HMM Seed Alignment: TIGR03559

Download Alignment

>OMNI|NTL01ML0348/9-336
KLGLQLGYWAAQPPGNAAELVAAAEGAGFDAVFTGEAWGSDAYTPLAWWGSSTQRVRLGTSVVQLSARTPTACAMAALTL
DHLSGGRHILGLGVSGPQVVEGWYGQPFPK-PLSRTREYIDIVRQVWAREAPVVSDGQHYPLPLTGAGATGLGKALKPIT
HPLRADIPIMLGAEGPKNVALAAEICDGWLPIFFSP-RMADMYNEWLDEGFARTGARRSREDFEICASAQIVVTE--DRA
AAFAGIKPFLALYMGGMGAEGTNFHADVYRRMGYAEVVDEVTALFRSNQKDKAAEIIPNELVDSTMIVGDVDYVCKQIAA
-WSAAGVTMMMVS
>OMNI|NTL01NF0527/3-330
KFGLQLGYWMAQPPANAGELVVAAEAAGFDAVFAAESWGSDAFGPLMWWGSRTERVRLGTSVVQLSARTPAATAMHALTL
DHLSGGRAVLGLGVSGPQVVEGWYGQPFAK-PLQRTREYVEIIRKVLAREAPVTSDGPHYPLPYTGPGATGLGKPLKPIV
HPLRADLPIWLGAEGPKNVALTAEIADGWLAIYFAP-RLADMYHGWLDEGFARPGARRTREDFEIAASCQVVITD--DPA
AELERMRWIMALYIGGMGAPELNFHAQVYRRMGYDREVDEIGALFQAGKKAEAAAAVPDELILDTAIIGDENHVREQLKV
-WEAAGVTMMLVS
>OMNI|NTL05RS4640/2-329
KLGLQLGYWGAQPPANVPELIAAAEAEGFDAVFAAESWGSDAFTPLAWWGSSTRRVRLGTSVVQISARTPTSTAMHALTL
DHLSGGRAILGLGVSGPQVVEGWYGQPFTK-PLARTREYVSIIRKVLSREEPVTSDGPHFPLPYTGAGSTGLGKPLKPIT
HPLRADIPIWLGAEGPKNVALTAEIADGWLAIYYSP-RLAPMYNEWLDEGFARPGARRSREDFEVAATCQVIVTD--DRA
AAIAGLKPITALYVGGMGAPELNFHAQVYTRMGYGEQVEEIGRLFRAGRKDEAAAVVPDEMVTETMIIGNVDEVRADVKR
-WADAGVTMLLVS
>OMNI|GSCORF1500/2-321
RLGLALGYWGRGPTPGHLDLAREAERLGYASVWTAEAWGSDAFTPLTWIAAHTSRIRLGTAVAQMAARSPTATAMQALTL
DHLSGGRMMLGLGLSGPQVVEGWYGRPFPRSPLTATREYVEVIRQVLRREGPVALAGRFHSHPYRGADGTGLGRALKPIT
HPLRAGLPLLLGAEGPKNVAQTLEIADGWLPLYWSP-RRTDAYGLSPAA---------VPAGFVIAPLVRAQVCD--DLA
EGLLPVKAMLGFYIGGMGHATRNFHADLMARMGYEEAARRVQRLFAEGRRNEAVQAVPDAFADEISLVGPRERIAERLAL
-WRAGPVTDLLVT
>OMNI|NTL05RS2621/2-327
KLGFHLGYWSTAPSDDERAAFSLAESLGYDSVWTAETYGSDCLTPLAWYGASTSTVRLGTNILQMSARTPAATAMAAMTL
DHLSRGRFILGLGVSGPQVVEGWYGQPYPR-PLARTREYVELVRKFVRRDEPVSHDGSFYQLPLQG--GSGLGKPLRSMI
