFPFLADVL.RGDKRKEDLKVLAVEPEACPTLTKGEYKYDFGDSVGLTPLIKMYT
LGHDFVPSPIHAGGLRYHGDAPLVCKLYNLGYIDAVAYKQTEVFEAAVTFARTEGIVPAPESAHAIKAAIDEALKCKETG
EEKVILFNLSGHGYFDLSAYDKYLHGE
>SP|Q9WZ09|TRB2_THEMA/12-422
IPKHWYNVLADLPFKLDPPLDPETK.QPISPEKLSVIFPMSLIEQEVSEERFIEIPEPVLKEYAVY.RPTPLIRATFLEE
YLQTP..ARIYYKYEGVSPTGSHKPNTAIAQAYYNKIEGVKRLVTETGAGQWGSALSYAGAKFGLEVKVFMVKVSYQQKP
MRKYMMNLFGGKVTPSPSEETNFGRKILSED.PDNPGSLGIAISEALEVAVSDPNTKYSLGSVLNHVLLHQTVIGLEIKK
QLELIGEKPDILLGCHGGGSNFGGTILPFVPDKL.SGR....DIRFVACEPAACPSLTKGNYDYDFGDTAGLTPLLKMYT
LGKDFIPPKIHAGGLRYHGSAPIIARLVKEGLVEAQAFDQDETFEAAKIFAKLEGIIPAPESAHAIAGAIREAKKAKEEG
KERVIVFTLSGHGLLDLTAYV......
>OMNI|NTL01PA00577/21-438
IPRRWYNILPDLPEPLDPPLDPETE.EPIDIEKLKRIFAEELVKQEISRERYIEIPGELRKLYSKIGRPTPLFRATNLEK
LLGTP..ARIYFKYEGATVTGSHKINTALAQAYYAKKQGIERLVTETGAGQWGTALSLAGALLGLKVRVYMARASYQQKP
YRKTLMRIYGAEVFPSPSENTEVGKRFLKED.PNHPGSLGIAISEAIEDVLKDEKARYSLGSVLNHVLMHQTVIGLEAKE
QMEEFEE.PDVIIGCVGGGSNFAGLAYPFVKDVL.DGKS...EYEFIAVEPKAAPTMTRGVYTYDYGDSAGLTPKLKMHT
LGHRYYVPPIHAGGLRYHGLAPTLSVLINHGIVKPIAYHQTEVFEAAVLFAKAEGIVPAPESAHAVKAVIDKALEARREG
KEMVILFNLSGHGLLDLKGYEDYLDGK
>SP|O27520|TRB2_METTH/12-428
IPKKWYNINPDLPSPLPEPKNPEGG.K..NIENLPRVFSRGVLEQEMSMERWIKIPREVMDVYKMIGRPTPLFRAKGLEE
MLDTP..ARIYYKREDYSPTGSHKLNTAIAQAYYARKDGAERLTTETGAGQWGTALSLACSLMDLQCKVYMVRVSFNQKP
FRKTIMQLYGGEVVPSPSNHTEFGRRMLKED.PEHPGSLGIAISEAMEEALQEENVYYSLGSVLNHVLLHQTVIGLETKK
QLEIAGETPDIMIGCVGGGSNFGGAIFPFVKDKL.DGK...LDCEFIAAEPKSCPTLTAGEYRYDFGDTAGMTPLLKMYT
LGHDFVPPSVHAGGLRYHGMSPQVALLVREGVINARAVPQHTIFESGVKFAKAEGVVPAPETCHAISVAIDEARKCRETG
EEKTIVISFSGHGLLDLKGYGDYLEGK
>SP|Q9Y8T5|TRB1_AERPE/4-422
VPLRWYNIAADLPEPLPPLRDPEGLREESRIALLSRILPSRLIEDEYILARWVDIPGEVRKALARIGRPTPLIRAEGLEK
VLGVKGRVRIYYKSEAVLPTGSHKINTAIAQAYYAKLDGAKEIVTETGAGQWGLAASTAAALMGLKATVFMTASSFKSKI
QRRLLMEAQGARVISSPSKLTDTGREALEEYGSTHPGSLGLAIAEAVEYTLESGDRRYLPGSVLEAVLMHQTVIGLEALD
QLPEE...PDVVVACVGGGSNFGGFTYPMIGARL.RGEG.FEKTRFIAAESTAAPKLTRGEYRYDGLDSSLILPLAKMYT
LGHRYTPPPSHAAGLRYHGVSPSLSILRRLGLVEAEAIPQEEALASILLMARSEGVVPAPESSHAVALAARIARKLPDGS
...VVAFNLSGHGLLDLDALQKALEIR
>OMNI|NTL01TA00659/11-424
MPDHWYNILPDLPEELPTPRDETGE....AFDTLKKAVPAKVLEYEFSGERYPKIPDEILERYMQVGRPTPIIRAKKLEE
LLGGN..LKIFLKMESYTYSGSHKINSALAHVFFAREEGAKFVSTETGAGQWGSAVALASALFHMESHIFMVRTSFYAKP
YRKYMMYMYGAHPHPSPSEFTEYGREVLKRM.PDTPGSLGLAISEAIHYALDNG.GKYIAGSVINSDILFKTIAGMEAKK
QMEMAGEDPDYIVGVVGGGSNYAALAFPFLADELSSGK...IRRTYIASGSKEVPKMTEGEYRYDYPDTGKVLPLLKMYT
IGYDFIPPAVYAGGLRYHAVAPTLSLLMNKGIVSARDYDQEEAFKWARIFSETEGYIPAPETSHALPILKEIADKNRGE.
.KKTVLVSFSGHGLLDLGNYAEALHFE