HMM Seed Alignment: TIGR04420

Download Alignment

>ORF00074|gls454176/1-246
MKKISVLILIFLFLGNLALFSQDGEEIDFLEKVTEPKKTVSKKSSNTAG---TSSGTSTPKKKEKKRS-KKKRSKKSSSS
LPNNLEETQKKNINHNETS------------SGNDHSNLNGGNSGSSNTLESGNVDEQRTSA-SKID-LKDLPKPYWVNE
EVKIHPNNLPGYTVS--QKSEQGSSFGSELSEILKLGEDKKKEENKK---KVQEVQKSGSFTGFLSEYKKPIIIIVFILL
FALYRLKAGKSRGSSSRKSPVTINKMRRD
>ORF00098|gls454086/1-255
MKKAAVSILIFLFLGNLSLFSQDGEEIDFLEKVSEPKKKTVSKKSSNSG---SSNGSKISKKKEKRKF-KKKKSKKFST-
VPTNPENS-KKNTEPDNNEGNSSGNNTSNDSQNNGSNSSNNISNSNAQ---SGNIDAQPLANASKTD-LKELPKPYWVNE
EMKVRPNNLPGYSVE-SETSEQGASFRNSLSEILKLGEDKKKEEEKK---KVQGGQKSGSFAGFLSEYKKPIIIVVFILL
FALYRLKAGKSRGNSSRRSPVTINKMRRD
>ORF00295|gls454178/1-238
MNKILCLLLSISL--ALPIFGQDGEEIDFLDKVSEPKKTTTSSKKTPLA--------KASRKKKVKKN-AGKKKKVVESK
ETEQKESETKKKVDPEIAP----------EDPTQGKNSGDPNGNGQTETTERNLNKEV-----SNPEVTAEIQKPYWLNE
ETNLSPRNLPGYDATASSLPKEDISIREKLGEILKLGDDKKKEEEKR---KAAEQKEQGAIAGFFSEHKKAIIIIAIILA
FALYQFRAKGAR--VTRRSPVTINKVRRD
>ORF03171|gls454061/1-238
MKKILCLLISFAL--TFSLFSQDGEEIDFLDKVSEPKKSSTASKQGTNA-------KTVKKKKGKKGA-KKKKGIEAKKE
ELAPKDGEPKKKIETDIPP----------EDPDQGKNSGDP--SGSEKALEKTSARDLS----ANTDSTGEPQKPYWLNE
ETRLTPNHLPGYDASATAAPQEDHSIREKLGEILKIGQDKKKEEEKR---KAAEQKDQGVILGFFSEYKKGIIILTIVVA
FALYQIRTAGRR--TTKRSPVTINKVRRD
>ORF00906|gls454050/1-237
MNKILCLLLSFLI--SFPVFSQDGEEIDFLDKVGEPKKATTSASKKAQA-------AKVPKKKKSKKGSKKRKSSEVRQD
GVEQKEGETKKKVEATGIP-------------DDAKNDSHPGDDGHSKNSENASSEKA-----LKKEEPGDLQKPYWVNE
ETALTPRHLPGYAETSAALPKEDISFKDKLGDILKMGQDKKKEEEKR---KAAEQKDQSTIVSFFSEYKKPIIILGLIVL
FALYRLRAGGPR--ITRRSPVTINKVRRD
>ORF01911|gls454195/1-211
MKRLFFISLIFCF--SASLFAQEG--LDFLDKVNDKPKSTTTKPKEETVTPTTKKQTNVVTTAVTTTG-KKKRSKKKSKQ
NQLVTTETLPQNTNLAANP------------------------NTNTTVTDKSFPGLEKQP--TVLEEEEVVHNGLWMDS
NVSVEPSGLPGFSAD------------------LKIGKTEGSKSEVSFSPNKETGKSLFNFSDFFAKYKKAMMILGIIIL
FAFYRLRSARPG--SSSRS------YRR-
>ORF03242|gls454202/1-209
MKSFFSILIFLGL--TTSLFSQEG--LDFLDKVNDKPKTTT-KPKEDTVQTTTKKQSGVVTTTGVTSG-KKKKSKKKSKQ
NQLATENL-PQNNNLVANP------------------------NGNPVVTEKTLVPGEKQP--AVLEEEEVVSNAYWMDS
QVSVEPTGLPGFSSD------------------LKLAKSEVSNSTSESSVNKDSGKSFFNVSDFFAKYKKAMMILGIIIL
FAFYRLRSARPG--SSSRS------YRR-