HMM Seed Alignment: TIGR02147

Download Alignment

>ORF00507/4-271
...IFEYLNYREFLKDAYEERHASDWRFSHRFIAEKAGFDS..SMFNKILQGKRNLTDRIVDVFASIFCSDEREKAYFAN
MVAFNQAKTHTESRQFLEKLVASKECKVEN.....LAKDQFEYFDHWYHAVVRELVTFYPYVG.DDAALGLMVRPPISAS
QVKSSIALLERLSMIKKNEQTGFYEQTQGLVS.SGFESYNTAVNAYIQQNLDVAQTAMDRFDRGERNLSTLAFGCDEATY
KELVEMVRRFRREVLAKVGACQKPNR.VFQLGMQLFPLSDP
>ORF00041/1-270
MKPIFEYTDYREWIRDAFEDFKKRKTVISWRYMAMKLGADP..GNLLRISQGKIHLAVNFIKPMAEFFELDEKEAAYWSE
LVYFGRAKSDQEALNHYEKMQALKGIPLKR.....LAKKELEFYRHWYYNAIRSVIGICNFKD.DYEGLAECCTPAITVE
QAKDAIKLLHDLNMISEGK.DGYWKVNDTFVS.TGGNWRSEAVRTFQKETIRLAGESLERHAPPLRDISTVTMTFNMNDI
QLIREKIKEFRSDLLRLSQDGTGDDT.VFQLNVQLFPLAFT
>ORF04046/21-295
RMSVFEFDDYRAYLRHYFECAQALNRRYSLRSFSDKLGFSSK.DFISRVMKGEKSLTPASIAKIVGGLQFDESEAAYFEA
MVLFCQASNGDERENYKKRMEEITATYRFTQQMLLTRAYQYEVYSHWYYSAIRSIIGMIGFDG.DYDALGARLMPPISGE
QARQAVDLLERVGLIKKDA.KGNWILNNPAIS.TGDKVIQQAFINYHKEFIDLAKESITNVPSTERNVSSVTLGISEASY
KKIVKCINEFRKKISMIANEDEDGGR.VFQMNIQIFPLSK.
>ORF01586/1-272
MMNVYAYYNYRKYLQDYYDYRKSVQRYFSYRSFAKKAGYSSS.GLYLDLIRGRKSLTQQMIPKFIEALGLNEREGRYFTL
MVDFTHATTASSKQQIFDQMSALLPRTIKN.....LTKNQQEYYSKWYYVVAREALAVLKINDKNIQELALFLNPKISLP
QAKQTIQLLLNLGLIELGE.DGFYHSVNKAIT.NGSEIAPLFVHQFQKQMIDLGKDALDHYSTERRNVSCMTMSVSAQGL
ERIISKIDLFRKEIVDIVRSDEGESM.VCELNIQFFPLSKE
>ORF04386/4-275
FIDIFQFTHFRKYLDEYQAARVQTDPEFTRAGACALLGLPKTRSYYNDIVKGK.KLTGRMIPKFVEVLGLNKKEAKYFET
MVNFDQAKTTTERNAFFDELIKQHPDPHH.....ILNEDAYEYYNHWYNSVLFTALDVMDVS.DDLEPIQKRIFPKVSVG
TLKRSLELLERIGFVRKNE.DGFWKSSRDSVS.SGAYNNNDLVRQYQLQCFELSKQALLADDDNPSDMGTFTFSVSDDAY
KEIALEIQNLKAKVRKIITQDKKEATGVHQLNIHLFTNLKK
>ORF03891/1-270
MKPITEYQDYREFMRDFYEERKRSS.LFSWREFSKLAGFTSP.NFMQLVCEGKSRLSKTGVEKVADAMELAGADRDYFLA
MERFGDAKNDASKIQAFNEMQKIAKENRLR....VVDAEAFKYFESWVNPVLRELAPIMPGA..KPLELARKCYPVVSAA
EVRHSLDFMCHAEFLKKVG.EDTYVQTEKVVT.GSSEAIPLALRSMNRQMSKLATEAIDEIPPEKRHIAGVTLGISEETY
QWLVQKLETLRQQVVAMAAKEKEYDK.VYRLNIQLFPLTKG
>ORF01658/24-293
MKDIVKYTDYRKYIQDYYDERKRTS.AFSWHMFAQKAGFSSD.VYLKYVCEGKKNLSVGSAGSVASAMGLVGFEQTYFVL
MVSYAHAKDDKTKRAAFEERCALALAHKMR....VLGDEEFNYFKSWKNSVIRELAPHMPGA..KPLEMARACKQKISAT
EVSETLDFLVKAKLLKKDR.NGNYQQTDKAIRMAPVEAVPLAARDLQRQMGEFAIQSLD.LPLSERMMSGYTLGLTRRAY
ERIKKEVDEFYRRIVAIATEEDETER.VYRLNVQLFPMSEW
>ORF02517/10-280
EPDVLQYTNYRVYLRDYYEFKKKTVPAFSLRFFAEKAGLSSH.AHLKLTIDGKRNITKNTVVKLIHGLGLDGQRAAYFES
LVFFNQAQTDADKQVYYAQLLKASPRSKLH....KMDAAQFRIFREWHHSAILEMVALKDFRP.IPDWISKRLGGLITPA
QVTESLKLLVELGLLVKT..ANGYRQRDPLIT.TDDEVQDLMVKMYHLQMLKLSADMLSALPGSQRDVSALTFSIKREDF
PNLKKHLQLMRKELLDFSAKAGEGED.VVQINIQLYPLTRG