HMM Seed Alignment: TIGR02012
Download Alignment>SP|P48294|RECA_STRLI/5-325
DREKALDAALAQIERQFGKGAVMRMG.DRTNEPIEVIPTGSTALDVALGVGGIPRGRVVEVYGPESSGKTTLTLHAVANA
QKAGGQVAFVDAEHALDPEYAKKLGVDIDNLILSQPDNGEQALEIVDMLVRSGALDLIVIDSVAALVPRAEIEGEMGDSH
VGLQARLMSQALRKITSALNQSKTTAIFINQLREKIGVM.FGSPETTTGGRALKFYASVRLDIRRIET.LKDGT.DAVGN
RTRVKVVKNKVAPPFKQAEFDILYGQGISREGGLIDMGVENGFVRKAGAWYTYEGDQLGQGKENARNFLKDNPDLANEIE
KKIKQ
>SP|P03017|RECA_ECOLI/5-325
NKQKALAAALGQIEKQFGKGSIMRLG.EDRSMDVETISTGSLSLDIALGAGGLPMGRIVEIYGPESSGKTTLTLQVIAAA
QREGKTCAFIDAEHALDPIYARKLGVDIDNLLCSQPDTGEQALEICDALARSGAVDVIVVDSVAALTPKAEIEGEIGDSH
MGLAARMMSQAMRKLAGNLKQSNTLLIFINQIRMKIGVM.FGNPETTTGGNALKFYASVRLDIRRIGA.VKEGE.NVVGS
ETRVKVVKNKIAAPFKQAEFQILYGEGINFYGELVDLGVKEKLIEKAGAWYSYKGEKIGQGKANATAWLKDNPETAKEIE
KKVRE
>SP|Q9A9A7|RECA_CAUCR/16-336
DKQRALEAALAQIDRAFGKGSVMKLG.EKGKVEIESVSTGSLGLDIALGIGGLPKGRIVEVYGPESSGKTTLALHVVAEV
QKAGGTAAFVDAEHALDPSYAYKLGVNLDNLLVSQPDNGEQALEITDTLVRSGAVDIVVVDSVAALTPKAEIEGEMGDSL
PGLQARLMSQALRKLTASINKANTIVIFINQIRHKIGVM.YGSPETTTGGNALKFYASVRLDIRRTGS.VKARD.EIVGN
NVRVKVVKNKVAPPFREVEFDIMYGEGISKLGEVIDLGVKAGIIDKAGSWFSYGSQRIGQGRDNVREFLKNNPDVAADIE
KAVRK
>SP|P16971|RECA_BACSU/3-322
DRQAALDMALKQIEKQFGKGSIMKLGEKTDTR.ISTVPSGSLALDTALGIGGYPRGRIIEVYGPESSGKTTVALHAIAEV
QQQR.TSAFIDAEHALDPVYAQKLGVNIEELLLSQPDTGEQALEIAEALVRSGAVDIVVVDSVAALVPKAEIEGDMGDSH
VGLQARLMSQALRKLSGAINKSKTIAIFINQIREKVGVM.FGNPETTPGGRALKFYSSVRLEVRRAEQ.LKQG.NDVMGN
KTKIKVVKNKVAPPFRTAEVDIMYGEGISKEGEIIDLGTELDIVQKSGSWYSYEEERLGQGRENAKQFLKENKDIMLMIQ
EQIRE
>SP|P42445|RECA_HELPY/6-327
DKQKAISLAIKQIDKVFGKGALVRLG.DKQVEKIDSISTGSLGLDLALGIGGVPKGRIIEIYGPESSGKTTLSLHIIAEC
QKNGGVCAFIDAEHALDVHYAKRLGVDTENLLVSQPDTGEQALEILETITRSGGIDLVVVDSVAALTPKAEIDGDMGDQH
VGLQARLMSHALRKITGVLHKMNTTLIFINQIRMKIGMMGYGSPETTTGGNALKFYASVRIDIRRIAS.LKQNE.QHIGN
RAKAKVVKNKVAPPFREAEFDIMFGEGISKEGEIIDYGVKLDIVDKSGAWLSYQDKKLGQGRENAKALLKEDKALADEIT
LKIKE
>SP|O52393|RECA_CHLTE/17-338
ARLKQLNLAIETLEKQFGKGAIMRLGDDSAVMHVQVISTGSMALDYALGVGGLPRGRVTEIYGPESSGKTTLALHAIAEA
QKNGGIAALVDAEHAFDPTYARKLGVDINALLVSQPESGEQALSIVETLVRSGAVDIIVIDSVAALVPQAELEGEMGDSV
VGLQARLMSQALRKLTGAISKSSSVCLFINQLRDKIGVM.YGSPETTTGGKALKFYSSVRLDIRKIAQ.IKDGE.ELVGN
RTKVKVVKNKVAPPFKTAEFDILYGEGISVLGELIDLAVEFGIIKKSGAWFSYGTEKLGQGRENVKKLLKEDETLRNTIR
QQVRD
>f_succinogenes_s85-ORF03043/15-335
EKAKAVEAAIAQIEKNYGKGSIMALG.QQPVEDIPVIPTGCIQLDMALGVGGFPRGRIIEIYGPESSGKTTLALHAIAEA
