HMM Seed Alignment: TIGR04319

Download Alignment

>gi|258508587|ref/415-589
ASSASGAANGASDQVASLATANPDNQSLADLSKTASSAAAVASSYAVAASSDAAFAKQAVATVNAANATASSAAAAAKAA
SAAGKTDEATSLAKQAADAAATASQQAPIANSAADKALSEA----NAASSAAEDALNAAKSAATIAGSTSSTAA-AKSNA
SLAA---DTGSKAYDKANLASTV
>gi|366087879|ref/370-540
ANTASTAASSAYAYTSGAASRHPDNKDLADLNSVASAANTKTAGLASAAASDAAGAKGLATSVADANKAVESAVAQVDAA
NKAGNYDAAGSYANEAAKAASNASSLAAKANEQAAKALQEA----NDASDAAKVATDAMNKAKTIAAAAD-----AKDFA
SNAK---KSAEAASDSASQASTD
>gi|258508587|ref/597-775
ASAANDTATSAKAVVDKAASAYPTNESLAKLSATASTATSMTASYAASAFASNSQASDLAGKVKSANDTVISAVAQTNSA
LAAKNLPDATSYATIASSAASLASQLADQTSTAASNALASA----LAASENAKIVTSAASEAAKLSASLGTTTGSTAADS
KNASLAYTAATSASAEANNASAI
>gi|258508587|ref/776-948
AKTASTTASSANVAATGFASSFPDNASLASLAVKVGQAASLTSSFATSASAFASQASDLATRVSDANSQAQEAANKVTSA
ANAGDTAGVALYSGQASTAASNATDLANQTKSAASSAMSYA----LQAKSQAAIASDAATVAAGIAGNLKSA---AAGDA
GVGS---TVARSASVVASTASTV
>gi|258508587|ref/1136-1308
ASTAISVASSANNVTASLTATYPKDPSLTSLSAVASSANSTTAGFAKSAAADAAAASSLAQKVVAANKAASLAASQANSA
IAGGDLQAASSFKAQAVTAASSAADLASQANGLANQASTEA----DQANSTAAIASQAASSAIELAGSLAKA---TSDTA
EKAS---SVATSASVVASAASIT
>gi|258508587|ref/956-1128
ASNASAVALSAKNLTSSAASSFPQDSSLAALSTTASSAQAVASDYAAKASSAAFAASSYAGQTSSANEGAKRAASLANEA
LAAGQNDAAAKFGSQAKDAGSLASSLADNANAAASLAQSEA----LQAKSAADEASKAALSAQGRVATLTSD---TTKET
SAAS---DKASAASVAAKSASTV
>gi|258508587|ref/1316-1495
AVAASNKAKSAGDVAASVATRFPKDQSVASLATAAGNAVSLASSYAAGAIEDASLASSYATAASQANGVASETASLANSA
YVNGNISEASSYAASASKAATEASSAADKGKNAATKALSEAYAASSAANDAASIAVAASTAASSLASSITSGNTAASDKA
SAAS---DAARSASVVASTASVK
>gi|258508587|ref/1503-1669
ASTASSVAASGYQDASNIATRYPGNPSLTSLATVASSANSETADLAKSASSDASAASSYAAIASAANSKAASAASRANTA
LDVGDLSNASSLADQASIAGVTASSAADKANSAADQALNEA----NLASEKAKVAVSAAATARDVA---------SKADA
SATA---YTASSATAIANNASAI
>gi|258508587|ref/1670-1845
ASNASSVADSAYQEASAKASNYPSNNSLASLAKAASDANSVAASYALTASADASAASSFADQVSSANATAKTAAAQATAA
SQRGDHTAAQNLNNQASAAADIASEYADKANDAAGKALSEA----NKADSAASQAVSANNRAKQIADTVSAANDQASSKA
SQAS---ESALSASVVAQEASAT
>gi|258508587|ref/1853-2028
ASAASDTAKSENAIASSAASRFPGNDSLASLAKTANDATIQASSYATQASAAAGSAVSLAKVTSSANLAASKAASQANSA
IVAGNMSQASTFANQASNFAKIASSAADAASSTADDAMSAA----LQAKGQAAIASSVADDSKRLAGNIATQGDRLVSDA
TKAA---DRAKASGDIAESAAVK