HMM Seed Alignment: TIGR02346

Download Alignment

>SP|P47079|TCPQ_YEAST/9-559
PNAGLFKQGYNSYSNADGQIIKSIAAIRELHQMCLTSMGPCGRNKIIVNHLGKIIITNDAATMLRELDIVHPAVKVLVMA
TEQQKIDMGDGTNLVMILAGELLNVSEKLISMGLSAVEIIQGYNMARKFTLKELDEMVVG..EITDKNDKNELLKMIKPV
ISSKKYGS.EDILSELVSEAVSHVLPVAQQAGEIPYFNVDSIRVVKIMGGSLSNSTVIKGMVFNREPEGHVKSLSEDKKH
KVAVFTCPLDIANTETKGTVLLHNAQEMLDFSKGEEKQIDAMMKEIADMGVECIVAGAGVGELALHYLNRYGILVLKVPS
KFELRRLCRVCGATPLPRLGAPTPEELGLVETVKTMEIGGDRVTVFKQEQGEISRTSTIILRGATQNNLDDIERAIDDGV
AAVKGLMKPSGGKLLPGAGATEIELISRITKYGERTPGLLQLAIKQFAVAFEVVPRTLAETAGLDVNEVLPNLYAAHNVT
EPGAVKTDHLYKGVDIDGESDE.GVKDIREENIYDMLATKKFAINVATEAATTVLSIDQIIMAKKAGGPRAPQGP
>SP|P78921|TCPQ_SCHPO/9-539
SGPQLFREGYRIMQGVEDAVIRNCNAIRELSEITRTSLGPNGKNKIVVNHLQQTFLTNDAATIIRELEVIHPAAKLVVDA
TQQQENELGDAANFVVVFTGELLAKAENMIRMGLTPLEIAKGYEMALSHTMEVLEEICAD..KIETVESEKELIKAIRTC
ISSKQYGN.EDFLSDLVAKAILTVLPKDPSK.....FNVDNIRVVKIMGSSLYNSQVVKGMVFPREPEGTVT...RSKEA
KVAVFSCPLDISQTETKGTVLLHNAQEMLDFSKGEENLIESHIKEIYDAGVRVVVTSGNVNDLVLHYLNRFEILVIRVPS
KFELRRLCRVVGATPLARMGVPMPEEMGSVDVVETIEIGGDRVTVFRQVED.ITRTATIVLRGATKTYLDDLERAIDDGV
NIVKALVKDN..RLIFGAGASDMQLCIRLISVGEKTPGIYQHAIKQYGEAFEVVPRTISENAGLDPTDVISKLYAAH...
....HKENGESIGVDVECEND..GTLDAKEAGIFDVLLAKKSAIRLATETVLTVLNVDQVVMSKPAGGP.KPPGP
>GB|AAP34647.1|33304736/8-543
GIPNLFKSGTAHIRGTQEAVMKNIEACKDLATITRTSYGPNGMNKMIINYLEKLFVTSDAATMMAEMEVQHPAAKLLVLA
ARMQEREIGDGSNYVLVLAGELLKQARGLLELGLHPSEIIKGYVQAADVAMASLDELVTWKVEAKELAKKETIETATFAS
LCSKQLTT.VDILNPLIADACMCVMPKNVKN.....FNVDNVRTCKMMGGSVQHSEVICGVVVNRDTDTSVK...SVLDA
KVAVFTCAIDTATTETKGTVLIKDADELLDYNKSEERMIEASIKAIADSGVKVIVTGGSVGDMAKHFVEKYGMMLIRILS
KFELRRLAKTVKANMQVRLGAVPPEAQGYCAKAYVREVGLQKVTVFEQKKTDLSQIATIMLRGSTKNILNDIERAVDDGV
NVIKSLVKDG..RFLPGGGATEIELARKLAELSNKEKTLSQYAIKKFAQSFEIIPTTLAENAGLKPLDVLTLLYSEH...
.....ESGKKSAGINIDAQDVKQSVKDLAKDRIFDSLPAKKMAIKLATDAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKMGQRK
>GB|AAQ56831.1|34098897/10-540
GIQSMLKEGYRHLSGLDEAVIKNIEACKELSTITRTSLGPNGMNKMVINHLDKLFVTNDAATIVNELEIQHPAAKLLVLA
AKAQQEEIGDGANLTISFAGELLQNAEELIRMGLHPSEIISGYTKAVSKAVEILEQLVETGSETMDVRNKDEVISRMRAA
VASKQFGQ.EEIICSLVTDACIQVCPKNPTN.....FNVDNVRVSKLLGGGLHNSCIVRGMVLKSDAVGSIK...RMEKA
KVAVFAGGVDTTATETKGTVLIHSAEQLENYAKTEEAKVEELIKAVAESGAKVIVSGGSIGEMALHFCERYKIMVLKISS
KFELRRFCRTAGAVAHLKLSRPSPEDLGYVDSISVEEIGGVTVTIARNEEGG.NSISTVVLRGSTDSILDDLERAVDDGV
NTYKAMCRDS..RIVPGAAATEIELAQRLKEYANAEIGLDKYAITKYAESFEFVPKTLADNAGLNAMEIIAALYTGH...
