HMM Seed Alignment: TIGR01420
Download Alignment>OMNI|NTL01XF01634/2-343
DIAELLAFSVKNNASDLHLSAGLPPMIRVDGDVR.RINIPAFDHKQVQSLIYDIMS...DKQRRDYEEALETDFSFEIPS
LSRFRVNAFNQERGAGAVFRTIP.NKVMTLDELGCL.PVFRKLIEEP.QGLILVTGPTGSGKSTTLAAMIDHINKNAHGH
ILTIEDPIEFVHTSQKCLINQREVHRDTHDFNKALSSALREDPDIILIGELRDLETIRLALTAAETGHLVFGTLHTNSAA
KSINRIIDVFPAAEKPMVRSMLSESLCGIISQMLLKKV.....GGGRTAAWEIMVGTPAIRNLIRE.DKVAQMYSSIQTG
.QQYGMQTLDQHLQDLIKRNLITRQQAREYAKDKAN
>OMNI|NTL01AA00522/14-357
KILEIIKEAIELGASDIHLTAGAPPAVRIDGYIKFLKDFPRLTPEDTQKLAYSVMS...EKHRQKLEENGQVDFSFGVRG
VGRFRANVFYQRGSVAAALRSLP.AEIPEFKKLGLP.DKVLELCHRK.MGLILVTGPTGSGKSTTIASMIDYINQTKSYH
IITIEDPIEYVFKHKKSIVNQREVGEDTKSFADALRAALREDPDVIFVGEMRDLETVETALRAAETGHLVFGTLHTNTAI
DTIHRIVDIFPLNQQEQVRIVLSFILQGIISQRLLP.KI....GGGRVLAYELLIPNTAIRNLIRE.NKLQQVYSLMQSG
QAETGMQTMNQTLYKLYKQGLITLEDAMEASPDPKE
>OMNI|DR1963/8-350
DITDILRLAADKGASDIILAAGLPPQFKLSGDYD.AQGFEPLSASDTRKLMYSMMN...ERQQRIFEEKRELDFSFALGD
KARFRVNAFMQRGNVGGVMRLIP.TTVRTIAEMGLP.QTVIDIANAP.RGLVLVTGPTGSGKSTTLASMIDHINTTKKLH
ILTIEDPIEFMHPNKASIINQREVGSDTLSFDDALRAALRQAPDVILVGEMRDYETIKAAVTAAETGHLVMGTLHTNSAP
ESIDRIVDVFPEEQQEQIRVQLANNLVAVMTQQLLPRAD....GQGRVLAYEILLANPAVRALIRE.GKTFQITSVMQTG
.AREGMVTMDAYLAGLFRRHLITYDKGLERAIDPKE
>OMNI|NTL01SS01986/6-352
MIEDLMEQLVEMGGSDMHIQAGAPVYFRVSGKLE.PINEEVLTPQESQKLIFSMLN...NSQRKELEQNWELDCSYGVKG
LARFRINVYKERGCYAACLRALS.SKIPNFEQLGLP.NIVREMAERP.RGLILVTGQTGSGKTTTLAAILDLINRTRAEH
ILTIEDPIEYVFPNVRSLFHQRQRGEDTKSFSNALRAALREDPDIVLVGELRDLETIALAITAAETGHLVFGTLHTNSAA
GTIDRMLDVFPANQQAQIRAMLSNSLLAVFAQNLVKKKSPKPGEFGRALVQEIMVITPAIANLIRE.GKAAQIYSAIQTG
.AKLGMQTMEQGLATLVVSGVISLEEGLAKSGKPDE
>OMNI|TM1362/7-350
SFLKIITEAYGLRATDVHISVGCPPYYRIDGDLVPQEKYGKLTKESIMNALKDLFT...EIGQPFPPKTKEVDFSFTVAE
AIRVRGNLYYERKNPALAFRLIP.KKIRTFQELGLP.EILKTFVERK.YGLILVAGPTGSGKSTTLAAMIDHINENFPHH
IITIEDPIEYVFTNKKSVIHQRELGSDTDSFYNGLKYALRQDPDVILVGEMRDLETMALALTAAETGHLVLATVHTNSAA
SAPERIIDVFPAHQQRQIALQLANTLIAVIYQRLVPKAN....GIGFTPILEIMVGTPAVRNLIRE.NKLHQLESLIQAG
.ARHGMVLFDDALVKAALKGEISRESALQFARNQEE
>OMNI|NTL01EC02885/17-341
NMEEIVALSVKHNVSDLHLCSAWPARWRIRG....RMEAAPFDTPDVEELLREWLD...DDQRAILLENGQLDFAVSLAE
NQRLRGSAFAQRHGISLALRLLP.SHCPQLEQLGAP.TVLPELLKSE.NGLILVTGATGSGKSTTLAAMVGYLNQHADAH
ILTLEDPVEYLYASQRCLIQQREIGLHCMTFASGLRAALREDPDVILLGELRDSETIRLALTAAETGHLVLATLHTRGAA
QAVERLVDSFPAQEKDPVRNQLAGSLRAVLSQKLEVDK.....QEGRVALFELLINTPAVGNLIRE.GKTHQLPHVIQTG
.QQVGMITFQQSYQHRVGEGRL..............
