HMM Seed Alignment: TIGR01966

Download Alignment

>SP|Q8XI67|RNPH_CLOPE/2-237
RSSGRKKEQIRPVKITRNFTKYAEGSVLIEVGDTKVLCTASIEEKVPPFLKGSGEGWITAEYNMLPRSTQSRKQRDINKL
KIDGRTMEIQRLIGRALRSAVDMKALGEKTIWIDCDVLQADGGTRTTSITGSFVALVDAVNKLHQKKPFNV..YPIRH.F
VSAVSVGIVGEE.KILDLCYEEDHVAKVDMNVVMTEEGEFIEIQGTGEAGPFSRKELDELLNLAEKGAKQMIQAQKDALK
>SP|Q9S2H7|RNPH_STRCO/3-240
RIDGRTPQQLRPVTIERGWSKHAEGSVLVSFGDTKVLCNASVTEGVPRWRKGSGEGWVTAEYAMLPRATNTRGDRESVKG
RIGGRTHEISRLIGRSLRAVIDYKALGENTVVLDCDVLQADGGTRTAAITGAYVALADAVAWAQGRKLIKANRKPLTG.T
VSAVSVGIVDGT.PLLDLRYEEDVRADTDMNVVCTGDGRFVEVQGTAEAEPFARDELNTLLDLATAGCTELAELQRKALD
>SP|Q8NMR4|RNPH_CORGL/9-244
RFDGRAQDQMRAVKITRGFTSNPAGSVLVEFGNTRVMCTASVELGVPRFKRDSGEGWLTAEYAMLPAATAERNRRESMAG
KVKGRTHEISRLIGRSLRAAVDLSQLGENTIAIDCDVLQADGGTRTASITGAYVALADAIKVLQERGVVPGS..PLLA.P
VAAVSVGLVDGN.VCLDLPYEEDSRADVDLNVVMTEHGEFVEIQGTGEETTFTRAQLNDMLDHAEKGCRELVAAQKAALG
>SP|Q8XXF5|RNPH_RALSO/2-237
RPSGRQPDQLRPVTLTRHYTRHAEGSVLVCFGDTHVLCTASVLPKVPPHKKGSGEGWVTAEYGMLPRSTHTRSDREAARG
KQSGRTQEIQRLIGRAMRSVFDLSALGEHTIHLDCDVLQADGGTRTASITGAFVAAHDAISVMRKKGQLTG..EPIRD.F
VAAVSVGVVDGV.PVLDLDYPEDASCDTDMNIVMTGAGGFVEVQGTAEGTPFTRTEMDALLGLADHGIRTLIGLQKQALG
>SP|Q8Y7N6|RNPH_LISMO/2-238
RVDGRESNALRNIEVTPDYLMHPEGSVLIASGNTKVICSASVETKVPPFMRGEGRGWISAEYSMLPRATNTRNIRESSKG
KVTGRTMEIQRLIGRALRAVVDLDALGERTIWLDCDVIQADGGTRTASITGAFIAMVMAIAKLDEAVPFAK..FPVKD.F
LAATSVGVLEEGGTVLDLNYVEDSAAQVDMNIIMTGSGAFVELQGTGEEATFSETELAELIALGKKGISELIEIQKETLG
>SP|O67069|RNPH_AQUAE/2-237
RSDGRKEDQLRPVSIQRDFLEYPEGSCLISFGKTKVICTASVIENVPNWLKGKGQGWITAEYSMLPRATQQRTIRESVQG
RIGGRTHEIQRMIGRAMRTAVELTKIGERTIWVDCDVIQADGGTRTAAITGAFVAVADAIIKLHKEGIIEE..TPIKD.F
VAAVSVGIVNDR.ILLDLNFEEDSAAQVDMNVVGTGSGRLSEVHTMGEEYSFTKDELIKMLDLAQKGINELIELQKKLYV
>SP|Q92SK2|RNPH_RHIME/2-238
RPSGRKTDQMRKVSFERSFSKHAEGSCLVRFGDTHVLCTASLEEKVPAWLRNGGKGWITAEYGMLPRATGERMRREAATG
KQSGRTQEIQRLIGRSLRAVVDLPALGERQISIDCDVIQADGGTRTASITGAWIALHDCLKWMEARNMVKL..EKVLKDH
VAAISCGIFANQ.PVIDLDYLEDSAAETDANFVMTGSGGLVEIQGTAEGKPFSEEEFASLMLLAKNGIAELVEMQKQAIA
>SP|Q9ZCT5|RNPH_RICPR/2-237
RQSGRKSNQLRPISLELSPLINAEGSCLIKIGNTHVMCSATCETTVPPFLRGQNQGWITAEYGMIPGSTSHRIKREAALG
KQGGRTQEIQRLIGRAMRCVINLQKLGERQIIIDCDVINADGGTRTAAITGSYVALHLAIRSLMKKRILKV..NPLIS.Q
IAAISCGIYKGN.AVLDLDYLEDSDAEVDSNFVFACNGNLIEVQGTAEKEPFSEEQFLAMLKLAKSGVVELFKLQNQVLI
>SP|Q9JTN2|RNPH_NEIMA/6-240
RIS.RAADSLRDIKITPHFLPHTDGSCLIECGNTKVICTASIDENVPPFLRGKNQGWVTAEYGMLPASTASRMRREASAG
KQSGRTQEIQRLIGRSLRAVVDMEKLGERQILIDCDVIQADGGTRTASITGAFVALQIAVGKLVSDGILSE..NPIRE.A
VAAVSVGVVNGV.PLLDLDYPEDSGCDSDVNIVMTASGKIIEIQGTAEDAPFSLDELGKLVALAQKGIGELLQHQQNALS
>SP|Q8Z0M2|RNPH_ANASP/5-238
RPDGRKPYELRPINFHTKFTRFAPGSVLTICGETKVLCTVSVAESVPKFLTGSGKGWLTAEYRMLPSATQQRHERE..LL
KLSGRTQEIQRLIGRSLRAALDFEALGERTLTVDADVLQADAGTRTAAITGGFVALAEAISQLLQRGVLER..SPLCG.Q
IAAVSVGLLEQE.AYLDLNYIEDVAATVDFNVVMNKNLGIIEVQGTAEEGSFSRTQLNQLLDCAETGIQQLLIAQQQAIT