HPIRTEIPIYLGAEGPKNIALAAEIADGWLPIFYSP-RMDDFYRGALEEGFSKPGARRSLDDFDIAATVPVVIDD--DIE
KAADVIRPNIALYVGGMGAKEANFHNQVFVRMGYEAECARIQRLYLEGRKSEAIASVPLAMVEDVALVGSRDKIKEDLVR
-WEKTAVKTLLLQ
>OMNI|NTL05RS0400/2-328
RVGIAAGYWGSGPPRNVGRMLAEAEALGVDSFWTAETYGSDALTPLAWWGAQTSTIKLGTSVCQMSARTPTALAMAALTL
DHLSGGRVIIGIGASGPQVVEGWYGQPYPR-PLERTREYIEIMRQVWAREKPVTYSGRHYQLPVQG--GSGLGKPLKSIV
HPLRGDIPVYMGAEGPKNVALAAEIADGWTPLWFSP-KSDEFYRKALAEGFARDGARRTAEDFEIANVCWLVEND--DVE
KAASRLKPTVALYAGGMGAKGANFHNDVFARMGWGEVCAEIQELYLSGRPDLAAQAVPTEMVEDVALIGPADKIIEEIET
KWKNTCLTTLILG
>OMNI|NTL01TF0980/2-328
QISMPLTY--SGDIKQAVDQVVELEKVGLDTVWVAELYGFDSVSLMGYIAARTERVQIGSAILPLYSRTPTLIAQTAAGL
DYLSNGRAILGLGASGPQVIEGWHGVPYTK-PLARTREVIEICRKVWARQGPLTHEGSVFQLPLPPDQGTGLGKPLKIIN
HPVRDRIPIFVASLGVKNVEMTAEIADGWLPHLFIPEKAPQVWGEALAAGKAKRSP--ELGELQIAAGGLLAIGEGEETK
KLLDLARPMIALYVGGMGAKGKNFYNSVARRYGYEEAAERIQDLYLAGKKEEAAAAVPDEMVELTNLVGPESYVRERIEA
-FREAGVTHLNLI
>OMNI|NTL02SC6497/2-324
ELSSPLTY--TGDPRTAADRAAALESAGLDAVWVAEAYGFDSPTIMGYLAARTERMRIGSAVLNVYSRSPALIAQTAAGL
DALTGGRALLGIGASGPQVVEGWHGRRYDR-PLGRTREVIELSRRIWRRE-VIEHRG-ITDLPLPPEKGGTLGKPLKLLT
HPVRDTIPVYVAALGPANVRMTAELADGWLPFLYAPEHAAQVWGPSLAEGAAKRDP--ALGPLAVVAGGLLAVDD--DAE
AVHDLMRPTVALYVGGMGAPGRNFYHDLICSYGYEAAAAAIQEHYLAGRRKEAETAVPAELLARICLAGPEGHVRERVEA
-FRESGVTMLNVT
>OMNI|NTL04MS1519/2-326
RIGTVLDF--GRPMSDVGDEIAAWEAAGLSSVTLGEAYSFDAPTQLAYLAARTKSLELATGVLPLDTRTPTLIATTAAGL
DYVSAGRARLGLGPSGPQVVEGFHGIPFAD-TLGKTRETIEICRSVWRRE-TLVHEGRHYRVPLDPSRGTGLGKPLKLIN
HPVRERIPISIASLGPRMVELTAELADAWEPIFFYPEKLQDVWGEALARGTAKRQP--DLGPLEIIARAPLAVTDG-DSS
AWVDAAKPQLALYVGGMGSREKNFYNQLVASYGFAEEAAVIQDHFLAGRAKEAAAAVPDELVHATALIGDADHIRQRLTV
-LHEAGVTLVNVT
>OMNI|NTL01FS2391/5-328
RIAMSLGY--SGGFEETVSGLADYEKAGLQVVQVAEAYSFDAVSQLGFLAARTSRVEIASGIMQLYTRTPSLIAMTAAGL
