HMM Seed Alignment: TIGR03140
Download Alignment>NTL01BF1148_B.fragi/1-514
MLDSAIKEQLRTIFAALEANYTFDIT------VSPQHESRTELLELLNDVASCSEKLS--CRINEGKGLE----FTL--L
KGEH--RTGITFRAVPNGHEFSSLLLAILNTDGKGKNFPDEGICNRVKSLKGPVRLTTYVSLTCTNCPDVVQALNAMTTL
NGQIQHQTVDGAINQAEVEALKIQGVPSVFADGKLIHVGRGDFGELLAKLEEQYGTE-----TNSAETSIKKYDVIVAGG
GPAGSAAAIYSARKGLNVAVIAERIGGQVKETVGIENLISVPSTTGSQLADNLKTHMSQYPIDLLEHRQIEKIE----LD
GKDKVLTAKGGERFSAPAVIVATGASWRKLNVPGEAEYIGRGVAFCPHCDGPFYKGKQVAVVGGGNSGIEAAIDLAGICS
KVTVLEFMDELKADQVLQEKLKSLPNVEVLVHSQTTEVVGNGDKVTGIRVKDRKTEEERVISLDGIFVQIGLVANSGIFR
DV-VEVNRPGEIVIDAHCRTNVPGIYAAGDVSTVPYKQIIIAMGEGAKAALAAFEDRMRG
>PG_0619_P.gingi/1-515
MLDKDTLAQVGSYFAQLKKSYTLRLN------AHTSHPSYNEAKEMLDGLASVSDHVR--AEYNAADDFR----IDL--L
VDGA--DSGIGFRGIPGGHEFSSLLLAILNNDGIGRNIPDEGVQDRIRRINGPIELKTYVSLSCTNCPDVVQTLNMIAIL
NPTINHTMVDGSFFPDEVESLGIASVPTVMAGDEVIHVGRGDMAALLNKIEAKYGSV----PAESADKTLRPFDLLVVGG
GPAGSAAAIYSARKGLKVAIVAERVGGQVNETVGIENLISVPYTTGSELASNLNSHIKANTISLFEARTVSSIT----QQ
EGISRVEVTSGEVFTAPALIMATGASWRKLGVPGEKEYTGNGVAYCAHCDGPFFKGKRVAVVGGGNSGLEAAIDLAGICE
HVTVVEFLDVLRADEVLQKKARETANIDILLSTATKEIMGNGQKVEGILLTDRNTGEEKQIALSGVFVQIGLAANTSLVK
DL-VETNSRGEVLIDTSCRTNTPGIYAAGDCTTVPYKQIVIAMGEGAKAALSAFEDRIRG
>NTL02BB2295_B.bacte/1-520
MLDSSLLEQLRSVFGSLENTVELVYE------NS-SHEDQKDLLDMLQSVASTSDKIT--LTQNTSGTSPMPQ-FRI--D
YKGK--HTGIVFKGIPGGHEFTSLILAILNTDGKGKLL-DSVIADRVRRLNKNITIQSYISLTCENCPEVVQALNQIALI
HGSLRHEIIDGGYVQDDIKTLGIQGVPSLVANAKMFHSGRIQLLDLVSKLESTFGVDANAAPSEPVNKNLGHFDVLVIGG
GPAGASAAIYTVRKGLSTAMITEKIGGQVQETKGIENLIGVTYTEGPQLAAQLNQHIASYPVKVLENRRVKKIH----TE
SKVKAIELESGEHLTADAIIVTTGAKWRELGVEGEKEYLGRGVAYCPHCDGPFYKGKKVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVR
EVVVFEYNDQLKADKILVDKLKSLPNVSIVTSAKTEKVIGDGNKVQQIQYLDRSLNKEEKMDLDGIFVQIGLVPNSQFLK
ET-VELTKFGEIIVDEKGRTSAKGIYAAGDVTTTPYKQIVIAMGEGAKAALAAFEDRMYH
>NTL01RSA0246_R.solan/1-518
MLDADVKAQLKAYLERLVQPIELVAS------ID-DSEGSRDMMDLLRDVAAQSGMIA--LTEQRDDAERKPS-FLI--R
RTGT--DVGVRFAAIPTGHEFTSLVLALLQVGGYAPKL-DDDVIEQIRNIEGDFRFETYMSLTCQNCPDVVQALNVMSVI
