HMM Seed Alignment: TIGR01665

Download Alignment

>GP|18144793|dbj|BAB80838.1/23-343
DGKLRLELNTGLNEIEFELGYDKEKRWTRIEEWGVIKTDVFYSKNKQLYRIYNIDK....G.MFSLKIKARHIFFDLVKH
NLLDTRAVACNGQQ.ALER.....ILEGTKYKGHSDIDRINTCYFCVT...NIVQAINGENDNSF.RNRWGGEM.LFDNF
DIYINNRIGGDYGV.RVNYSRNMEDVNLIIDRDNIVTRAYPRAFDG.IMLPEKYIDSPLINKYPIVCEDYIDMS..DLKL
KDPN.TSNDEGFDTEEELYQAMRERMKKLYEG..GIDK.PSISGNVKVAMLENSIE.YKDF..KGLVNIGIGDTVTVNHK
DIDIDMK..TRAITIEWNLVTKKYENIEFG
>GP|17402422|emb|CAC85570.1/25-344
ITATVDETLNGPCELTIEYPVT.ARLFDKISDESIFKVKSNEVQNFQLFRAYNIVRDE..F.TSSIIVKAKHITNDATSN
FVEDFTVENITPGA.ALNKLFS.STAYPSKFSGTSDIATLSSTSIQRK...NPLEIIAG.VEGSL.LDTWGGEL.VRDNF
SIKLLKRRGRDKVA.SIRYRKNLTGLETDVDTENVITRIYPFANKQD...SNGNEQTIVLPEKYIDSEHINAYS..NVKI
LAVD.YSSDDTVTDVTTLRNVAGK...YFMNN..KTDI.PEMNIKVSFEPLSEMTG.YEKY..KNLEAVELGDTVTVYHP
DLNVNIT..AKAVRTKYNVITEKYEEIELG
>GP|10732859|gb|AAG18640.1/15-318
YADKISQEANSTYQLTFRFPTS.DVLWEKLKEETFLKA..DDLHGEQDFVIFEVQK....K.HGYIQVYANQVMTLLNNY
VINPISLDRATGST.ALSRFAG.SITRYNTFSFFSDIDERHTFNTDSV...NAMVAFTK.DKHSI.LGQWGGDL.VRHGY
QVRLLKNGGSENES.LFMYKKNLSSYQHKTSTKSLKTRITFKATVK.....GEGEKAPDRKFSVVVDSPLVNKY..SQIY
EDVI.EVNDQDVKDEVGLRKYGEQ...YFRTT..LCDM.LEDSLEIQVE.........GK....SDVPVQIFDIVSLFHD
RFKMDVR..KKITKYTYSPMAKKLLSIGFG
>GP|15024858|gb|AAK79843.1/19-314
KDLKLEREINKLDILSFSISRN.DPAYEIIQEEYYIRN...NLENEYVIKQINISE......DDYKEVVCEVNVEELKGT
LIDNINQTQGNCEATANLAMVN.TTWHVGYCDVIRKRNIIKKQCSVYD....VLQEIQS.......MYHCEIAF.NAINK
EVLIYQSIGSDKGT.YFSDELNLRQLNLQSDTNDYVTQIIPIGANN...........LTIESANNGDNYVSNYQ...YTK
KILKAYWVDNRYTIAQDLKDDATER...LSELS..K...PKKSYSVSIADLANLS...EDY...KILDYGLGDSITLLSK
NKRIKDN..QRIKKLEIYPEEPEKNTAEVS
>gi|21398432|ref/21-337
FKIKYSPPLNELWTAGFSLPFT.DPKREEIETFDYVEIFD.NGKRIGLFRIMDSEEEREVS.QKIITYDCEHVLSTLMDS
VLFGYHERINLTTRENIEYLLSKQRIKHWKLGQCDFVKYFQYSWENEDTILGPIYSIAK..PFDE.KFQWTWDD.TSYPW
TLNLVKYSDEITG..ELRYRKNMKGIKRKVEAKDVMTRIYPLGYGEG.......VNQLNIKSVNNGLPYIDAPDFVRELQ
DGFDYIWVDRRFEDPKTLYASAKA....MLLK...ACM.PKVTYEIDAIDYELIDP....Y...KIEKYETGKLVRLYDE
DFNISVD..LRVMDRSKDDVTGNPLDVKLV
>gi|21716123|ref/20-344
KEITTNASELMNDTLSVSLPFD....ET.IKDASYIAVNDTKEQEFSLYRILTAKD....E.DDLLSSEAINFAVDELDN
FIIKDVRPKNRSFSYVINQLLS.DSGCDWVLGICEPIKTVSSTFYYTSMR.EALKALQELGAEFT.FSIEITGN.KITKK
IINCYNQIGKITNK.RFEYGDEVLKIVHQQDRTNIVTALIGRGKGEE....VGDGYGRRIEFSDVEWRKSNGKP...LDK
PKGQNWIEYPEMTKEYGIPSNGKMLPRKMVVIFDDVED.ASELLQKTYDQLAYYCRPLVQFSTEILGSDSIGNTVSIHRG
DRNYHYQ..TRVFKVVTDHVNGRVQASLGD
>GP|8918800|dbj|BAA97860.1/24-337
RAIHKRNVNDNSEMLELLISSE...RAGKFRERHRVIIR.DSNKQWREFIINWVQDDMD.G.YTEIECIASYLADITTAK
PFAPGKFEKKTTSE.ALKDVLSDTGWEVSEQTEYDGLRTTSWTSYQTR..YEVLKQLCTTYKMVLDFYIELSSN.TVKGR
YVVLKKKNSLFKGK.EIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPEN........DKGKRLELVVTDDEAQSQFNLPTRYI
WGIYEPQSDDQNMNETRLRSLAKT...ELNKR...KS..AVMSYEITSTDLEATYP.........HEIISIGDTVRVKHR
DFNPPLYVEAEVIAEEYNMISENSTYTFGQ
>gi|21401924|ref/29-353
DDRRQWELKNNVDMLEFKVFDG.TPEAITLQQQNLILKEVRDGRIVPYVINNEVERDS..N.DKSVTVHASGAWVQIAKE
GFISPQRIESKTVN.EFIDLALVGMKWKRGITEYAGFHTMTIDEFIDP..LTFLKNIAALFKLEIQYRVEVKGS.RIIGW
YVDMIQKRGRETGK.EIELGKDLVGVKRIEHSREICTALIGFVKGE.......GDKVITIESINKGLPYIVDAD..AFQR
WNQHGQHKFGFYTPETDQEDMTPQRLMTLMKLELAKRVNTFVSYEVEAQSLGRVFG.......LAHELIDEGDIIRIKDT
GFTPKLYLEARVIAGDESFTDPTQDKYMFG
>GP|623075|gb|AAC00550.1/57-375
KRSKNRKSKEYNHYGTIVVPQR.QPDSSKVVEGNYIAKHDDVLDRWYIFRIWHTSETLLASGLAATSAELIDLGLWELSH
TIVPAKTYTNCTAKTAFQWLAQKLTWNLDMSKLTTTLTMSKIEFDGTSRASSMLQTLLQDYDLECDFYVKATSNGTITDK
IFEVGNKLNSEIYSGTVFVGQNVTGCTR.EITGNIVTKLYVFGPNG...........ETMASANGGKTYIVDDAANRQYN
PNWRTTYLEGAYTSNSTTDAHGLK...AIAKTILADTNHPQYAYTVTVP...............HTMHPRLGSVVRTVNT
DFTPEMVTKERVMAVTESYADPSQNSIQFG