DFVSRGRFTLGIGASGPQVIEGFHGVPYDA-PLGRTRETIEICRKVWRRE-VLEYHGHHYDIPLTAGRGTGLGKPLKIIN
RPVRDRIPIVLAALGPKNVELAAELAEGWMPAFYLPDSADEVWGEAVRAGTAKRDP--ALGTLDVWAGASLAVGD--DVT
ALRDTDRPQLALYMGGMGARGRNFYNDLAHRYGYAAEAKLVQDLYLAGRKEEAAAAVPAGLLERLSLIGPRGWVAERLAV
-FAESGVTTLAVN
>OMNI|NTL05RS2236/2-325
RIGMGLNY--SGGFAETVDEVADLEKAGLDIAFVPEAYSFDAVSQIGYLAAKTTTLELASGIFQIYTRTPSLTAMTAAGL
DFVSDGRFVMGLGASGPQVIEGFHGVKYDA-PLGRTREVVEICRKVWRRE-KVEFQGKYYQIPLPAEKGTGLGKPLKIIN
HPVRDRIPIVIASLGPKNVELTAEIAEGWEPIFYHPEKAASVWGEPLAKGKAKRDP--SLGELQVFASPALAIGD--DVE
HMLDWVRPGLALYIGGMGAKGKNFYNDLAVRYGYEKEAETIQDLYLSGKKDEAAAAVPDDLVRAVSLIGPESYVAERVAA
-FAESGVTTLTVT
>OMNI|MAV_0137/4-327
RIGLSINY--AGGFKDVAAEVADLENAGLDIVFVPEAYSFDAVSALGYLAASTQRVELASGILQLYTRTPTLTAMTAAGL
DYVSDGRFTLGLGASGPQVIEGFHGVPYDA-PIGRTREVIEICRQVWRRE-PVQHRGKHYTIPLPADRGTGLGKPLKLIN
SPVRERIPILVAALGPKNVEMAAEIAEGWQPIFYLPEKARDVWGESLAAGRAKRAA--ELGELEIYAGPVLAIGE--NTE
PLREFVKPHLALYIGGMGAKGKNFYHALATKYGYGPQADRIQELYLAGDKDGAAKVVPDDLVRDVNLIGSREFVKERVAA
-FREAGVTTLNVA
>OMNI|MAV_4381/2-325
RIGIALNY--SGGFHEAVDRVVELEKAGIEVAVVAEAYSFDAISQLGYLAAKTSTVELASGVLPLYIRTPSLLAMTAAGL
DYVSDGRFRLGIGTSGPQVIEGFHGVPFDA-PIGRTREIVEICRMVWRRE-RVQYAGRHYQLPLPPDRGTGLGKPLHLIN
HPVRERIPISIAALGPKNVELTAEIAEGWQPVFYLPDKAGSIWGEALAAGAAKRDP--ALGPLDVMVHASLAIGD--DVD
QRLAWVKPQLALYIGGMGAKGRNFYHNLATRYGFGEVADRIQELYLSGRKQQAIDLVPDELVRGMSLVGPRGYVAERMAA
-FAESGVTTLLLS
>OMNI|NTL04MS1137/5-328
RTGIFLSY--AGGFREAVEDVVELEKTGVDIALVAEAYSFDAISQLGYLAAKTSRIELGTGVVPIYVRTPSLLAMTAAGL
DYVSDGRFRLGIGTSGPQVMEGFHGVPFDA-PLGRTREVVEICRKVWRRE-NVEFDGRYYQIPLPADRGSGLGKPLHLIN
HPVRERIPITIAALGPKNVELTAEIAEGWQPVFFYPEKADAVWGDALRAGYAKRDP--ALGPLDVMVSAALAIGD--DVE
DRLQWVKPQLALYIGGMGARGRNFYHNLATRYGFGEVADQIQDLYLSGKKAEAIAAVPDDLVRSVSLIGSKAFVKERLAA
-FVEGGATTLLLQ