HMM Seed Alignment: TIGR03665
Download Alignment>RF|NP_126284.1|14520809/39-215
YVKIPKDRIAVLIGKKGQTKREIERRTKTKITVDSETGEVWITSTKETDDPLAVWKARDIVQAIGRGFSPERAFRLLNEG
E.YLEIINLTDIiIGNEK.NALPRIRGRIIGRKGRTRQIIEEMSGASVSVYG..KTVAIIGNPIQIEIAKTAIEKLARGS
PHGSVYRYLERRK.KDLELEGN
>RF|NP_276141.1|15679024/9-184
YIKIPRERVGVLIGKNGAVKAKIERLTQTELEIDSETGAVTLIPQDELEDPLSPWKARHIVRAIGRGFNPEVALRLLDDD
V.ALEVIKITDY.VGKSK.KAIARQKGRVIGREGITRRIIHDMTGVDISVYG..KTVSLIGEFEKLAVAREAIEMILNGA
RHKSVYAFLEKKK.QELKMKEF
>RF|YP_842610.1|116753492/2-174
NIKIPSDRIGAVIGPNGETKRYLEERCSVSLDIDSESGAVTV...TSQGDALDAMRAIDVLRAIARGFSPERAFALLDDD
MLMLDILDLSSL..AATK.NDLIRIKGRIIGKDGKTRELMESLTGARISVYG..KTVSIIGYPEQIKVVRSALEMLIDGA
PHGNVYSFLEKKR.RDLLEMEL
>RF|NP_613798.1|20093951/14-190
RVKIPKDRIGVLIGKDGETKRYIEEKTGVELRIDSKTGEVEIRPTERVKDPLDLIKAKECVLAIGRGFSPERAFRLLREE
DASLEVIDLYEL.VGRNP.KALERQRARIIGREGRTRQLIEELSGADVSIRG..KTVALIGTPRQLQIARKAIEMLASGA
PHGRVYRFLEDQR.RKMKREKL
>RF|YP_001548340.1|159904678/7-180
VVKIPKERTGILIGTHGEVRKQLESELGVELEIDSE.GEVSIYSTEDQEDPLALWKARDIVKAIGRGFNPEKALKLVSDE
Y.AFEVIDISEY..GNSD.KALQRLKGRIIGSGGKSRRYIEELTSTHISVYG..KTVSIIGEIETAKIAKDAIEMLLRGT
SHSKMYKFLERHR.QDVKRSEL
>RF|NP_634036.1|21228114/4-176
YVKIPRERIGVIIGPKGEIKKLIEDKTTCQLEIESDSGKIDV...TCEGDPLKEFRVLETIKAIGRGFSPEKALEILDDE
MLMLEVIDLSDV..ATTP.KELQRIKGRIIGRNGRTRELAESLINVKISVYG..KTVSVLGYPEQNTIIRTAIKMLLDGA
THGAVYKFLEKKH.QELLHSQL
>SP|Q57885|Y443_METJA/18-191
ILKIPKDRVGVLIGKKGNVKKTIEKELGVKLEIDAD.GTVTIYGTDKQKDPLAVWKARDIVRAIGRGFNPEIALKLVSDE
Y.VLEVIDIEDY..ASSD.NSIRRLKGRVIGKEGKSRRYIESLTGANVSVYG..NTVAIVGEHEPVQIAKEAVEMLLRGA
SHAKTYKFLERER.QKIKRARF
>RF|YP_448358.1|84490126/6-181
YLKIPKDRVGVTIGKNGKIKHQLEIITKTELKIDSDTGNIAISSTDETDDPLAIWKARYMIKAIGRGFNPDIALTLENDD
L.ILEIINLQDY.VGKSK.KALVRQKGRIIGKNGRTRQIMHDMLDVEISIYG..KTVSLIGEIENIQMAREAIEMILEGS
RQKTVYAYLEKMH.DKLKRKEF
>RF|YP_565640.1|91772948/3-175