>OMNI|NTL01SS01865/79-419
SLEELIRSAFDQGFSDVHLGIGEVPRMRDRGEMV.PLRYEPTDQQTFMSWLREILT...EDEIQRFKRELEFDGAKQYD.
FARIRINVLESLLGSAMVLRIIP.LKILTLEQLRLP.DILRTVSDSH.KGLILVTGPTGSGKSTTMAAMVDYINKEHAKH
IISIEDPIEFVHQSRRSLIRQREVGMHTLEFDNALKASLREDPDIILIGEMRDRSTVNTALKAAQTGHLVMGTLHTNSAI
KTLERILTLYTAEEQPAMRTAIAESLVAIVAQGLCRTT.....DGKRAGFHDILINTETVKDYIRQ.GKYDEIAELMEDG
.EYDGMITANQSLFNLYQEGRITEEVALEMAPVRNE
>OMNI|NTL01AA01477/1-348
LLDQILRKALEKKASDIHLKVGSKPVIRTPDGLDTLEEFPPIDIDLFEVFVKEILEH.HPKKKKELEEQGQVDLSYAIPK
VSRFRVNLYKQRGTYAMALRVIP.FDIPEFKKLNLP.PVMLQTALKHSAGMILVTGPTGSGKSTTIASIINEINKRLSRV
IITIEDPIEYLFKDIQSFIAQREVGWDTESFFLGLRAALREDPDIIFVGEIRDTETAKTALHAAETGHLVFSTLHTLDAV
ETINRFIGMFPLEHRDQIRQMLASTLIAVYSQRLVSKKN....GGGKVPVVEIMIMTQTIREAILE.NRPQDIPELIEKG
RLVYGSQTFDQHLEELYRKGLIDLETALLYARRPAD
>OMNI|DR1163/2-346
TLDDLLRELAGRRASDIHLQAGSPPLGRVDGRLL.PFGTQPLTPEHTQALARAVLTP...EQFEEFEYQQELDVAYSVPG
LGRFRCNVFRQRGAVGLVLRVVG.ETIPGFEALGLPREVMEQFAALP.RGLVLITGPTGSGKTTTVASLIDYLNRHFAYH
ILTIEDPIEVLHRNNRSLVVQREVGRDTRSFAAALRHALRQDPDVIVIGEIRDRETVEAALLAAQTGHLVISTLHTQDAV
RTVGRIAEFFAPHERDQVRLQLAECLGGILSQRLLPRAD....GVGRALATEVLVSTPLVQEYVKDEARTPLLKDVLLED
.NLRGMHTFDEHLAALYRAELITLDAALAAATSPHE
>OMNI|DR0442/3-348
VLNQLLAALVKEGASDIHLRAGTAPAARINGVIR.RFGESRLSPQHLQQFTQEMLPST..ALWESFNARREADFAYGLAG
VGRFRVNAYFQRGSIGLIMRVIEDKPIPTFEELGLPTAVFNELAEQE.RGLVLVTGPTGSGKTTTLASLIDYINSHQPVN
IVTLEDPIEVLHRDKMAMVNQRELGLDTLSFSNGLRAAMRQDPDIILIGEMRDKETVEAALSAAQTGHLVLSTLHTQDAI
RSVNRIIDFFAPHERTQIRQGLSESMVGIVSQRLLPRSG....G.GRVMGMEVMLGTPTVRECIKDPERTEEIKQALMEG
.GMRGMRTFDQHLVQLVLDGQMTQEDAMSAATSPHE
>OMNI|NTL01NM00916/6-348
ELFAWLRHMNKNKGSDLFVTTHFPPAMKLDGKIT.RITDEPLTAEKCMEIAFSIMS...AKQAEEFSSTNECNFAISLPD
TSRFRVNAMIQRGATALVFRAIT.SKIPKFESLNLP.PVLKDVALKK.RGLVIFVGGTGSGKSTSLASLIDYRNENSFGH
IITIEDPIEFVHEHKNCIITQREVGVDTENWMAALKNTLRQAPDVILIGEIRDRETMDYAIAFAETGHLCMATLHANSTN
QALDRIINFFPEERREQLLTDLSLNLQAFISQRLVPRDG....GKGRVAAVEVLLNSPLISELIHN.GNIHEIKEVMKKS
.TTLGMQTFDQHLYQLYEKGEISLQDALKNADSAHD