HMM Seed Alignment: TIGR03564

Download Alignment

>OMNI|NTL03MA0737/22-288
LVDDAATAERGGFTAFWMPQVPGYLDALTAVALIGQATERIEIGTAVVPIQTRHPMALAQQALTTQ-VACGGRFTLGIGP
SHHWIVNGQLGLPYERPARLTRNYLQVLGAAFAGPGSVDVDNESYCVHSP---VDVT--DSFG-VSILLSALGPTMLQLA
GERADGTILWMADERAIGDHVVPRITAAAGGAGRPAPRVVAGVPVAVCSNSEIDDARAYAGEMLGHAEFSPNYVRLLQHG
DAEDVGDTMAAGDESAVLRRLRRYRDAGATDLAA
>OMNI|NTL01NF2630/19-282
LTDELRRNADEGFDSSWLTHVFG-VDALTALAVAGSRVPDIAIGTAVVPTYPRHPGALAQQARTTALAVGPDRLTLGIGL
SHQMVIENMYGYDFARPVRHLREYLEVLMPLVDG-QPVSFSGETVSANLQ---LSVP--NDDR-VPVLVAALGEQMLRLA
GKRTDGTVLWMTGPTTIRDHIAPTITAAATEAGRPAPRIVCALPVLV--TDDPDGARERAAKVFKIYGSLPSYRAMMDRE
GAAGPADLAIVGTEDQVAERVRTVFAAGATEFVG
>OMNI|NTL01FA5278/15-283
ILERAHEAAEAGVDTVWFSQGLD-IDAITVSALVGREVPGIGIGTAAVPMYQRHPLVTAAQARTAQ-IATDGRFLLGIGL
GNRAVVEDAFGVPFERPIRHLRDYLRVLRSVFET-GAADVQGPTVTARLPTTSPTGPRTGVTPAIPLLVAAMGPQALRAA
GELADGTLPYLAGPRTLAESIVPTIVGAARAAGRPAPTIAVGVPAAV--TADVAGTRAHAERTLAAYGNVPSYRAVLDAE
GAIHPADLALIGDEDAVAAGIRRYLDAGATDVRI
>OMNI|MSMEG_4879/21-287
LAADIQWAEAAGLDSAWMPQVPDDFDCLSMVALMAAHTSTIELGTAVVPLQAQHPVALARQALSVH-AIAEGRLALGVGP
SHHWIIRDMLGLPYDKPAAYTRDYLEVLNASLAGPGPVDVENDTFTVHNP---TALA--AETP-LPVLVAALGPVMLQIA
GELADGTVLWMADERAIGDHIAPRINKAADNAGRPAPRIVAGIPVCLCANSEIDTAKERANRILAEAETSPNYQRLLDRG
DARNVGDLCAAGDEDAILARFKRFADAGVTDLSV
>OMNI|NTL01FA4324/25-287
VLDQVRTAARAGLDSAFLGQLVS-WDALTLAALAGAAVPGIELGTAVVPTYPRHPLALAGQALTVQ-AVAPAGLTLGIGP
SHQQIIEGQFGYRYDRPARHIREYLTALRPLLRG-EAVDVHGETVTAVGR---VDAP--VAVA-PSVLLSALGPVMLRVA
GELADGTVTVWTGPRTIGDHIAPTIAKAAADAGRPAPRVVCSVIACV--TADPDQVRTAVAAQVGFASDLPSYRAILDRE
GLGGVHETVVAGSAEVVERAMRRYADAGATELLV
>OMNI|NTL01FA1563/50-313
LVARARWAAGTGLASLWLGQGYG-LDALTALALLGREIPETALGTAVTIIPGRHPIALSSQARTTQ-AATGGRLRLGLGS
GHRASVEQRYGLPFDRPALRLREYLAALLPLLRE-GAADVRGETVTAVTGGVDARVA--GAAP-PPVLVAALGPAMLRVA
GEVADGTVTWLAGARTVGEYIVPAITDAAA--GRAAPEVAVGLPVCV--TDHPDEVRERAAGALALFDSIPSYRAVLDRE