HIKVPQDRIGAIIGPQGSVKKIIEERTTATLDIDSENGTVEV...IAGDDPVGAMRAADVIQAIGRGFNPEKTYIFFDDD
LIMLEIIDLSQT..ASTP.KELLRLKGRIIGKGGKTREIIESLIGVKMSVYG..KTVSAIGHPDQILIVRTAMDMLIGGA
THGAVYSFLEKKK.QDLMRSQL
>RF|NP_280872.1|15791048/3-176
HVKIPTDRIGVLIGDGGETLRRIEAAAEVDIDVDSQDGAVAI...ERTGDPVRGMQAPEIVQAIGRGFKPDEALTLLDDD
MRMFDTIDIGRA..ARND.NDLRRKKGRLIGENGRTRELMEELTGASVVIYG..STFGVIGQPSEVDVARSAAEMLLDGA
PHGSVYSFLERKRsEELKQQGM
>RF|YP_136990.1|55379140/3-175
HVKIPQDRIGVLIGEGGETMREIEERAEVRLDIDSEDGTVKV...ESVGDPVTALKGPDIVKAIGRGFAPDDALALLEDD
MMMFELIDIEAA..SRNK.NDFRRQKGRLIGEGGRTRELMQELSGAAVVIYG..STLGIIGGPEQVDAVREAAEMILDGA
PHGSVYSFLERKH.NEMKHKGL
>RF|YP_001031178.1|124486562/4-176
EVKIPNDRIGAIIGKGGETRKFLEKSLNVTLEIDSQTGLIEI...INEEDTLAEIRSMEVIKAIGRGFSPERAKKLLEDD
DMILTLIDLSDI..ADTP.QKLARIRGRIIGREGKAREQIENMTGALISVYG..KTVGIIGMPDQMNDAHTAITMLINGS
DHNTVFNFLDRKK.KEAKLDVL
>RF|NP_070632.1|11499393/8-178
ELEIPEDRVGVLIGKDGEIKKLIEEKTGCKLTVLGKHNVVKI....ECEDALGFMRARDVVSAISHGFSPDVALKLLYDE
NLVLEVINLSDF...LSD.NALRRIKGRIIGKEGKMRKQIEDMLNVNISISD..KHVAIIGDPENVAAAREAIMMLVEGA
HTSTVIKFMERKR.RDLKTRSL
>RF|YP_503884.1|88603706/4-175
ETRITQERIGVLIGKKGLTKREIEEKTKTRIQVDSEEGLVSI....EGEDADGFIQAVETVKAIARGFSPERAAILLEDP
DLYLEIIELSEY..AGSD.SKIERIRGRIIGRDGRSRAQIQDMTATEISVYG..KTVGIIGTIEQVKIAREAVEMLIKGV
SHESVFSFLEKKR.RELKQDMI
>RF|YP_023029.1|48477323/9-181
SLKIPMNRIAVVIGKNGETKNEIERLGQSVIDIDSKTGLVTV...YQKKDALKALIALNVVQAIARGFSPEKALTLFNEN
M.QLIVISLKDF.AGNNS.NRINELRGRVIGRNGRTRQIIEELTNTYISVSG..NTVSIIGDFIGIGYSKEAVEMLLLGR
KHKTVYSYLEKSV.SEIKFKRM
>RF|NP_147468.2|118431180/11-186
YVKVKPERLGAVIGPRGEVKAEIMRRTGTVITVDTENSMVIVEPEAEGIPPVNLMKAAEVVKAISLGFPPEKAFRLLEED
Q.ILVVVDLKQV.VGDSQ.NHLKRIKGRIIGEGGRARRTIEEMTDTYINVGE..YEVAIIGDYERAMAAKQAIEMLAEGR
MHSTVYRHLERIM.REIKRRER
>RF|NP_393876.1|16081522/12-184
TVRVPKDRISIVIGKDGSTKKRIEENGEVKLTIDSNEGEVSI...DQMGDAIKSNTAKSVVQAIGRGFNPDKAMLLFEDG