QKLGGVAAFIDAEHAFDAVYARKLGVDIESLLVSQPDTGEQALDIAETLVRSGAIDIIVVDSVAALVPQAEINGEMGDNH
VGLQARLMSQALRKLTGILSKSNTCMLFINQLRMKIGVM.FGNPETTTGGNALKFYATQRIDIRRIAA.IKNGE.EVIGN
RTRVKIVKNKVAAPFTQCEFDILYGVGISREASILDLACELDIIQKSGSWFSYNNERIGQGRENTRLFLKDNAELCSEIE
QKIRE
>OMNI|PG0881/13-333
KKLQALRMATEKIEKTFGKGAIMNMG.ANTVEDVSVIPSGSIGLDLALGVGGYPRGRIIEIYGPESSGKTTLAIHAIAEA
QKAGGLAAIIDAEHAFDRTYAEKLGVNVDNLWIAQPDNGEQALEIAEQLIRSSAVDIIVIDSVAALTPKAEIEGEMGDNK
VGLHARLMSQALRKMTGAISKSNTTCIFINQLREKIGVL.FGNPETTTGGNALKFYASIRIDIRKSTP.IKDGE.EIMGH
LTKVKVLKNKVAPPFRKAEFDIVFGEGISRSGEIIDLGVELDIIKKSGSWFSYGDTKLGQGREAAKEMIRDNEELAEELT
EKIRE
>OMNI|NTL01TE2088/12-331
EKRKALEFAISQIERSFGKGSIMRLG.DATSMKVETISSGALTLDLALG.GGLPKGRIIEIYGPESSGKTTLALHAIAEV
QKAGGVAAFVDAEHALDPTYAAALRVDIQNLLVAQPDTGEAALEIVDQLVRSTAVDIIVVDSVAALVPRAEIEGDMGESH
VGLQARLMSQALRKINGNISKTGCTVIFLNQLRQKIGLT.YGNPETTTGGVALKFYASVRLDIRRVQT.LKKGT.EEFGI
RAKVKVAKNKVAPPFRIAEFDIIFGKGIANLGCILDMAEEVGVITRKGAWYSYNGENLAQGRDNTINYMEENPSFAQEIE
QQVRQ
>SP|O67905|RECA_AQUAE/7-327
EKKKALEVALSNIEKRFGKGAVMPLKSVEKVQ.VETIPTGSLALDIATGVGGIPKGRITEIFGVESSGKTTLALHVIAEA
QKRGGVAVFIDAEHALDPKYAKKLGVDVENLYISQPDYGEQALEIAESLINSGAVDVIVVDSVAALVPKDELEGEMGEAQ
VGKQARLMSQALRKLKGAVHKSNTALIFINQIREKIGVM.FGNPETTPGGRALKFFSDMRLEVRRLGD.VKEG.GEKKGY
RVKVRVVKNKLAPPFQEAEFDIIYGEGICKLCDLIEVATNLGIFTKSGSWYSYGDKRLGQGKEQVKKYLQEHPELIDEID
QKVRE
>SP|P48287|RECA_CHLTR/5-327
DRKRALEAAIAYIEKQFGAGSIMSLGKHSSAHEISTIKTGALSLDLALGIGGVPKGRIVEIFGPESSGKTTLATHIVANA
QKMGGVAAYIDAEHALDPNYAALIGANINDLMISQPDCGEDALSIAELLARSGAVDVIVIDSVAALVPKSELEGEIGDVH
VGLQARMMSQALRKLTATLARTNTCAIFINQIREKIGVS.FGNPETTTGGRALKFYSSIRIDIRRIGS.IKGGENFDIGN
RIKVKVAKNKLAPPFRTAEFDILFNEGISSAGCIIDLAVEKNIIDKKGSWFNYQDRKLGQGREAVREELKRNKELFHELE
RRIYE
>OMNI|NTL01FN1123/22-342
GKEKAVKDAMAAITKGFGSGLIMKLG.EKSSMNVESIPTGSINLDIALGIGGVPKGRIIEIYGAESSGKTTLALHVIAEA
QKQGGTVAFIDAEHALDPVYAKALGVDIDELLISQPDYGEQALEIADTLVRSGAIDLIVIDSVAALVPKAEIDGEMSDQQ
MGLQARLMSKGLRKLTGNLNKYKTTMIFINQIREKIGVT.YGPTTTTTGGKALKFYSSVRMEVKKMGT.VKQGD.DPIGS
EVIVKVTKNKVAPPFKEAAFEILYGKGISKVGEIIDAAVAKDVIVKAGSWFSFRDQSIGQGKEKVRAELEINPELLAQVE
KDLKE
>SP|P42443|RECA_DEIRA/17-338
ERSKAIETAMSQIEKAFGKGSIMKLG.AESKLDVQVVSTGSLSLDLALGVGGIPRGRITEIYGPESGGKTTLALAIVAQA
QKAGGTCAFIDAEHALDPVYARALGVNTDELLVSQPDNGEQALEIMELLVRSGAIDVVVVDSVAALTPRAEIEGDMGDSL
PGLQARLMSQALRKLTAILSKTGTAAIFINQVREKIGVM.YGNPETTTGGRALKFYASVRLDVRKIGQPTKVGN.DAVAN
TVKIKTVKNKVAAPFKEVELALVYGKGFDQLSDLVGLAADMDIIKKAGSFYSYGDERIGQGKEKTIAYIAERPEMEQEIR
DRVMA