HMM Seed Alignment: TIGR01612

Download Alignment

>360.m00018/1-2719
MKKFIYITTTYIVLFTSLEIIYGRKIETEKKNHDAQLNSFYLYHNLEGVNLNDSNSSNEKQYNNKNNAINDQTFIQPHSI
TYFRNQKDTANDKITLYNDYTIKNNFNAFKSFNNDSEKTDRKATIVKNSFIQKSSAPSFDPDIYNEIDIIYGASYTNENL
EFFYAKLQICYDLRTIDSKGYYSSKRLLDSILNKLKQIQKDIIAIKKECEPRRTNVIGEMVKIQDPLYEFYKEPIHSYYN
SYEISKKDYVNCILPRFKNLEPILDGILSSLKLEYDYVGYYSYWDIDAAYKEHATITHKHILAFLNDVKKHPMPNDKETV
PHIKSLIQILESEGEQKHLKNKLIFLEKQFEDVIHKSSIYLEKCLSSHLLMEDYLKDSKISPYYYEFLEKIKRISKRREI
FFYNAKKLKYLEIVYNHQKEVLNSFVKTLGRLLIEKPDPNNNQIFKDDFDEFYKPIPKSNLKALETRFFEIFKQEWGSYD
NKKTLGKNVNQDNTVRLILMRMKDFKDIIDSMELYKRR.VTSKNKILSDIDQNLNKKTYKEIENGLKESYTLATNWKRLK
HKIKTELEEYNEDSIHLEKEINNLFDKYLEIDDEIVYINTLKLELKEKIKNISDKNEYVKKAIDLKKVVENNNAYIDELA
KISPYQVTEYVKNKDKIYSTIKSELSKIYQGDLDALYNELSSIVKENAVDNTEDKAKLEDLKSKIDKEYDKIQNMETETV
KLNLSTIENKKNELLSIIVEMKKHIHSELNNELNKIVEDFKSKEKQLSSNINDYSNYKDELNKYKSKISEIKSQYNDQSN
IDNIKDEDAKQNYEKSKEYIKTISVKEDEIFKIINEMKFMKDDILNKVNVFVNLENNHKEKINSGHESFAELVNKIKNEI
SDDQLNDYEKNVNDSKSLINEITKSIEEEYQNINTLKKVNGYLKICKNTTESIEKFRNKQNKLNEILNKNIDVIKNSNLI
EKSYTNQFDNTLTDKKTELEKIFTELSLSSYEAKNNELIKYFNDLKENLGTPKGNTLYQQFDENEKATNDIEQKSVNANK
NVSNIEMVIHTSIYNIIDEIEKLIGKNIELLNKEILKEAEISITNFNEIKEKLKHYNFDDFVKEENIKYADEINKIKNDI
KTLDQKVDKNIKALTEIKNKSENYINEIKTQISDLEDVTDKTIYNEDPKEIEKKIENIVTKIDKKKYIYDNMKKLLNEIA
EIEKDKTSLEEVKNINMSYGKSLNKLFLEKIDEEKKKSENMIKSMEKYIKDLDEIKEQS.............PKAEMNTF
NISNSKYKDHYITSQKNDKSISDIREKSLKLTEGNYEKSNINDIKKTLQTYLLDAQKHNSDINLYLNEITNLYNILKLNN
IKNIIDEVKEYTKKIEEYNKNVKSELDKSETLIKTIKENSNLETCKSKIESTVDGKDINECIKKVTESKNYILSEESNND
TYFKNAKENNENVSLLFKNIEMANNKTQHIMKNQKDNATSDMDFNLNELKENIDKSKKCKDEADKNAKQTEKNKILFKQY
KKDVTELLNKYSELAIKNNIAQTKKDSNIIINEIKELKKQITLQAETSEQKINKIKKEKFTIEDDAANNNKSNKAAIGIQ
TSLENLENKLLKITNIKKKINDCLTETESIEKQISSFSINSQDTELS.......SLQTFLESLKDQKKNIEDQKTELDNL
DSEIKSIENDVDQHKKNYEIGIIEKIKETAITNKEELESIKTSIESTIKNVTSSFNTNDLEGINTNENLEKYNTEINDIY
EEFIKSYNIMTNCLETVSKEPITYDQIKNTRITAQNEFLKIIEIKKKYNSYLDNVKIKEVDRIINHFKSKLDHVNDTFTK