M.QLVIISLREF.AKPGS.SRIAQIKARVIGTGGKTRTIIEELTGSFISVYG..DTVSIIGDYLAVTYAEEAINMIINGK
KHRTVYEFLERKA.RELRFRRI
>GB|EDN49934.1|151586511/3-175
HVTVPQDRIGVVIGAGGETMREIEERANVRLDIDSESGSVAI...EELDDPVAALVAPDIIKAIGRGFKPETALSILDHD
LRTLDLIDLSEH..TRND.NDLQRKKGRIIGENGRTRELIEELSGANVVVYG..STVGAVGQPEELEVVRRAVGMLLDGA
PHGAVYSYLERMS.NELDDDVS
>RF|YP_001324790.1|150401024/9-182
VLKIPKERIGVIVGKGGEIKNRIEKELKVEIDIEED.GEITIFSTKEQEDPLATWKARDIIKAIGRGFNPEKSLKLISDD
Y.IIEIIDITEH..ASSD.NAVKRLKGRVIGSGGKSRRYIEELTDTDVSVYG..KTIAVLGDYESVQIAKEAINMILRGN
SHSKMYKYLERHR.QDIKRKEL
>RF|YP_001013574.1|124028254/9-184
YAKVPPDRIGVLIGEGGKVKIEVMKRTRTKITVDSTTGMVIIEPESPDVPPYMVMKAQEFVRAIAYGFSPERAMRVLDDD
Q.VLVVIDLKQY.VGDSP.NHLQRVKGRIIGEKGRARKTIEEMTGTYISIYD..NYVAIIGDFETANIAKQAIEMLIQGR
QHSTVYRFLERTM.FRLRRARM
>RF|NP_376397.1|15920728/2-170
YITVPDDKINLV....KSILGRLEEISNTKIEFDEKTKSIRVI..PKDNNAYEAMKVVSVIKAIGVGFDVDEAMKLMRDD
Y.VLDIIDLKDS..TNGP.EDMKRIKGRIIGEKGKTKKIIQEYTGVNIIITD..HYVGILGTIEQADIAKRAIEMLIKGK
EHSTVYKYLDKAE.RELSLFNV
>RF|YP_001273527.1|148643014/6-181
YLKIPQNRIGALIGNKGDVKKSIEKATETILDIDSEDGTVYITPQENMSDPLGVWNANHIVKAVARGFNPEVALKLVDDD
I.YLEVIKLPLY.IGKSK.NALSRYKGRIIGQNGKTREIIMDMAEVQMAIYG..KTVSLIGEMDNIMIAKEAIEMILKGS
RHKSVYSFLERKK.DELKLKEF
>RF|YP_255621.1|70606751/2-170
YVTVPDERLDLI....KTLSKRIEEISNTTINFDEVTKQIRVI..PKDNNSYNAMKVISVINALGFGFEPNDAMRLMSDD
Y.GLEIINLKEF..TNSV.NSLRRIKGRVIGEKGKTKRTIEEYTGVIVLVKD..HEIGLLGNIEQLSIAKRAIELLIEGK
EHNTVYKYLDKAE.RYAMLSNV
>RF|NP_343734.1|15899129/5-174
FITVEDEKLEVV....KKVIGKLEQFTDTKIIYDERTKTFNIL..PKGQNQYETLKAVSVIRAIGLGFDEQSAFRLLSDE
Y.TLDVIDLKAL.IGSNP.DTIRRVKGRIIGENGKTKRIIQEYTGVDISIYG..HYIGVLGPYDQVQIAKKAIELLIDGK
EHSSVYKFLDKAE.KDLIIYKT
>RF|YP_001405614.1|154151996/4-177
ELKIATSRVGVLIGKGGSTKKELEEKTHTTISIDSKEGLVKVE..AAEENAIPLLRAVEIINALNAGFSPQRAFEMIEDE
DLLLDIIDLSRV..ADNP.RQLDRLRGRIIGKDGRAREQIENMTDVDISVFG..HTVGLIGYPEQMKIARAAIDMLIEGV