.....GSGNTKLGIDLEEGAC....KDVSETKVWDLFATKLFALKYASDAACTVLRVDQIIMAKPAGGPRRDAAQ
>SP|P50990|TCPQ_HUMAN/10-539
GFAQMLKEGAKHFSGLEEAVYRNIQACKELAQTTRTAYGPNGMNKMVINHLEKLFVTNDAATILRELEVQHPAAKMIVMA
SHMQEQEVGDGTNFVLVFAGALLELAEELLRIGLSVSEVIEGYEIACRKAHEILPNLVCCS..AKNLRDIDEVSSLLRTS
IMSKQYGN.EVFLAKLIAQACVSIFPD.SGH.....FNVDNIRVCKILGSGISSSSVLHGMVFKKETEGDVT...SVKDA
KIAVYSCPFDGMITETKGTVLIKTAEELMNFSKGEENLMDAQVKAIADTGANVVVTGGKVADMALHYANKYNIMLVRLNS
KWDLRRLCKTVGATALPRLTPPVLEEMGHCDSVYLSEVGDTQVVVFKHEKED.GAISTIVLRGSTDNLMDDIERAVDDGV
NTFKVLTRDK..RLVPGGGATEIELAKQITSYGETCPGLEQYAIKKFAEAFEAIPRALAENSGVKANEVISKLYAVH...
.....QEGNKNVGLDIEAEVP..AVKDMLEAGILDTYLGKYWAIKLATNAAVTVLRVDQIIMAKPAGGPKPPSGK
>GB|AAD34470.1|4959731|AF136446/8-534
GINSLLKEGHRHFSGMEEALLKNINACKEISNMTKTSLGPNGMKKMVINHLDKIFVTSDAATIMQEMEVQHPAAKMIVMA
SKMQENECGDATNLVIALAGELLSQAESLIKMGLHPSQIITGYEQALKAAIELLNTLSVF..TVEDPTNLEQVSKALKAS
LSSKLIHH.ADFFAQIVAQACINSKPENDDT.....FDLEFVRVAKILGASIEDSYVQQGLIITRNAEGSIT...RVSNP
KVAVYSCPLDTQQAETKGTVLIQNAKELLNYTKSEESHAESIVKKIADSGINLIIAGGSISEIVLHYVEKYKMMIVKCQS
KFELKRICKALGACPVARLDAPNPEEIGFCDSASVEEIGSQKVTIIKKENQD.CKLNTIILRGSTINFLDDIERAIDDGV
NVYRCLLKDG..KFAAGAGATEAVLSHKLQQQAKSLEDLSQYAFNRFALSFEIIPRILSDNAGLNSNEIIPKLNTAN...
......K.EESYGIDIENGTIR....KSSELAVYDHLQSKIWAVRLAADAAITILKVDQIVIAKQAGGPKMNQQQ
>PIR|A71610|A71610/5-533
CVNSILKDGYRIMKNNEDTILKNIEACKEICNILQTSLGPKCMNKLIINHIHKKIVSSDCITILNDMEINHPVVNILKKL
SETINYEYGDFTNYAFTITCEILDKASFLIQQGFNINDILNGFVLGYKEIEKVLEEMIVW..KVPNFYEEKELIKVLKSV
MLTKNISNNYNFLIQLLAKCISTLMPEKIED.....FDVDNIRVSKLNGGNIIDSEFLMGMVIAREANGIIK...KKENA
NVIVLNCGLEGPTTETKGTVLLHNAEELINYTKGEELQMKKYIDNFKKANVDVIIVNGAISDIAQHFCDTNNIMTLKITS
KFETLRICKLLNISSLIKLSTPQPEDIGKVSSIYVSEIASKKVTIINSKNK...KVGTIILRGATFNLLDEVERCIHDGI
NSIKNAIKGN..AFLHGGGCVEIQLCLALKKYANQLKGVDNYCVKIFAEAFYIIPKILARNAGYNTTDVLNELINEH...
.....NKGNTHSCININKDSH...ITSAQNNHIYDNYNCKKYAIHLAMEAVQTILKIDQIIMSKPAGGPKPRDKN