HMM Seed Alignment: TIGR03584
Download Alignment>NTL01CJ01253_C.jejun/4-226
LCIIPARGGSKRIPRKNIIDFLGKPLISYSIENALNSGIFDEVVLSSDDEEIIEVALKYGAKAPFVRDKNLSDDYASSTA
VVQNAIEILQSQNQIYDHVCCLYATAPLLNKDILKQAYEKFIQ-NQSKFLFAATEFEYPIQRAFYLNENNQVYMFDEKHY
KSRSQDLTKAYHDAGAFYFGTSKAWLEEDFIFKPHSSVFVLPRNLVCDIDTIQDLEFAKILYKV
>GAMHORF1585_T.autot/3-221
LCVIPARGGSKRIPKKNIKEFCGKPLIAYSIEAAKKSGLFDKVVVSTDDEEIAKVAEKYGAEILY-RPKELADDYTGSGE
VFKHAINELKKN-NGYKFACMIYPTAPFLQVNYLKEGYEKLKN-SDACASFSVTSFEYPIQRAFKIV-NGRCEMFDKSNF
HKRSQDLEVAYHDAGQFYWKKIGC-RSDDVFFGKDTIPIVIPRYLVQDIDTIDDFIRAEIMYEY
>NTL05PA0656_P.arcti/3-225
IAVIPARGGSKRIPRKNIKEFCGKPMIAYSIEAALQSGCFDKIIVSTDDLEIAEVAKSYGAEVPFMRPMELSDDYSGTIP
VIRHAIEWLIKQGFDPELICCLYATAPFVTAEYLQQGFQQLKS-TNAAYAFTVTSYAFPIQRAIKLNPELGVEMFDRNNF
NTRSQDLEEAWHDAGQFYWGRVDAWLTEKIIFGADSTPVILPRHRVQDIDTSEDWDRAEWLFKA
>NTL06PA3076_P.atlan/3-225
LAIIPARGGSKRIPGKNSKMFCGKPLIAYSIEAAKNSGLFDKVIVSTDSQHIADIAIKCGADVPFMRPENLSDDFTGTVP
VVKHAIKFVQEQGEAPSHTCCIYATAPFLQVTALKDGFKRLKADVSKHFAFSVTSFPFPIQRALKMQ-KGGVCPFSPQDI
PKRSQDLEEAYHDAGQFYWGKSEAFLKGIPTFSETSIPIVLPRHLVQDIDTLEDWERAELMYKA
>NTL04SD1288_S.denit/3-226
VAFIPARGGSKRIPRKNIKLFKGKPIIGYTIEAALQSGCFEQVIVSTDDDEIAAVAESFGAIVPFRRPAEFANDHATTMQ
VVIHGIDWMLRNGLAPKKMCLMYATAPFITPVLLQESLALLDANPNKHYCFAVTEFAAPIQRGFSVSPAGDIEMFQPEHL
TTRSQDLIKAYHDAGQFYWGKTDAFLKNLPVFSAHSVPYLLPQHLVQDIDTLDDWHRAEWLFAM
>NTL02PF1520_P.fluor/4-223
VAIIPARGGSKRIPRKNLKPFDGVPMIVRSIRTALDSGLFEQVVVSTDDAEIADVARANGAHVPFMRPAELADDFTGTAA
VIVHALQQL----PAFEYACCVYATAPLLQARFLRQGFELLAQHPDKSFAFSVTDFGFPVQRALTLDGQGGLTALYPEFR
NTRSQDLPAAFQDAGQFYWGRSQAWLGGEVLYSPASLPVILPRYLVQDIDTVEDWKRAEYLYAA
>NT01MC3925_M.sp./11-233
LCIIPARGGSKRIPRKNIRPFMGKPLIAYSIEAALATGLFAQVVVSTDDAEIAQVAQHYGAAVPFMRPAPLADDFTTTAD
VLLHALHSLGGA-QQHPALCCIYPTAPLLQPQDLREAWQLFLQ-KQAHTVMSVTTFAFPIQRALRVEPSGQLQMIQPQHR
TTRSNDLEEAYHDAGQFYWLNSAALVASGQIYGATCYPQRLPRYRVQDLDTLEDWTQAELLYQL
>AHA_4178_A.hydro/3-225
IAIIPARGGSKRIPRKNIRPFCGLPMIAYAIEAARDSGCFSRVVVSTDDPEIAEVARRLGADVPFLRGTALADDHTGTTP
VVIDTIQRLDQLGIQAEHYCCIYATVPLIQAADLRAAHARLLA-SQAPFVYTVAEFGFPIQRAVRMDAQGRVTPFWPEQM
AKRSQDLESAYQDAGQFYWGSRAAWLGGISPVGGEGIGHILPRHRVVDIDTPEDWHLAELLYQV
>NTL02HP0900_H.hepat/4-224
VALIPARGGSKRIPDKNIKPFCGKPIIAYPIITALESALFDEVIVSTDSTQIAQVACEYGAKVPFMRPKELSDDFTPTAP
VAKHAVESLKL--HKEDLLCVIYPTAPLLTQKTLSLGLKALLENPHKLFAFCAVSYYYNPYRSFCIK-NDEIEMLFPKHY
LTRSQDLEQVYHDAGQCYWGYVNAWRESLPIFAPHSSAIIVPSKEVQDIDTLEDWAMAEMKYRL
>NTL01WS1931_W.succi/3-222
IALIPARGGSKRIPHKNIKDFCGRPILAYSIEVAQKSGLFEAIVVSTDDERIAAIAKHLGARVPFLRPAHLSDDSTGTLP
VIAHAAERLEL--GSDDLLCCLYPTAPLLESSSLILGLEAL-E-GEVSYTFGAVRYDYPPQRSFMLKENGAPTMLFPEHF
QSRSQDLNPIFHDAGQFYWARAETWRAQEPIFTPSARAIVLDPLRVQDIDTLEDWKLAEMKYRL
>NTL02CH2722_C.hutch/3-224
VAIITARGGSKRIPGKNIKNFLGKPIIAYSIQAALASKLFDEVMVSTDDEKIAEIARSYGASVPFLRSSSSSDDFATTAQ
VLQEVLGVYKTSGKEYRYACCIYPTAPFVDAQILSEAHTLLME-KGLDSVFPIQRFSFPIQRALVFK-ENKLAWLQPENA
LKRSQDLEVTYHDTGQFYFFNVPAFLASGALLSANSSGIEIDEMAAHDIDTEEDWKVAEFKYTQ
>NTL03HP0330_H.pylor/4-223
IAIVLARSSSKRIKNKNIIDFFNKPMLAYPIEAALNSKLFEKVFISSDSMEYVNLAKNYGASFLNLRPKNLADDRATTLE
VMAYHMKELEL--KDEDIACCLYGASVFLQKKHLKNAFETLKQNQNTDYVFTCSPFSASPYRSFSLE-NGVQMAF-KEHS
NTRTQDLKTLYHDAGLLYMGKAQAFKEMRPIFSPNSIALELSPLEVQDIDTLEDLELAKLKYSR