HMM Seed Alignment: TIGR03385
Download Alignment>SP|Q6GIB7|CDR_STAAR/2-433
KIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVI
AINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASANSLGFES----DITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGY
VSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKI-NKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIDAINGNEI---TFKSGKVEHYDMII
EGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYVIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDT
IEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELK--QFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGA
DKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIG
>SP|Q8CPT6|CDR_STAES/3-434
KIIIVGAVAGGATCASQIRRLDKESEIIVFEKDRDMSFANCALPYYIGNVIEDRRKVLAYTPNQFYDKKQITVKTYHEVI
QINDERQTVTVLNHQTNQTFEESYDTLILSPGASANRLNTHS----DISFTVRNLEDTETIDTFITNTKAQRALVVGAGY
ISLEVLENLHHRGLDVTWIHRSTNI-NKLMDQDMNQPIIDEIEKRNITYRFNEEISHVNGHEV---TFTSGKVENFDLII
EGVGTHPNSQFIKSSNVILNDKGYIPVNHNFQTNIPNIYALGDVITSHYRHVNLPAQVPLAWGAHRGASIIAEQLSGNSS
IHFKGYLGNNIVKFFDYTLASVGIKPNELK--NFDYDMVEVKQGAHAGYYPGNSPLHLRVYFEKDSRKLIRAAAVGKQGA
DKRIDVLSMAMMNNATVDDLTEFEVAYAPPYSHPKDLINLIG
>OMNI|BA_0774/4-443
KIVVVGGVAGGASVAARLRRLSEEDEIIMVERGEYISFANCGLPYYIGGVITERQKLLVQTVERMSKRFNLDIRVLSEVV
KINKEEKTITIKNVTTNETYNEAYDVLILSPGAKPIVPSIPGIEEAKALFTLRNVPDTDRIKAYIDEKKPRHATVIGGGF
IGVEMVENLRERGIEVTLVEMANQV-MPPIDYEMAAYVHEHMKNHDVELVFEDGVDALEENGAVV-RLKSGSVIQTDMLI
LAIGVQPESSLAKGAGLALGVRGTIKVNEKFQTSDPHIYAIGDAIEVKDFVTETETMIPLAWPANRQGRMLADIIHGHTD
SLYKGTLGTSVAKVFDLTVATTGLNEKILKRLNIPYEVVHVQANSHAGYYPNATPVLIKLIFNKDSGKIYGAQTLGRDGV
DKRMDVIATAIKANLTVLDLPDLELSYAPPYSSAKDPVNMVG
>OMNI|BB_0728/3-440
KIIIIGGTSAGTSAAAKANRLNKKLDITIYEKTNIVSFGTCGLPYFVGGFFDNPNTMISRTQEEF-EKTGISVKTNHEVI
KVDAKNNTIVIKNQKTGTIFNNTYDQLMIATGAKPIIPPINNI-NLENFHTLKNLEDGQKIKKLMDREEIKNIVIIGGGY
IGIEMVEAAKNKRKNVRLIQLDKHILIDSFDEEIVTIMEEELTKKGVNLHTNEFVKSLIGEKKAEGVVTNKNTYQADAVI
LATGIKPDTEFLEN-QLKTTKNGAIIVNEYGETSIKNIFSAGDCATIYNIVSKKNEYIPLATTANKLGRIVGENLAGN-H
TAFKGTLGSASIKILSLEAARTGLTEKDAKKLQIKYKTIFVKDKNHTNYYPGQEDLYIKLIYEENTKIILGAQAIGKNGA
VIRIHALSIAIYSKLTTKELGMMDFSYSPPFSRTWDILNIAG
>OMNI|NTL02SS2081/3-431
RLIIIGGGAAGMTAASWVRRLKPNMHVTVFESTKMVSHAPCGIPYFTEGLFDDENLFMTYTPEYFIEKRKINVKTNSKVE
EVDLRSRIVVVRENQEKRKYE--FDYLLFSTGARPKKINAEG----DRIFYVHHPAEASYIRQKL--WSFNRIAIIGGGI
LGIEMAEALRARGKKIVLIHRGRYLLNKMLDEDMGKIVTDKVESE-IELKLNESLVSVIEEGRV--VITDKGKYDVDATV
VAIGVEPNIDLVKD-QLKIGQTGAIWADNHMRTSVENVYAAGDSTESINIITKKPDWVPFAPVANKMGFVAGNNIGGK-D
VTFPGVVGTMITKFEEFIIGKTGVTENEAKRYNIKTVSAIVHHKTRARYYPGSKDIIVKLIAEADTMRIIGAQIVGEEEV
LGRLNMMAAVIQKGFTAEDLFFVETGYVPPVNRVWDVVTLAA
>SP|Q8U1M0|CDR_PYRFU/5-437
KVVIIGGGAAGMSAASRVKRLRPEWDVKVFEATEWVSHAPCGIPYVVEG-IAPKEKLMHYPPEVFIKKRGIDLHLKAEVI
EV--ETGYVRVRENGEEKSYE--WDYLVFANGASPQIPEIEGV-DLPGVFTADLPPDAVAITEYMEKNKVEDVVIIGTGY
IALEMAEAFVTRGKNVTLIGRSERVLRKTFDKEITDIVEEKLRQH-LNLRLHEKTLSIEGRERVEKVITDGGEYKADLVI
IATGIKPNVELAKQLGVKIGETGAIWTNEKMQTSVENVYAAGDVAETKHVITGKRVWIPLAPAGNKMGYVAGSNIAGK-E
IEFPGVLGTSITKFMDLEIGKTGLTENEAVKEGYDVRTAFIKANTKPHYYPGGREIWLKGVVDNETNRLLGVQAVGAE-I
LPRIDSAAAMITAGFTTKDVFFTDLAYAPPFAPVWDPLIVLA