GVVTAAEVAIIGDERQVERELGRLAAAGATHLLA
>OMNI|MAV_3337/20-284
VIAQARRAHELGVGQVWLAQQQS-YDAIALAALVGAAVPGLGVGTSVVPINPRHPLIVASLAQTAQ-AAAHGRFSLGLGL
GAADLERRTFGTEWPNTITRLREHLTILGSVFHS-GAVDFHGSELSAAPS-FPVRVP--GGTP-IPVYVAAMGPKALQVT
GELADGTLPYLAGPRTIEEFIVPRITKAAAEAGRPAPRIIAAVPVLL--SDDVEGARAAAAQQLSFYETIPSYRNVIARE
GLSNAVELAAIGPEESVLRQVRRYFDAGATDVVL
>OMNI|NTL01FA0553/22-285
LVGQAKAAAAAGLGSVWLGQQYD-LDALTALAALAVHVPGVGLGTAVTVTHSRHPITMSSQAQTVQ-AASGGRLTLGLGV
LHRRPVARRFGIDLDGPATYMREYLCALQPLLRD-GTVVFEGDMITADTSGFSGHVA--GSTP-PVVLVAALGTAMLRVA
GELADGTVTWMAGPRTIGSHIVPAITAAGG--GAAAPQVAVSLPVCV--TDHPEEARRRAAAHLACYADLPSYQAMFDQE
GAANPAEVAIIGDERHLETQLHRLTDAGATRFIA
>OMNI|MSMEG_5732/15-279
LIADARRAHDIGVKQIWLAQQAD-IDAIAAAGLIGAAVPGLGVGTAVVPINPRHPLVISAAAQTAQ-AAAHGNFTLGLGL
GARVIEHYAFGIDRTNTVNRLHEYLQVLRGAFER-GDANFRGAEYSIELQ-WPVQVA--GGTP-IPIYVAAMGPKALRIT
GEYADGTLPYLAGPRTLSEFIVPTINDAAEAAGRPQPRVTAMVPVVL--SDDAETARRTAAEQLAFYATIPSYQKVIARE
GISDLTELAALGSPDQVREKLQSYLDAGATDVVL
>OMNI|NTL06SA0781/19-284
TVRLAHEAAAAGLRSAWFGQTFG-ADSPQLAAVVGREVPGLHVGTSAIPVFGRHPLLVSSQAQTAQ-AATHGRYHLGLAL
GTKLLTEAGFGIPFERPIARLREFLTALRQLTET-GAADFHGELLTAATP-ISARVP--GAEGGVPLLVAAMGPQALRAS
GELADGILPYLAGPRALDEHIVPAVTAAAEAAGRPAPRIVAMVHGVV--TDDADSVREKAVEQLAFYEQIPSYARVIELS
GGQRAADVSVIGDERRVAAEVRRYRDAGATEVVF
>OMNI|NTL01FA5253/24-286
LAAIARTVAAAGVSTAWLPQGYG-YDSIGVLTAVAREVPGIELGTSVVVVQPRHPRVLAGQALTAQ-AAAHGRFTLGLGV
SHPGLLE-IYGQPFHRPVAALRTHLDTLLPILDG-RRV--PGATGIGSDP-AGSAVP--GAGVRVPVLLGALGPTMLRLA
GERTDGTITFLAGPRTIGDHVVPLIGAAARDAGRPAPRVVVGLPVAV--TSAPDRIRTELDAEYADYAALPSYRTALDRD
GFTQPGAIAVVGDEDAVVDQLAAYHALGATDVLV
>OMNI|NTL04MS4934/15-279
IVAHAQRAEADGFSSLWYASAVG-GDPLVAMAIAGRATGSIELGTAVLQTYPCHPLLQANRVAAAANAMGRPGLTLGLGP
SHEPIVRDVLGLSYDHPARNTREYLRIVSGLLAG-VEVDFDGTDWSTHSA---GRMA--ALDHRVPVLLSALSPRMLRIA
AEFADGVVLWMASASAIAGRIAPVLREAANAQGKPAPRIVAGLPVAV--HDDADEARAAISATASSYERMTNYQNIIRAG
GGERAADVGIVGDEGAVARQLAELIDAGATDVWA