EYSNINKGFDDISKSIENVKTSTDENLLFDILNKTKDAYMGMIGKSYYSYKDEAESIFKNMVKLAYSINIQIQNNSGINL
FDNVNIDVLSSLNSETKDTLKFIPSPENEPEIYTKIRNSYDTLLNIFKKSQDTHKKEQDTLNIMNKNQQLYEKIRQSNEL
KGVLSDTKYKKEKILNDVKLVLHKFDELNQLTCDSQNYDTILELSNQNQIKTKIDNYEQEKRKFVMDFNVTIMEQKLDNI
IKSIEKFEN........THDSSEKKDSNIQSNNQLNEMTELFNTEIKIIENKIIEKNGLIDQLTKMRKECLLFSYATLVE
TLKSKVINYSEFITSATKFSKEYFEFINNSTDSLNDNIDALQTKYNLNQTKKHMIS...DITNDKNNLIEKEKEATQTIN
NLTKLFTIDFQNADAKILYYNNLQMTYFYSQLQKSIESIKKLYRKIRAFKLSNIYLINEKYSDISKQFDNIIQLQKNKLT
ENLNNLKEIEQYVSDKKRIFLHTVNGNTNFNFNALKEIYDNIISRENKAHGIENVNNKESENIMQYTDTITKLTEKIQDI
LIFVTTYENDNNIIKQHIQDNDENDVSKIKENLKSTIQSFQHIQNKINEIKAQFYGGNNINS.IIITISQNANDVKTLFS
KDLTIENELTRIQSRLENIKNAAHENRSEQIVQYTNAIHNYIEQQFNKIENNSNQDE......IDSTMENIRNYNKESEV
KLQQISNYKNEFASIIPDITNLIALIKSKYG.NNNISYKVAIKHEEDAQNILNDLNKSQNILSQSINKNKKSIEDLGYKK
HGIHNNNNLHTINKHQEISQIKHPNNTSHNNND..DAKYKNYHHSNSDEKGSSKTKISGNSIKFAGAIGVGLVAFYVIAN
FNKKNDTNEMDLDNDQSFCNEGEIKYFERDDEIIKINMNED
>179.m00016/1-2756
MKKLIYITTTYIVLFTSLGVIYGKKIETGKKNHDGQLNNFYLYNNLKGINFNNSNSSNEEQYNNKNDVIN.DKFIQPNSI
TYLENQKDTANDKVILYNDYTNKNDLDTFKIFNNDNEKTNRKAXIVKSSFIQNSNPTRFDSSMYNTIDILYNVSGPNENL
KYFYVKLYFYQELRTFLNNIYSNAKKPVNIPRSTPLQIDNDINLIIKECEPLKTNIINEMSKLHNPLYEFYKEPTKDDYN
PYSNYRKIYVDCMIPRFKKLASKIDAAISSMQSEYDHLCYYEYWNVDALYKKYSANTKEYMDTELYNIKSHSVIYDMGLR
SHGNRLIKILESEGEQGNIISKLKFLSNEIEYTLNKSDNYKDECTSNYTFMVNYVQRDTYTQYYYYYLREIKKIAQQRAN
FNYNFNKLKHLKLLYKQQEDIMRNFHKTIERLIFGKPDPNNTNVFKEYIYEFNLWIPKSKLTLLEKRFFEIFEEKWNSYE
IKKDIDENSKQYNVVKLILQYMKELTDVIDFMENYQPDEVPTRRIIGFEVEWRIKALLYSEVEAGVKKSYESVKNWRKSI
LEINKKLEEENEKVIKLETQIKDLFNQYLKIIDENIYINKLKLELKEKIKNISDKNEYIKKAVDLKKIIENNNAYIDELA
KTSPYQVPEHLKSTDTIYSTIKSELSQIYEDDIDKLYNELSSIVQENDIDNVEDKTKLDDLQSKIDNVYSKIQNMETATV
ESHLTNIETNKNKLSDTIVEIKKYIYGEISKDLNKTLEDFKNKEKELSNKINDYAKENDQLNVYKSKISEIRNHYNDQIS
IDNTKEEEAKQNYDQSKEYTKTISIKEDETSKTINEVKNMKDEFLSKVDKYINFENNCKENVDSEHTQFTELTNKIKAEV