NPRIQHVAIDGALFQDEVEARKIMAVPTLFLNGEVLGQGRMGVEEILAKIDTGAAAR-----DAEKLNARAPYDVLIVGG
GPAGAAAAVYAARKGVRTGVVAERFGGQVLDTMSIENFISVPETEGPKFAAALEQHVRQYNVDIMNVQRAVKLTPAD-EP
GGLAEVTLANGAVLKGRSIIVSTGARWRNVNVPGEQEYRNRGVAYCPHCDGPLFKGKRVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVS
HVTLLEFGDQLKADAVLVRKLESLPNATILTNAQTTEITGNGEKVNGLRYRHRTNGAEHDVALEGVFVQIGLVPNTEWLD
GV-VERNRFGEIIVDARGHTSVPGVFAAGDSTTVPFKQIIIATGEGAKAALSAFDHLIRV
>NTL09SA0356_S.aureu/1-507
MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVAS------LG-SDEKSKELKELLTEISDMSPRLS----LSEKSLKRTPS-FSV--N
RPGE--ETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKE-KQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVI
NPNITHSMIDGAVFREESE--NIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTA--------DASEFENKEPYDVLIVGG
GPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIE----KT
DEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVN
HVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGE-DHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLK
DA-VELNERGEIVIDCNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN
>NTL05PA1795_P.arcti/1-525
MIDQSLLDAVKSYSANMTRPISFVLG------SG-EHSKRAELVDFLTKIAGTTDKINFDA-QANDDTLPSPISFKVINH
IDGALMDTGIVFSGIPGGHEFTSLILAILQAGGHTLKL-DEGIQKLIKRFNKPLQFQTYVSLSCHSCPEVVQALNQFALL
NDDISNEMIDGALFQEQVEANNIQGVPAVFLNGKPFANGLIDTAKLIEKLQEQFPDL--LAEADDDAEQLEQQDVTIIGA
GPAGVAAAIYTARKGLKVTMVADRIGGQVKDTQDIENLISVPLTTGSELSANFEKHLREYNITLKEHVSVKEISE---TA
DENYSIHLNTGETFETRSIILATGAQWRKLGVAGEEENIGKGVAFCAHCDGPFFKGKDIAVVGGGNSGIEAALDLAGIVK
HVTVLEFADDLKADQVLINKAKEKSNIDIITSAATQEIKATDGKVSSLVYQDRNSNDNKELDVAGVFVQIGLIPNTEFVK
GF-IDLNRFGEIEIDERCRTDRKGIFACGDVTTVPFKQINIAMGEGSKAALSAFEYLVMQ
>gdn1110_D.nodos/1-518
MIDQSLLDAVKQYAQSLSKDVTFVMQ------TG-THSKRDELKTFLEEISSVSEKIH--VIERDFSGARNAISFTL--E
VDNQ--ATGIYFSGIPGGHEFSSLILALLQAGGAALKL-DNSIQNFIRTIDEPLHFETFVSLSCHNCPEVVQALNQFVLL
NPLIHSEMIDGGLFQEEIEKRNIQGVPAVFLNGQSFINGKIDTAKIIEKLLEKYPHF---AQKMAAEEQLPLQDVTVIGG
GPAGSAAAIYAARKGLKVTLIADRIGGQVKDTVSIENLIGTKETTGSKLALQLQEHIQANAIIVKENISVKSVE----TH