PHENVFAFLDKKK.KEAKQDMI
>RF|ZP_01709096.1|126008523/6-178
NIKVPFARIGVLIGKEGTVKAKIEEEGKAKLDIDSENAIVTV...YQKNDPLKALMALNVVQAIARGFNPEKAMLLFDDS
V.QLIVISIKEF.VNKDA.KRIKEIRGRLIGKEGHTREIIEELTGTYISISG..NTVSILGDFISIQYAREAVNMILQGR
KHKTVYSYLEKNV.GELKFRKM
>RF|YP_001048403.1|126180438/5-176
EMKVSTARIGVLIGKSGSTKREIEEKTGITLRIDSEEGLVTL....EGEDPVGVMTATNVVSAINRGFSPERAFRLLDDE
DMMLDILDLADL..SGTT.RQLERLRGRIIGKSGTSRAQIEDMTATEISVHG..KTVAIIGLPDQAETARKAIEMLIQGV
PHEHVYGFLDRKK.KEAKQAML
>RF|YP_930291.1|119872284/11-176
LQPIEKKRIKAA....REFVKLVDGRFGARVELDEKELYIKVKP.GPDVTVDSVLKLREMIKAIALGFTPEQALELENDE
Y.TLVVIDLKEY..TDKP.NHLRRIKGRIIGEEGRARRTIEYLAEVHMVVGD..NYVAILGKMEDVEIARRAVEMLIEGK
KHNTVYKFI.....QGAKGRGS
>RF|NP_963325.1|41614827/1-166
MFSFEIEKKPNII....RNKKKLEERLNIELEEKENSYIVKA......NDGLTLNKAIKIIDALNAGFG.EEAYKLLDDN
Y.DFMVIPIKRA..TKND.KERKRILARLIGTKGKAKKNISNLTGVSVIIDDkkKEAYLLGKIEDLIIARESINRIIEGQ
PHGKVYSFLESNR.RLKKLRDL
>RF|YP_919921.1|119719426/15-188
PVPVEQSRIGYIIGKDGSNKRRLEETFNVKLDVDSATGVVYVEP.GEGATPYNVFRAKKALEAISIGFTVDDALLLGDDA
Y.DLEVIDLSEV..SKRR.EDLSRIKARIIGTEGRFKKTLEDMTGARIVIGE..KAVGIIGDFEQNKVVKEALERLIAGQ
SHQSVMKFLERMS.FELKRRRT
>RF|YP_001582743.1|161528917/6-180
LLRIPNDRIAVLIGKSGNIKSKIEKSCHVSLDIDGETGEVLIKS.DGDVEKIQPFKAMEIVTAIGRGFSPENAMTLLKGE
N.TLHVIDLREF.AGKSN.ANVERIKGRIIGEGGRARRNMENLSSTHISVYG..KTVSIIGDASKLRLAVDAISSISSGS
MHGAVYDKLEAAN.RKEKQEKM
>RF|YP_001190752.1|146303436/2-170
FVSVPDEKLDLV....KSLLDDLSRMGGVEIIYDEKVKNFIVD..PKNQNPYQALKVVSVIRAIGLGVSVSDALKLMGEE
V.MMDVIDLKEI..SNSR.DNMTRVKGRIIGEGGKTKKIIQEYTGVSVVISG..HYITLLGNYEQIPIAKKALELLVKGR
EHSTVYRYLDRAE.QQLIRYRS
>RF|YP_001540802.1|159041550/11-180
EIPLEKAKTLVT....EEVKNSIEVNLKVQVEVKDD..SVVLTP.MQDANPDSVIKARQIIQALALGFSRDDALELLNDD
K.YLDVVDLSDY.IGKDKeNHLSRIKAIIIGEGGKVKRNLEELTETKIAVKD..KAVGIIGNYDNVRAVRDAIVMLINGR
QHSTVYRWLQRWK.RDLNLRRI