SDEKLSIYENKFNDSKSLINETNNSIEKEYQNINTLKKVDEYIKVCESTKESIKNFHNKQTILKEKLNQNIKTIKETNSI
EKSYKDKFENTLINKINELDKAFKDASLNDYESNNNELMQYFNNLKANLGKNKENMLYHQFDEKEKAVNNIIQKIEDINK
NIPNIEIAIYTSIYNISEEIENEIGKNIESLNTNVLEKVNTNVTNFNKIKEKLKLYNFSDFGKEGNIKYTNEVNKIKDDI
KNVNQQIDHHINELEEIKKKSENYVDEMKAQINKLEKVADTAISNDNVEGIEKKQQNIVTKIDKKKNIYEEINKLLSEIS
KIEKDQTSLEKVKGINLSYGQNLGTLFLEQIDEEKKKSEHTIKAMEAYMEDLDNIKKKSQEIENEMGIEMDI.NKEMEVL
NISHDDDKKYHTISKNHNENISDIRNKSLKIIQDFSRESDINDIKKELQKNVSESQKHNSEINQYLSKIANIYNILKLNK
IKKIINKVKEYTNEIEKNNKNINDELSNSEKLIKKIKDDISLKECKSKIESTLDDKDIDGCIQNIKVLKTHILSEETNIN
TYFKNADEYNKNVLLNFNNIEMADNKSQYILKIKKNNGTNDHDYNINELKEHKDKSNGYKTEADKNKKAIEKNKELFEQY
KQEVTVLLNKYYAVELKNKFDKTKNDSEQIIKEIKDAHNKFILEAGKSEQKMKEIKNEQIRIEDEVAKNDKSNKAIIDIQ
LSVEPFETKFLKISDIRTKSNDCLKETESIEKKISTLSIDTQETKLKENGDNLNTLQEFLESLKNQKKNIEDKKKELDEV
NSKIEKIKIDVNQHKKNYEIGIVEKINEIAKANKNKIESTKELIKPTIERLISSFNTNDLEGIDPNEKLGEYNTEMGIIY
NEFMELYNLIAGYLKTVSKESITYNEIKNTRINAQNELLKNIESEKKSKSYLDDIEANEFDRIVTHLKKKLDNVNVKFTN
EYSKVNEGFDNISKSINNVKNSTDENSLLNILNQTKEMYANIVSKKYYSYKYEAEKIFINISKLANSLNIQIQNSSGVDL
LKNINIAILSYLDSPKEDTLTFIPSPQKKSETYTKIRDSYNTLLDIFKKSQYLHKKEQQTLNLIFENRRLYEKVQATNEL
KDTLSDLKYKKEKILNEVKLLLHKSNELNKLSCNSQNYDTILESSKYDKIKEKSNNYEKEKENLGINFDVKAMEEQFNND
IKDIEKLENNYKHSEKDNYNFSEENNNILQSKKKLKELTNAFNTEIKKIEDQIIEKNDLINKLIETRKQCLLFTYTTLVE
TLKSKVTNHSEFITSAAKFSKDFFKYIEDISNSLNDDIDTLQINYNLNQTNKHVPSILADATKDHNNLIEKEKEATKIIN
NLTELFTIDSNNIDADTLHNNKIQIIYFNSELHKSIESIKQLYKKMNIFKLLNISHINGKYFDISKEFDNILQMQKHKLT
ENLNDLKQIDQYISDKKNKFLHALNETTNPNLNTLKEIYHDIVNYERQLDEIKNISNKENENITSYIDTITKLTGKVQNI
LNFVTTYENNNNIIKQHIQDNDENHVSQIKDNLKKTIQSFQEILNKIDEIKAQFYGNNNIS.NVITTISQNVNDVKNHFS
KDLTIENELIQIQKSLEDIQNSTHEIRSEQITKYVNAIYNHIEEQTKQIQNNSYKDEVYKINEIDNIIQKIINYNKEPEV
KLHAIIDNQNKVTSIISRIKNLINLIESEYSNNNNVSYNVAIKHTENANNIILDLNMSQNMLNHLIHRNLNIINNLKNIK
QHMISRNNLHTINSQEETSKIKYPSNTYYNNVNDTK..YKNHQHSNSGKKGSSKTKNAGDSVKYAGAIVFGLVVCYAISI
FKKQDEKNEINLGNDEKNYGESENIYFEREDEIIEIDINED