HMM Seed Alignment: TIGR04235

Download Alignment

>gi|85813354|ref|YP_460029.1|/10-632
TKVLDFGLTGMDNYAPDSSLASALKPRPLISNEREHANVVRIDRIEHELVKDRMQEEADRNVLKDDITMFATSLKTIVDF
DNHTEFVLNNLNSSISKAEQSRVKDENFLLAAINENVDAVNDIITNQQALTAAEKADLIMEQVINSARAVAHTSAAVADG
VGVIPIFGPNVASGAKVLSDTAEAIADTTAAIKASQISQQLSTAFSALRTVHEHPNKFIEAAVTTIKTGEDLVPKLKQIV
DRSRRANELTFSRVTVPGSIAHSY-AYVSVLDDYDVLMVYHIKPSTGAYGLKASIGSRRVSYSLHGLFGELDSFGFGPEI
MSSGVVSLPPIGSRQVEFNTVVNADRCRAMLMALQSPGLSLSDEEYVGYFEQYLCRAIEPTNKTVLSALHSAFDSIHSDS
MSNDMHSDHIAMLGHLDTHRQKHKDSLEAEL-PGSSNILVPIGHVSRANSTHTLALKSTFRIGEFRVYDYFIGPFTHSGK
FVIGVVIDSMYVNSNTDNRRFVYSQYSGHEGQRINSVVNSSESPIRLELTLDVRSDL-TIEGVEG---DRAVLRIYGVDL
HSVRIITGPSEGSEAMIQPPMTTSDHKELGFDYGFMRRHIDPKIINNSIDLGYHDWEQYHGNGNWTNIK
>gi|23238158|ref|NP_694472.1|/10-630
NAISALSASGFRGYVPDNSVSSALIPRLVVTNEREHVLAGRLKRIEDNIAKNKLTEHDDIEVVKSDYESLANNFEEQIKF
DNATDRALHDFSTQIKIVDSEREKEMTVLLGAVNDNSQAINDIIKDVTVIDNIEKANLILEKVIAVSRATAKTAEIAADG
VGVVPVFGPSIANGAKIAAHTAEMVANTSEAVKASGILNDLNETFKAITSVHSRPNDLIKSAVKSTNNAVDLAAKLKVMI
DSARRKNDIGLSKISIPSVVVKSTVEWPRVIDAYDTHCIYKLHPTNGSVGLIVEVKNTLISYQVKKQYGKLDSDGFGDTI
ISGGRIVGIAGAKRVVDFHLSVDAAHSLAMVMALQSLSNRLDSTSIVGYFEEYFELGMRVEKPEVDNAFSNHLHDLTVDT
SYIDWHKYETEMLNTHNERKSVLINEVNETLGAGSSVHMVPEGFITLETTPTIIELTPVMKIGAYSVYEHLFGPFVNTGT
YTYNLVVDVI-----GQPTKW-YTQLVDVRGQVVSSSSLDALPTQPVDLVVGTKGSMSTIPGSSGLLVDRRLLRIYVKQP
KCVRVFCGWKSGVSSFRFSPKTMEEQKAFSHEFSRLHRFLDPNA-ALAITEGSHVWEAY-AKGNYNNPI
>gi|169218446|gb|ACA50113.1|/13-627
SQSSIISLTGNDRTVADGTFNSMIMPRAVIANEREHFMKTRIDKIEHDIIRSTKQEMMDRQSLAEDYKALNLAVGQEIKL
DVATQHQLNRLGSAMYKADHERETELTDLINRIRENEITVNGILENQKAITAAERADLLLEIVASTAKSVSAAGRAAADG
SGVVPVFGPSVANGIKVGIDIADSVAEAAIAVKESGIITQLNDVYHAFQSVHVAPNDVIKPASVVAGTSTELIGNLQAIY
SRLRSHSDIGFKKATVGDTIPNSYMVKPVNSTEYASWQLYVIHPVQGSLGLVVQMMGDALTYNVFAQYGTTSASEFGKTV
LTGGATNTALEGTK-VKFQTKVTAQQALALTMALKDAVSMLSQGELIGYFEQYINLALEPDNLSLQDNMHKYHHLLTSQN
SPIDWNYHDEEMHKWLDSRKTTNYEAMKKKDGAVIADIHIPKVFNDLRNTTLHCKLEGRQTIAGYTVYEYLIGPWAHYGD
IDYSVVVDAL-----NEETKW-YCEVIGIDGHLLIEKSIQHKPEKILELTVDDDGVT-LFKGKNH---DRLKLKVYVKDS
LSVKVFRNWI-GINTPRVKTKMFNDHIGVKYDYSHFDKNISPAHLTLT-DLGWHTWDQY-NAGNWTNIK