HMM Seed Alignment: TIGR02177

Download Alignment

>PIR|C72519|C72519/15-310
SDWCPGCGDFGILAAMQKAFAELNLDPAQTVVVSGIGCSSKTPHFINVNGVHTIHGRGIAFATGIKLANPQLKVIVNGGD
GDLLGIGVAHFVALGRRNLDVTVLIHNNKVYGLTKGQASPTLRRGEKVKSLPVPNLQDAVNPIALAIASGYTFVARAYSL
WVDHLKEILKAAINHKGSAVIDVLQPCVTYNDIYTAEFYKDRLYKLEDDPSWDPIVRD...PSEDEEKKAAAIKKAEEWG
.....TRIPVGVFYVNPLKDTYEERLAQRNPSYSIDNPPALQPISREDGSPIVGPDEFRKIFKR
>GB|CAC11903.1|10640051|TACID3/13-305
VDWCPGCGDFGILTALTSALQELNLGPHDVAVISGIGCSGKTPHYVNAAGAHTLHGRAIPVAVGVKLTNPKLKVIVTGGD
GDLMSIGAGHLVAEGRRNSGITVLMYDNAVYGLTKGQAAPTLKLGVQTKSLARPNIYDAINPIMLAISTGYSFVARGFSF
EIAHLKNIIKQAVMFPGSSFIDILQPCPTYNNINTMDWYKKRVYKLDDDKSWDPVVTE..NDPKAEEKYNRAIEKSFEWG
.....DRIPIGVFYVNKKIPPFTERLKQYVDNY.ENVPPAAQDVKSPDGRPIVDP...FETFKD
>gi|46199894|ref|YP_005561.1/9-295
PDWCPGCGDYGILSALQMALFELRLDPSRTVVFSGIGCSAKTPHYLNVYGVHTLHGRVLPIAQGAKLANPHLTVVAVGGD
GDGLGIGAGHFVAAGRRNVDMLYILYDNEVYGLTKGQAGPTLGLGEKPKSLPRPNPQGKVNPLLLAFASGYTWIARGYAY
DVKGLKELIKEGIAHRGLAFLHVLQPCPTYNDLHTKEWFAPRLYRLEEE.GYDPLVPPGLPPEALEARMARFQQKALEWG
.....ERIPVGVFWKAELP.TFEARLKAYLPRY.PEAYPARGPET.....PLD....LEGLLQE
>PIR|H72626|H72626/14-304
VQWCPGCGDFGILNSIYRAVSELGIDPENLAVVGGIGCSGRTTYYVKGSNFHALHGRAIPVATGVKLANPHLNVIVAGGD
GDLMGIGGGHFVALGRRNLNITVLLFDNAVYGLTKGQAAPTLPAWVKTKALSMPNIHDNINPVLLAFAAGYTFIARGYAY
HTQQLKELIKTAVRHRGAALVDILQPCPTYNNIMTNKWYEERIYYVDQEEGYDPIIR...TPEEFQKKAPAIAAKLMEFG
.....DRIPLGILYWNQTRESFEERLEKIMPGY.MSAPPATRRIELE.GKPFLHP...FDIFKD
>PIR|C72288|C72288/11-279
IAWCPGCGNFGIRTALMKALEELNVDPRQVVIVSGIGQAAKMPQYVGVNMFNGLHGRALPVATAIKTTNPNLLVIAESGD
GCMYGEGGNHFIHTIRRNPDIVNIVHDNQVYGLTKGQASPTSLKGFKTPVQVDGVILEPFNPLAVAIALDASFVARTFIG
DIEFTKDILKEAMKHKGYALVDILQPCVTFNKLNTYEWYRENTYYLKD...HDPTDR............ELAFKRAIET.
.....EKLPLGIFYVNKNKETF.EELARKGDRT....PLYEYEVN......FEK...LKELIES
>PIR|A97203|A97203/11-282
TAWCQGCGNFNILSSLKESLTELKLNPHQVLIVGGIGQAAKTPQYINTNGFCGLHGRALPPAVGAKIANKDLTVIIDTGD
GDAYGEGGNHFIHNIRRNVDITEFVHDNQIYGLTKGQASPTTDIGHVTEVQPYGSNNVPLNPVLLAITLGAGFVARAFSG
DKNHLKEIMKQAINYKGYSLVDILQPCVSFNKINTFKWYMDRVYKLDNN..YDPSNK............IKAMEKAMEWG
.....DKIPIGILYKDENKKEFSENLEFLKKEK....PLVYSEIK......IDK...IKNFLEE
>GB|AAL63562.1|18160191/17-296
PIWCPGCGDYGILEALRRALAELSLPNEQVVVVSGIGCSSQLPHFMKTYGIHGLHGRAVAIASGIKIANPKLKVVVVGGD
GDGYGIGLNHMIHAARRNIGITYIVSNNQVYGLTTGQMSPTTLKGVKTKTTPYGSIDEPVNPLALALAAGATYVARGFSG
DVAHLAKLIKEALSHRGFALVDVLSPCVTFNKVNTYDWFRARVYKLEES.GHDPRDY............FQAYKKALEWP
TIDPVGKIPIGLFYKTEEKPAYEEEMLKILGGR....APIEAELQP....PLEK...VLELLER