HMM Seed Alignment: TIGR04010

Download Alignment

>NTL34EC2271_E.coli/1-404
MSTSIRICSYLLLPLIYLLVNVKIAQLGESFPITIVTFLPVLLLLFLERISVKKLMIALGVGAGLTAFNYLFGQSLDAGK
YVTSTMLFVYIVIIIGMVWSIRFKTISPHNHRKILRFFYLVVGLVVALAAVEMAQIILTGGSSIMESISKYLIYSNSYVL
NFIKFGGKRTTALYFEPAFFALALISIWLSIKQFGIKTPKTDAMILAGIILSGSFSGVMTFILFYLLEWAFQYLNKEAIK
KKLPLALISLAVFLVGVVIAFPYISTRLGDLGTEGSSSYYRIVGPLVMVGYSLTHIDGVVRFGSLYEYVASFGIFNGADV
GKTIDNGLYLLIIYFSWFAVFLSLWYMGKVIKMMINAFGDNRNFRVQLYLFTPVSLFFTGSIFSPEYAFLIVCPFILRKA
LNIT
>NTL06SE2181_S.enter/1-404
MSRSIRICSYLLLPLIYLLVNVKIAQLGESFPITIVTFLPLLLLLFVERISVKKLMIALGIGAGLTAFNFLFGQSLNAGK
YVTSTMLFVYIVVIIGMVWSIRFKTISAHNHRKILRFFYLVVGIVVALAAVEMAQIILTGGSSIMEGISKYLIYSNSYVL
NFIKFGGKRTTALYFEPAFFALALISIWLSIKQFGIKTPKSDAMILAGIILSGSFSGVMTFILFYLLEWAFQYLNKDAIK
KKLPLALVSLTLFLVGVIIAFPYIATRLGDLGTEGSSSYYRIVGPLVMVGYSLTHIDGVVRFGSLYEYVASFGIFNGADV
GKTIDNGLYLLIIYFSWFAVLMTLWYMGKVLKMALNAFGDNRNFRVQLYLFTPVSLFFTGSIFSPEYAFLIVCPFILRKA
LKIS
>NTL04ES2670_E.sp./1-404
MSRSIRICSYLLLPLIYLLVNVKIAQLGESFPITIVTFLPVLLLMYVEKISIKKLMIALGLGFGLTAFNYVFGQSLDASK
YVTSTMLFVYIVIIIGMVWSIRFKTISPHNYRKILRFFYIAVTFIVVLAALEMAQIILTGGSSLMEIISKYLIYSNSYVL
NFIKFGGKRTTALYFEPAFFALALISIWLSIKQFGIKTPKTDAMILAGIVLSGSFSGVMTFILFYLLEWAFQYLNKDAIK
KKLPLAIISLTVFLVGIVFAFPYIATRLGDLGTEGSSSYYRIIGPLVMVGYSLTHIDGVVRFGSLYEYVASFGIFNGADV
GKTIDNGLYLLIIYFSWFAVLLTLWYMFKVFKMMLNAFGDNQNFRVQLYLFTPVSLFFTGSIFSPEYAFLIVCPFILRKA
LNIT
>NTL03CK0702_C.koser/1-404
MSRSIRICSYLLLPLIYLLVNVKIAQLGESFPITIVTFLPVLLLLFIERISIKKLMIALGVGAGLTAFNYLFGQSLDASK
YVTSTMLFVYIVIIIGMVWSIRFKTVSPHNYRKILRFFYMVVAFVVALAAVEMAQIILTGGSSLMEGISKYLIYSNSYVL
NFIKFGGKRTTALYFEPAFFALALISIWLSIKQFGIKTPKTDAMILAGIILSGSFSGVMTFILFYLLEWAFQYLNKDAIR
KKLPLAIISLGVFLVGVVFAFPYIAERLGDLGTEGSSSYYRIVGPLVMVGYSLTHIDGVVRFGSLYEYVASFGIFNGADV
GKTIDNGLYLLIIYFSWFAVLLTAWYMWKILKMTLNAFGDNQNFRVQLYLFTPVSLFFTGSIFSPEYAFLIVCPFILRKA
LNIT
>NTL04CS1123_C.sakaz/1-404
MSRSIRICSYLLLPFIYLVVNVKLAQLGESFPITIVTFLPVLLLLFVDKINLKKLMIALGIGAGLTLFNYVFGKSLDASK
YVTSTMLFLYIVIIIGMTWSIRFKTISPRNYRKILRLFYLVVGFIVTLAALEMAQIILTGGSSLMENISKFLIYSNSYVL
NFIKFGGKRTTAMYFEPAFFALALISIWLSIKQFGIKTPKTDGMILLGIVLSGSFSGVMTFILFYLLEWAFQYLNKNAIR
KKLPLAIISLAVFIVGVVFAFPYIAERIGDLGTEGSSSYYRIIGPLVMVGYSLTNIDGVVRFGSLYEYVASFGIFNGADV
GKTIDNGLYLLIIYFSWFAVLLTGWYMFRVGKMMINAFGNNQNFRVQLWLFTPVSLFFTGSIFSPEYAFLIVCPFILRKA
LNIT