EGSHVVILQTGERIQTKTLIVASGAKWRELGVPGEKENLGKGVAYCPHCDGPFFKGKHVAVIGGGNSGIEAAIDLSGIVR
KVSVFEFADTLKADKVLVDSAQSRDNIEIFTGVMTQSIAAENGKVTAIHYQERASGAEKTLALDGVFVQIGLIPNTAFLG
DA-VKRTRFGEIEINGRCETSTAGIFAAGDCTNVPYKQIIIAMGEGAKAALSAFDYLIRQ
>NTL02PA1941_P.acnes/45-563
MLDNALTTQLKTYLEMVREPIVLVPSPYRGDDAA-KSSKSAHMDELLSEIAALSDKVS--V-GKPVDNERTPS-FAI--T
RPGS--PIDIRFAGLPMGHEFTSLVLALLQVGGHPVKE-EQSLIDAVRAVKGEHHFVTYMSLTCQNCPTVVQALNAMAVL
NPNIHHTAVDGGTHTDEVEAKGIASVPAIYLDGEDWGSGRMDMAEILERLDADAAQG-----AKEDLSQRDPYDVLVVGA
GPAGAAAAVYAARKGIRTAMVGSRIGGQVLDTEAIDNLISVPHTTGPRLADALRSHVNDYNIDVIERQTASAIE----TT
GGMTTVHLTDGD-LRARSVIVATGARWRNLGVPGEKEYRTKGVTYCPHCDGPLFTGKKVAVVGGGNSGIEAAIDIAGVVD
HVTVVEFLDALKADDVLLRTLNSLPNVDVITSARTTQILGDGSKVTGLEYEDRTSGDVKTIELAGVFVQIGLLPNTEWLE
GA-LERNQRGEIVIDERGTTSAPGIFAAGDCTTQPYKQIIISMGAGATAALGAFDHLIRQ
>NTL02VVA1051_V.vulni/1-520
MLDQAIKQQLTQYLTNLKQDVRLVVS------LD-DSKGSQDILALANEIADLSPLIT--VVRDDAASTRKPV-MTV--T
NPEK--STALRFAGLPMGHEFTSLVLALLHSGGHPIKL-DAETIEQIAQLDKELDVEVFISLSCQNCPDVVQAFNMMAAI
NPKIRATMIDGALFQDEVKQRDILAVPSVFVNGELFGQGRMSLTEILNKLDDGAAEK-----AAASLNEKDPYDVLVVGG
GPAGAAAAIYAARKGIRTGIVAQRLGGQVMDTMAIENFISVKHTEGPKLAANLGEHLKEYGVDIITEQQAEKLMGAQYTE
DGKIHVNLQSGATLKSNSVILSPGARWREMNVPGEQEYRNKGVAYCPHCDGPLFKGKKTAVIGGGNSGIEAAIDLAGIVE
HVTVLEFADTLRADQVLINKANSLPNVDIITMAQTTEVVGDGKRVTGLKYKDRNTDEIKQLDLAGIFVQIGLVPNTEWLK
DSDVELSARGEIEIGSRGETSLEGVFAAGDATTVPYKQIIIAMGEGAKASLGAFDYLIRK
>NTL01LL0346_L.lacti/2-509
ILDETLRAQLMPYMDLLENPIILKVD------ADLESENGKKIVEFTDELASLSEMIS----KETAKLNRKTA-FSI--E
REGV---SGVLFSGLPLGHELNSLVLALVQVSGRPPRI-EQELVERIQAIQNPLHFETYVSLTCHNCPDVVQALNTMSIL
NPNISHTMIEGGMFQEEVEAKGIMAVPTVFKNGEEFHNGRASLEELLEKITGPE--------SSEAFFDKDPYDVLVVGG
GPAGASAAIYAARKGIRTGLIAERFGGQPLETLGIENLIGTPYVEGVQLGRQLEEHVKKYPVDLMNLQKAVKL-----EK
KDLIEVSLENGALLKSKSVIISTGARWRDLGIPGEQEFKTKGVAYCPHCDGPLFAGKDVAVIGGGNSGIEAAIDLAGLVR
HVTVLEFLPELKADKILQEKLATLNNVTVLTNVETKEILGD-DKVRGLNYQVRGSKETVHLELAGVFVLIGLVPNTQWLE
GT-IDLSARGEILTDKVGATNLPGVFAAGDCTDSVYKQIIISMGTGATASLGAFDYLIRN