HMM Seed Alignment: TIGR01932

Download Alignment

>SP|O83152|HFLC_TREPA/15-329
VLNIGIVVGVLLGGVVLLQPFYLIQEGQVALITQFGEIIKTNN......TAGLYVRAPFLHHVHKYTAKLLRVDGDPQKI
PT..KEKQFIEVDTTSRWRIEDVKKFYQSLG..TYEAAYSRISDIIDSSVRDIITVNGLDDVVRSTNAIN...ESNHSEQ
FDVPVSQLAFDRGAEKT.............AHMTIEKGRESLAREISQAANDQLKDFGIVVVDVIFKGIKYSDELQASVF
NRMVKERNQIAQMFRSTGEGKKAEWLGKLDNEKRSLLSKAYEEAERIKGEADARAAAVYAQSYGKSPEFYGFWKSLEVYK
KSLPD..T.EKILS.TDLEYFKHLY
>SP|O51222|HFLC_BORBU/12-320
IKIITFTVIVCLTILSIFQPIYILKENEISITTRLGKIQRTEN......LAGLKYKIPLIENVQIFPKIILRWDGEPQRI
PTGGEEKQLIWIDTTARWKIADINKFYTTIK..TMSRAYVRIDAAIEPAVRGVIAKYPLLEIIRSSN...........DP
IQRLSNGILTPQETKIN.............GIYKITKGRKIIEKEIIRIANNNTKDIGIEIVDVLIRKVTYDPSLIESVN
NRMISERQQIAEEQRSIGLAEKTEILGSIEKEKLKILSEAKATAAKIKAEGDREAAKIYSNAYGKNIEFYKFWQALESYK
AVLKD..K.RKIFS.TDMDFFQYLH
>SP|P25661|HFLC_ECOLI/1-327
MRKSVIAIIIIV.LVVLYMSVFVVKEGERGITLRFGKVLRDDDNKPLVYEPGLHFKIPFIETVKMLDARIQTMDNQADRF
VT..KEKKDLIVDSYIKWRISDFSRYYLATGGGDISQAEVLLKRKFSDRLRSEIGRLDVKDIVTDSRG...........R
L.TLEVRDALNS.GSAGTEDEVTTPAADNAIAEAAERVTAETKGKVPVINPNSMAALGIEVVDVRIKQINLPTEVSEAIY
NRMRAEREAVARRHRSQGQEEAEKLRATADYEVTRTLAEAERQGRIMRGEGDAEAAKLFADAFSKDPDFYAFIRSLRAYE
NSFSG.NQDVMVMS.PDSDFFRYMK
>SP|Q9KV08|HFLC_VIBCH/1-318
MRKLLIPSIVLI.IAALLMSMFVIPEGERGIVIRFGRVLKDNNDLARIYEPGLHFKMPLFDRVKTLDARIQTMDGRSDRF
VT..SEKKDVIIDTYVKWRIEDFGQYYLATGGGNALTAEALLERKVTDVLRSEIGAREIKQIVSGPRNVAVLPENADSSE
LTTEAAKEAMEIDGQRD.......Q.....IMSE..........VLNDTRESAMKDLGVYVVDFRMKKINLPDEISESIY
RRMRAERESVARKHRSQGREKAEVIRAQAELEVATILAEADKTARVTRGTADAEAAKIYSDAYKKDPEFFSFLRSLRAYE
KSFNS.KNDILVLD.PNSEFFQYMN
>GP|27904382|gb|AAO27215.1/1-324
MRKVILIILIVV.VIYFFTCFFIIKEGQRGIILRFGKISYDDNHHVLVYKPGLHIKLPFIESVKIFNSKIQTIDNRLDSV
LT..KDNKNLVLNTYINWKINDFCRYYLSTGEDNIYYAETLIKQKFNNRLRAQISHLNIKEIIFNVKD...........Q
L.TSNIKYSLNASSKIN......YKNVIFKKAINGTSNQNINQENNLLQSISDLSEIGVQILDVRIGKISVSEDFFSLIC
SRINSEYRAIAKHYRLMGDKQAEELKLRANYEVVKILSKAQRSALIIKSEGEALVAKLFSDAFSQEPEFFSFIRSLQAYE
NIFKKKNQNLIVVNENNSSFLRYMY